塘养三疣梭子蟹中弧菌的群落结构分析【开题报告+文献综述+毕业设计】

塘养三疣梭子蟹中弧菌的群落结构分析【开题报告+文献综述+毕业设计】

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1、本科毕业论文系列开题报告食品质量与安全塘养三疣梭子蟹弧菌的群落结构分析一、选题的背景与意义1.三疣梭子蟹(Portunustrituberculatus)养殖规模的日益扩大、集约化程度的逐步提高和养殖环境的污染等导致了三疣梭子蟹免疫防御系统抗病力下降,对病害的易感性增加,越来越多的养殖环境遭到了严重破环。2.弧菌病(Vibriosis)作为弧菌所引起一种细菌性疾病,是最早发现的鱼类细菌性疾病之一,现已成为海水养殖动物主要细菌性病害之一,对养殖业的危害严重,常常造成极大的经济损失。因此,该类疾病的弧菌也一直备受国内外

2、研究工作者的关注,是海水养殖动物病害的主要研究领域之一。3.分子生物学技术和基因组学的不断成熟和广泛应用,为微生物生态学的发展提供了新的研究方法。二、研究的基本内容与拟解决的主要问题1.从弧菌的菌落计数出发,通过菌落特征的观察和16SrDNA基因序列比对,对三疣梭子蟹养殖塘健康蟹和病害蟹中弧菌群落结构变化进行比较研究,并进行了系统发育学分析,以期揭示其种群组成与弧菌病的关系。2.找出三疣梭子蟹的发病与养殖塘水体中弧菌数量的关系,以及与蟹体内的弧菌菌落结构的相关性。3.了解塘养三疣梭子蟹中弧菌的多样性,对发展健康养殖

3、业具有重要的意义。三、研究的方法与技术路线:1.基于传统的微生物培养方法与现代分子生物学(PCR-DGGE)、生物信息学的结合,对养殖塘三疣梭子蟹弧菌群落结构进行研究。2.技术路线:三疣梭子蟹样品采集弧菌的分离培养弧菌菌落计数依据菌落、菌体形态进行初步归类弧菌基因组DNA的提取PCR-DGGE筛选出不同发育型测序对养殖塘三疣梭子蟹中弧菌群落结构进行分析论文撰写四、总体的安排与进度:1.2009年7月-10月三疣梭子蟹样品采集,查询与论文有关的资料、撰写试验计划熟悉基本的实验操作;2.2009年7月-2010年6月蟹

4、体中弧菌的分离培养,弧菌菌落计数,根据菌落、菌体形态将弧菌进行初步归类,弧菌的保存,弧菌基因组DNA的提取;3.2010年9月PCR-DGGE筛选出不同发育型,测序并进行系统发育学分析和对养殖塘三疣梭子蟹中弧菌群落结构进行初步分析,获得初步结果;4.2010年10月实验数据的整理分析以及对整个试验的补充、完善阶段;5.预期于2010年12月底完成毕业论文的撰写。五、主要参考文献:[1]RasmussenLD,EkelundF,HansenLH,etal.Group-SpecificPCRPrimerstoAmpli

5、fy24Sa-SubunitrRNAGenesfromKinetoplastida(Protozoa)UsedinDenaturingGradientGelElectrophoresis[J].MicrobEco.2001,42:109-115.[2]常建波,常向红,孙逢贤,等.养殖牙鲆弧菌病病原菌初步研究[J].海洋水产研究,2001,22(1):37-41.[1]张朝霞,王军,张蕉南,等.东山九孔鲍细菌性疾病研究[J].台湾海峡.2001,20(2):193-200.[2]沈亚林,于业绍.副溶血弧菌对文蛤致病性

6、及其防治[J].水产学报.1993,17(3):249-452.[3]HoltJG.Bergey’sManualofDeteminativeBacteriology[J].9thed,Williams&Wilkins,1994:190-194.[4]李亚晨,包永明,吕建发,等.海洋水产动物弧菌病的生物防治[J].水产科学,2004,23(2):35-38.[5]BergmanAM.DieroteBeulen-KrankheitdesAal[J].BerboilVersuchssta,1909(2):10-54[6]

7、倪纯治,林燕顺等.海水养虾池的几种致病弧菌生态[J].台湾海峡.1995,14(1):73-79.[7]Aguirre-Guzman,HumbertoMejiaRuiz,FelipeAscencio.AreviewofextracellularvirulenceproductofVibriospeciesimportantindiseasesofcultivatedshrimp[J].AquacultureResearch.2004,35:1395-1404.[8]王国良,金珊,陈寅儿,李政.三疣梭子蟹肌肉乳化病的

8、病原及其致病性研究[J].海洋科学进展.2006,24(4):526-531.[9]陈萍,李吉涛,李健,刘淇,刘萍.溶藻弧菌对三疣梭子蟹抗氧化酶系统的影响[J].海洋科学.2009,33(5):59-63.[10]REESONAF,JANKOVICT,KASPERML,etal.Applicationof16SrDNADGGEtoexaminethemicr

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