利用软件Primer Premier 5．0进行PCR引物设计的

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1、锦州压学院学报2004DecJJinzhouMedCollege-uu。㈨．‘．’25(6)43www.bbioo.com利用软件PrimerPremier5．0进行PCR引物设计的研究任亮，朱宝芹，张轶博，王海燕，李尘远，苏玉虹，巴彩凤(锦州医学院辽宁省高校分子细胞生物学与新药开发重点实验室，辽宁锦州121001)【摘要】目的运用PrimerPremier5．0软件设计PCR引物，并且检验所设计引物的PCR扩增效率和特异性。方法运用PrimerPremier5．0软件设计l6对猪和犬的PCR扩增引物，通过PCR扩增后进行琼脂糖凝胶电泳检测实验结果。结果在所

2、设计的l6对引物中有8对PCR扩增特异性好且效率高，成功率50％。但是，其中早期设计引物l2对只有4对成功，后期设计引物4对全部成功。结论从引物设计的过程中可以看到一种趋势一后期引物设计的成功率远远高于早期。这表明我们在引物设计方面正在逐步成熟，特别是运用比较基因组学定位的原理在分离新基因的引物设计方面积累了较多的经验。【关键词】PCR引物设计；软件PrimerPremier5．0；PCR【中图分类号】Q524【文献标识码】A【文章编号】i000—5161(2004)06—0043—04TheResearchofApplyingPrimerPremier5．

3、0toDesignPCRPrimerRENLiang，ZHUBao—qin，ZHANGYi—bo，WANGHai—yan，LIChen—yuan，SUYu—hong，BACai—feng(KeyLaboratoryofMolecularCellBiologyandNewDrugofLiaoningProvince，JinzhouMedicalCollege，Jinzhou121001China)【Abstract】ObjectiveWiththehelpofPrimerPremier5．0todesignPCRprimerandverifyingtheeff

4、iciencyandspecialityofPCRabouttheseprimers．MethodsSixteenpairsofprimersthatwouldbeamplifiedinGenomicsofpiganddogweredesignedbyPrimerPremier5．0．TheresultsofPCRwouldbeinvestigatedthroughagarosegelelectrophoresis．ResultsEightpairsofprimersinalldesignedSUEceededintheefficiencyandspecia

5、lityofPCR，theratioofSUCCESSWaS50percent．Thetwelyepairsofprimerswhatweredesignedintheforepartoftheexperimentwereonlyfourtoamplifybetter．How．ever，thefourpairsofprimersdesignedintheanaphaseallsucceeded．ConclusionsThereisatrendthatearlberecognizedintheprocessofdesigningprimer．Namely，th

6、eforepartisfarmorethantheanaphaseintheratioofSUCCESStodesignprimer．Itisindicatedthatourtechnologytodesignprimerisfurtherprofessiona1．Moreover，themostimportantisthatthetechniquerouteofusingthecompara—tivegenomicstoisolatenewgeneisfarthercomprehendedandperfectedandplacingadirectionat

7、nextexperiment．【Keywords】designprimer；PrimerPremier5．0；PCR自从1985年美国PE—Cetus公司的人类遗传反应(polymerasechainreaction；PCR)以来，PCR研究室Mullis等发明了具有划时代意义的聚合酶链已经成为了分子生物学领域最基本也是最重要的技【基金项目]辽宁省科技厅博士启动基金(20021072)【作者简介】任亮(1978一)，男，辽宁省葫芦岛市人，在读硕士研究生，主要研究方向为分子生物学。锦州医学院学报2004年l2月，25(6)术手段之一。然而找到一对合适的核苷酸片

8、段作为供。PCR引物设计软件PrimerPremie