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时间:2019-11-24
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1、第三代BiFC(目的基因可以连接到YFPN/C上游或下游)l在YFPN和YFPC的5’和3’端都有多克隆位点MCS(1,2,3),可根据需要把目的基因装在适合的位置。如果目的基因的结合域在靠近N端,可优先考虑接在YFP的5’端;如果目的基因的结合域在靠近C端,可优先考虑接在YFP的3’端。l使用两组不可逆重组LoxP突变位点(LoxP1L/1R、Lox2L/2R)把2个表达盒整合在一个质粒(LoxP1L只能与LoxP1R不可逆重组;LoxP2L只能与LoxP2R不可逆重组),可以大大提高2个表达盒的
2、共转化效率。l在NOS终止子末端EcoRI位点旁增加I-SceI位点。NE1L2L-nsI:MCSTCTAGAGTTAACCGGGCTCAGGCCTGGCGCGCCACTAGTGGATCCATCGATAGTMCS1XbaIHpaIStuIAscISpeIBamHIClaIACTGTCGACCTCGAGGGTACCGCTCCCGGGATGGAGCAAAAGTTGATTTCTGAGSalIXhoIKpnI/Acc65IXmaI/SmaIMCS2GAGGATCTTATG-YFPN-GCCGCGGATGCT
3、AGCGGCCGCAAGATCTGGCCGGCCTGGSacIINheINotIBglIIFseIApaIGCCCACCGGTAAAgeICE1RL2R-nsI:MCSMCS1TCTAGAGTTAACCGGGCTCAGGCCTGGCGCGCCACTAGTGGATCCATCGATAGTXbaIHpaIStuIAscISpeIBamHIClaIACTGTCGACCTCGAGGGTACCGCTCCCGGGATG-YFPC-AAGGCTAGCAAGATCTGGMCS3SalIXhoIKpnI/Acc65IX
4、maI/SmaINheIBglIICCGGCCTGGGCCCACCGGTAAFseIApaIAgeI3操作流程NE1L2L-nsICE1R2R-nsI将2种质粒等量混合,稀释成约10ng/ul,取1ul转化E.coliNS3529(表达Cre酶),Amp(50ug/ml)/Kam(25ug/ml)双抗平板筛选,37℃培养>20h。或在平板培养~12h后(下午/晚上至第二天上午)混收少量菌接种到Amp(50ug/ml)/Kam(25ug/ml)-LB液体培养基成OD约0.5,再培养6-8h(到傍晚)。
5、从平板混收菌,提取质粒,稀释成~0.1ng/ul(过高浓度容易出现不同质粒的共转化,因此要避免高浓度质粒转化),取1ul转化E.coliDH10B(或NS3529以外的其它菌株),Amp/Kam双抗筛选。取单菌落培养,提取和纯化质粒在(洋葱)细胞瞬间表达用EcoRI或I-SceI切出整个表达盒,连接到pCAMBIA1300或pCAMBIA1300(I-SceI)农杆菌转化植物,恒定表达3{注:I-SceI位点是17-base非回文序列,切割产生的粘性末端也是非回文;在pCAMBIA1300的MCS中
6、加入了2个方向相反的I-SceI位点,酶切后载体的2个末端不能自连,因此不需要脱磷反应}NE-1L2Lns:加I-SceI位点TCGCGCGTTTCGGTGATGACGGTGAAAACCTCTGACACATGCAGCTCCCGGAGACGGTCACAGCTTGTCTGTAAGCGGATGCCGGGAGCAGACAAGCCCGTCAGGGCGCGTCAGCGGGTGTTGGCGGGTGTCGGGGCTGGCTTAACTATGCGGCATCAGAGCAGATTGTACTGAGAGTGCACCATATGC
7、GGTGTGAAATACCGCACAGATGCGTAAGGAGAAAATACCGCATCAGGCGCCATTCGCCATTCAGGCTGCGCAACTGTTGGGAAGGGCGATCGGTGCGGGCCTCTTCGCTATTACGCCEcoRIAGCTGGCGAAAGGGGGATGTGCTGCAAGGCGATTAAGTTGGGTAACGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGACGTTGTAAAACGACGGCCAGTGAATTCATTACCCTGTTATCCCTACCGATCTAGTAACATAG
8、ATGACACCGCGCGCGATAATTTATCCTAGTTTGCGCGCTATATTTTGTTTTCTATCGCGTATTAAATGTATAATTGCGGGACTCTAATCATAAAAACCCATCTCATAAATAACGTCATGCATTACATGTTAATTATTACATGCTTAACGTAATTCAACAGAAATTATATGATAATCATCGCAAGACCGGCAACAGGATTCAATCTTAAGAAACTTTATTGCCAAATGTTTGAACGA
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