多媒体技术在《结构化学》课程中的应用 - 南开大学结构化学

《多媒体技术在《结构化学》课程中的应用 - 南开大学结构化学》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在行业资料-天天文库。

1、多媒体技术在《结构化学》课程中的应用孙宏伟sunhw@nankai.edu.cnhttp://struchem.nankai.edu.cn南开大学化学学院Part1《结构化学》多媒体的使用Part2《结构化学》多媒体的制作Part3《结构化学》多媒体素材制作Part1《结构化学》课程中多媒体的使用§1《结构化学》讲授难点基本概念多，涉及课程基础多电子结构部分有大量相对比较抽象的理论概念和问题，同学们不易理解空间结构部分要在有限的课时中使同学们熟悉大量分子和晶体的三维结构，不易建立空间概念，不易掌握课时与内容的矛盾§2《结构》课堂使用多媒体优点图示和

2、背景知识→抽象概念的理解标准函数图和3D插件→波函数性质动画、交互插件→分子、晶体结构减少板书，增加讲解时间→课时少§3南开多媒体使用的历程2001年前，全部板书，空间部分带模型2002年，开始使用多媒体教学氢原子波函数电子云图（图片，Origin,Surfer）分子对称性(Symapps)晶体结构(WebLabViewer)2003年，部分使用多媒体教学OrbitalViewerSymappsWebLabViewer2004年多媒体2/3PovRay2005年多媒体90%PovRayCorelDraw2006年全部采用多媒体，规范格式增加动画200

3、7年~现在逐年修改，更改为9章VRML§4演示空间结构的两个利器Symapps6.0DiscoveryStudioViewerLite5.0Symapps6.0集成在ChemWindows6.0中安装文件：17M显示分子3D结构(效果并不好)内置MM2力场，可将2D结构转为3D模型计算分子点群，显示对称元素支持链接文件类型直接打开Symapps6.0支持输入文件格式.hinHyperChem.ent.pdbPDB.molMDL.mop.mpcMopac.smaSymapps支持输出文件格式.xyz.pdb.smaSymapps6.0简单应用示例在Ch

4、emWindows绘制环己烷选择工具选择环己烷Other菜单选择SymappsSymapps6.0单击计算3D结构按钮得到优化后的环己烷选择球棍模型按钮显示球棍模型单击计算点群按钮出现参数对话框，选OK，给出计算点群结果双击点群，显示对称元素Symapps6.0鼠标在3D工具栏拖动，可将分子进行旋转、平移、放大或缩小选择对称元素按钮，可选择性地选择显示某种对称元素保存为.sma格式Symapps6.0Symapps6.0提供了44个Sample文件涉及以下点群：C2C2hC2vC3vC4vCiCsD2dD2hD3D3dD3hD4hD5hD5dD6hS

5、4TdOhIhC:ProgramFiles(x86)Bio-RadLaboratoriesSymAppsSamples扭曲烷(twistane)三乙二胺合钴离子Symapps课件应用实例使用超链接打开Symapps可观察Dn群中C2轴位置Symapps课件应用实例Td群正四面体构型的分子全部对称元素：4C3,3S4,6Symapps新版本KnowItAll优点：显示改进输出视频动画(对称操作)缺点：无法使用链接KnowItAll8.3安装文件：93MAcademicEditionFREE注册激活http://www.knowitall.co

6、m/academic/default.aspViewerLite5.0安装文件小5.7M高水准分子显示功能对晶体、蛋白质核酸有特殊显示功能支持输入文件格式多可直接输出较高水平的图片支持输出专业3D渲染软件POVRAY支持链接文件类型直接打开ViewerLite5.0支持输入文件格式.msv(Viewerbinaryfileformat.pdb.ent(BrookhavenProteinDataBank).mol.sdf.sd.mdl(MolecularDesign,Ltd.[MDL]).car(Accelrys,InsightII).csd.fdat

7、.dat(CambridgeStructuralDatabaseCrystallographicfiles).mol2(Tripos),msf(Accelrys,QUANTA).msi(Accelrys,Cerius2).cpd(Accelrys,Catalyst).chm(Accelrys,CatalystQuery).cif(CrystallographicInformationFile).xyz(generic).skc(MDL,ISIS).grd(Accelrys,InsightIIGridFile).wvc(ViewerCommandFil

8、e)ViewerLite5.0ViewerLite5.0ViewerLite5.0简单应用示例1分子结构显示