2植物组织DNA的提取和鉴定

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1、拟南芥T-DNA插入突变体的鉴定实验目的1.通过实验学习并掌握用CTAB來提取DNA的方法。2.了解CTAB的成分及作用。3.学习PCR的原理并掌握其方法。4.学习琼脂糖凝胶电泳的原理与方法。实验原理植物组织屮绝大部分是核DMA,它和组蛋白、非组蛋白结合在一起,以核蛋£1(即染色质或染色体)的形式存在于细胞核内。CTAB(十六烷基三甲基溟化钱,简称CTAB):是一种阳离子去污剂,可溶解细胞膜,它能与核酸形成复合物,在高盐溶液中(0.7mol/LN&C1)是可溶的,当降低溶液盐的浓度到一定程度(0.3mol/LNaCl)时从溶液

2、中沉淀,通过离心就口J将CTAB与核酸的复合物同蛋白、多糖类物质分开,然后将CTAB与核酸的复合物沉淀溶解于高盐溶液屮,再加入乙醇使核酸沉淀,CTAB能溶解于乙醇中。DNA是遗传信息的载体和基本遗传物质,它在遗传变异、代谢调控等方而起着重要作用,是分子生物学和基因工程研究的对象,但无论是研究植物DNA的结构和功能,还是开展外源DNA的转化、转导的研究,首先要做的就是从植物组织中提取天然状态的高分子量的纯化DNAoT-DNA,转移DNA(transferredDNA),是根瘤农杆菌Ti质粒中的一段DNA序列,可以从农杆菌中转移并

3、稳定整合到植物基因组。人们将目的基因插入到经过改造的T-DNA区,借助农杆菌的感染实现外源基因向植物细胞的转移与整合,获得转基因植株。除用于转基因以外,T-DNA插入到植物的基因中可引起基因的失活,从而产生基因敲除突变体;T-DNA大多为单拷贝插入,使其利于进行遗传分析。PCR基本原理:聚合酶链式反应(PolymeraseChainReaction),简称PCR,是一种分子生物学技术,用于在体外快速扩增DNA,具有类似细胞内DNA的复制过程:由一对引物介导,通过温度的调节,使双链DNA变性为单链DNA、单链DNA能与引物复性(

4、退火)成为引物-DW单链复合物、以及在dNTPs存在下DNA聚合酶能使引物沿单-链模板延伸成为双链DNA(引物的延伸);这种热变性-复性-延伸的过程,就是一个PCR循环;一般通过20-30个循环之后,就可获得大量的要扩增的DNA片段。琼脂糖凝胶电泳:琼脂糖凝胶电泳是分离、纯化、鉴定DNA片断的典型方法,其特点为简便、快速。DNA片断琼脂糖凝胶电泳的原理与蛋白质的电泳原理基木相同,DNA分子在高于其等电点的PH溶液中带负电荷,在电场中向正极移动。DNA分子在电场屮通过介质而泳动,除电荷效应外,凝胶介质还冇分子筛效应,与分了大小

5、及构想有关。对于线形DNA分了,其电场中的迁移率与其分了量的对数值成反比。在凝胶中加入少量澳化乙锭(冇毒!),其分子可插入DNA的碱基之间,形成一种光络合物,在254~365nm波长紫外光照射下,呈现桔红色的荧光,因此可对分离的DMA进行检测。电泳时以混酚蓝及二卬苯氤(蓝)作为双色电泳指示剂。其目的有:①增大样品密度,确保DNA均匀进入样品孔内;②使样品呈现颜色,了解样品泳动情况,使操作更为便利;③以0.5XTBE做电泳液时澳酚蓝的泳动率约与长700bp的双链DNA相同,二甲苯氧(蓝)则与2Kbp的DNA相同。T-DNA插入突

6、变体PCR鉴定图解:BPosBPos「DNA「DNABPBPGenomeT-DNA插入突变体的引物位点PCR电泳图验仪器材料和试剂实验材料:拟南芥叶片实验仪器:电热恒温水浴锅;离心机;液氮罐;研钵;离心管;移液管;稳压稳流电泳仪;可调微量移液器;水平电泳槽;暗箱紫外透射仪。实验试剂:CTAB分离缓冲液;氯仿/异戊醇;无水乙醇;70%乙醇溶液;NaAc;TE缓冲液;电泳缓冲液;加样缓冲液;溟化乙锭(EB)溶液;琼脂糖凝胶(浓度为1.2%)o实验步骤(1).植物DNA的提取1.取CTAB分离缓冲液加入离心试管中,于65°C水浴预热

7、;2.取2-3片新鲜叶片于离心管,加入液氮研濟细粉末;3•加入600ul预热的CTAB分离液,轻轻转动,混匀,65°C水浴保温45min;4.12000rpm离心10min;5.将上清液转移到新离心管,加入等体积的氯仿/异戊醇,轻轻摇动,混匀;6.12000rpm离心5-10min,将上清液转移到新离心管;7.向上清屮加入1/10体积3MNaAc,再加入两倍体积预冷的无水乙醇,轻轻混匀,冰上放置lOmin;4.12000rpm离心lOmin,弃上清,加入500ul70%乙醇溶液洗涤2min;5.12000rpm离心5min,弃

8、上清吸干残留并干燥;6.加40U1TE缓冲液溶解DNAo⑵.PCR反应按照下表装填反应体系:反应物用量(ul)H.012.310XBuffer2.0dNTPs0.5MgCl22.0LP/BP0.5RP0.5Taq聚合酶0.2DNA2.0总计20.0调节PCR仪,使其按照94°

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