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1、重楼属药用植物DNA条形码鉴定研究朱英杰1,2,陈士林2,姚辉2爲谭睿1*,宋经元2,罗焜3,鲁静4(1.西南交通大学生命科学与工程学院，四川成都610031;2.中国医学科学院、北京协和医学院药用植物研究所，北京100193;3.湖北中医学院药学院，湖北武汉430061;4.中国药品生物制品检定所，北京100050)摘要：为评价DNA条形码候选序列对重楼属药用植物的鉴定作用，探讨重楼属药用植物鉴定新方法，本研究对重楼属11个物种17份样品的psbA-tniH.rpoB、rpoCl、rbcL.matK和核ITS2序列进行PCR扩增和测序,比较各序列扩增和测序效率、种内和种间变异,进行ba
2、rcodinggap分析,采用BLAST1和NearestDistance方法评价不同序列的鉴定能力。结果显示,ITS2序列在所研究的重楼属药用植物中的扩増和测序效率均为100%,M种内种间变异、barcodinggap与其他DNA条形码候选序列和比具冇明显的优势,ITS2序列在重楼屈I啲鉴定成功率达到100%,而牛物条形码协会(CBOL)植物工作组推荐的matK和rbcL序列的鉴定成功率分别为52.9%利5.9%,二者联合鉴定能力没冇捉高，对于ITS2序列扩大至29个物种67份样品依然具冇100%的鉴定成功率。实验结果表明,ITS2序列能够准确鉴定重楼属药用植物，可以作为潜在的药用植物
3、通用条形码序列。关键词：重楼屈;DNA条形码;ITS2;药用植物；鉴定中图分类号:R931.5文献标识码:A文章编号:0513-4870(2010)03-0376-07DNAbarcodingthemedicinalplantsofthegenusParisZHUYing-jiei.2,CHENShi-linz,YAOHui2%TANRuir,SONGJing-yuanz,LUOKuns,LUJing4(/.SchoolofBioscienceandEngineeringSouthwestJiaoton^University,Chengdu610031,China;2.Institute
4、ofMedicinalPlantDevelopment,ChineseAcademyofMedicalSciences&PekingUnionMedicalCollege,Beijing100193,China:3.SchoolofPharmacy,HubeiUniversityofChineseMedicine,Wuhan430061,China;4.NationalInstitutefortheControlofPharmaceuticalandBiologicalProducts,Beijing100050,China)Abstract:DNAbarcodingisatechniq
5、ueinwhichspeciesidentificationanddiscoveryareperformedbyusingshortandstandardfragmentsofDNAsequences・Inthisstudy,elevenspeciesofParis,includingsevenvarieties,weresampled.Fivechloroplastsequences,psbA-trnH.rpoB,rpoCl,rbcL,matK,andonenuclearmarker,thesecondinternaltranscribedspacer(ITS2)ofribosomal
6、DNA,wereamplifiedandsequenced.ThePCRamplificationandsequencingefficiency,intra-andintcr-spccificdivergenceandbarcodinggapwereusedtoevaluatedifferentloci,andtheidentificationefficiencywasassessedusingBLAST1andNearestDistancemethods.TheITS2sequencesinthestudiedsamplesofPariswereamplifiedandsequence
7、dsuccessfullyusingprimersdesignedbyourgroup,whilematKshowedlowlevelintheamplificationandpsbA-frnHwasdifficultforsequencingbecauseofover800bpandpoly(A)structure・Analysisoftheintra-andinter-specificdivergenceandbarcoding
