泡桐属dna条形码的筛选与鉴定研究

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1、分类号S718.46密级公开UDC学位论文泡桐属DNA条形码的筛选与鉴定研究EvaluatingtheFeasibilityofCandidateDNABarcodesforGenusPaulownia莫文娟指导教师姓名李芳东研究员申请学位级别博士专业名称森林培育研究方向林木遗传育种论文提交日期2015年5月论文答辩日期2015年6月学位授予日期2015年7月答辩委员会主席评阅人北京·中国林业科学研究院学位论文泡桐属DNA条形码的筛选与鉴定研究学位论文作者莫文娟指导教师姓名李芳东研究员指导小组成员卢孟柱研究员袁德义教授申请学位级别博士

2、专业名称森林培育研究方向林木遗传育种论文答辩日期2015年6月中国·北京DissertationfortheDegreeEvaluatingtheFeasibilityofCandidateDNABarcodesforGenusPaulowniaCandidate:MOWenjuanSupervisor:LIFangdongAssociateSupervisor:LUMengzhuYUANDeyiAcademicDegreeAppliedfor:DoctoralDegreeSpeciality:SilvicultureDateofDe

3、fence:June,2015Degree-conferring-institution:ChineseAcademyofForestry独创性声明本人声明所呈交的学位论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研巧成果。尽我所知，除了文中特别加臥标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研巧成果，也不包含为获得本研巧生培养单位或其它教育机构的学位或证书一而使用过的材料。与我同工作的同志对本研究所做的任何贡献均己在论文中作了明确的说明并表示谢意。：学位论文作者签名：复交頭曰期Ｊ啦年＾月立争曰

4、学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解中国林业科学研究院有关保留、使用学位论文的规定，中国林业科学研究院有权保留并向国家有关部口或机构送巧论文的复印件和磁盘，允许论文被查阅和借阅。本人授权中国林业科学研巧院可将学位论文的全部或部分内容编入、。有关数据库进行检索，可Ｗ采用影印缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文（保密的学位论文在解密后适用本授权书）学位论文作者签名：ｔ文讀导师签名克化年占月與曰年月曰学位论文作者毕业联系方式工作单位：联系电话：电子邮件：通讯地址、邮编：摘要

5、泡桐属（Paulownia）是玄参科（Scrophulariaceae）中的一个属，树种为乔木。泡桐是原产于中国的重要速生用材树种和绿化树种之一，发展泡桐生产在国民经济中有重要价值。目前泡桐存在优良基因资源容易流失，有些种群数量较少的野生资源的极具减少，商品用材品种混乱，用材品质不一等严重问题，需要得到准确的鉴定，DNA条形码技术是当下较好的解决途径之一。DNA条形码（DNAbarcoding）技术是一种基于DNA分子进化原理，利用标准DNA片段和现代分子系统学的原理和方法对“传统物种”进行快速、准确和自动化的身份鉴定的最新生物学技术

6、。DNA条形码类似于超市里不同的商品对应的可扫描条形码。本研究以泡桐属为研究对象，利用DNA条形码技术，解决泡桐属密切相关种的鉴定问题，对于泡桐属植物近缘种鉴定、优良用材亲本选择具有较高参考价值。同时筛选和建立泡桐属DNA条形码，以期为构建泡桐属植物的可视数字化的数据库奠定基础。本研究选取叶绿体、核基因、线粒体基因上的rps16、TrnK、rps2、rbcL、ITS2、ETS、nad1intron2DNA片段总计8个，提取泡桐属12种2变种共51份材料的DNA，进行PCR扩增及其产物直接测序，通过扩增效率和测序成功效率，用以研究DNA

7、条形码片段在泡桐属中的通用性，同时分析其序列特征；本研究重点筛选了5个DNA条形码候选序列rps16、TrnK、ITS2、ETS，TrnL-F，用于泡桐属DNA条形码的分析和鉴定研究。研究结果如下：（1）8个DNA条形码片段在泡桐属中的通用性分析：PCR扩增效率和测序成功率是评价DNA条形码序列的2个重要指标。rps16、TrnK、trnL-F、rps2、rbcL、nad1intron2、ITS2、ETS8个DNA片段的PCR扩增效率为100%，测序成功率为69.8%～100%。发现各DNA片段在泡桐属中均显示出较好的通用性，故可将其

8、作为泡桐属DNA条形码候选序列开展进一步实验。（2）DNA条形码序列特征分析：8个DNA片段的全序列比对排列后的长度分别为239bp～1828bp；总变异位点数分别为2～84个，其中碱基替换位点数分别为2～83个。GC含