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《重楼属药用植物dna条形码鉴定研究_朱英杰》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在教育资源-天天文库。
1、·376·药学学报ActaPharmaceuticaSinica2010,45(3):376−382重楼属药用植物DNA条形码鉴定研究1,222*1*234朱英杰,陈士林,姚辉,谭睿,宋经元,罗焜,鲁静(1.西南交通大学生命科学与工程学院,四川成都610031;2.中国医学科学院、北京协和医学院药用植物研究所,北京100193;3.湖北中医学院药学院,湖北武汉430061;4.中国药品生物制品检定所,北京100050)摘要:为评价DNA条形码候选序列对重楼属药用植物的鉴定作用,探讨重楼属药用植物鉴定新方法,本研究对重楼属11个物种17份样品的psbA-trnH、rpoB、rpoC1、
2、rbcL、matK和核ITS2序列进行PCR扩增和测序,比较各序列扩增和测序效率、种内和种间变异,进行barcodinggap分析,采用BLAST1和NearestDistance方法评价不同序列的鉴定能力。结果显示,ITS2序列在所研究的重楼属药用植物中的扩增和测序效率均为100%,其种内种间变异、barcodinggap与其他DNA条形码候选序列相比具有明显的优势,ITS2序列在重楼属中的鉴定成功率达到100%,而生物条形码协会(CBOL)植物工作组推荐的matK和rbcL序列的鉴定成功率分别为52.9%和5.9%,二者联合鉴定能力没有提高,对于ITS2序列扩大至29个物种67份
3、样品依然具有100%的鉴定成功率。实验结果表明,ITS2序列能够准确鉴定重楼属药用植物,可以作为潜在的药用植物通用条形码序列。关键词:重楼属;DNA条形码;ITS2;药用植物;鉴定中图分类号:R931.5文献标识码:A文章编号:0513-4870(2010)03-0376-07DNAbarcodingthemedicinalplantsofthegenusParis1,222*1*234ZHUYing-jie,CHENShi-lin,YAOHui,TANRui,SONGJing-yuan,LUOKun,LUJing(1.SchoolofBioscienceandEngineering
4、,SouthwestJiaotongUniversity,Chengdu610031,China;2.InstituteofMedicinalPlantDevelopment,ChineseAcademyofMedicalSciences&PekingUnionMedicalCollege,Beijing100193,China;3.SchoolofPharmacy,HubeiUniversityofChineseMedicine,Wuhan430061,China;4.NationalInstitutefortheControlofPharmaceuticalandBiologic
5、alProducts,Beijing100050,China)Abstract:DNAbarcodingisatechniqueinwhichspeciesidentificationanddiscoveryareperformedbyusingshortandstandardfragmentsofDNAsequences.Inthisstudy,elevenspeciesofParis,includingsevenvarieties,weresampled.Fivechloroplastsequences,psbA-trnH,rpoB,rpoC1,rbcL,matK,andonen
6、uclearmarker,thesecondinternaltranscribedspacer(ITS2)ofribosomalDNA,wereamplifiedandsequenced.ThePCRamplificationandsequencingefficiency,intra-andinter-specificdivergenceandbarcodinggapwereusedtoevaluatedifferentloci,andtheidentificationefficiencywasassessedusingBLAST1andNearestDistancemethods.
7、TheITS2sequencesinthestudiedsamplesofPariswereamplifiedandsequencedsuccessfullyusingprimersdesignedbyourgroup,whilematKshowedlowlevelintheamplificationandpsbA-trnHwasdifficultforsequencingbecauseofover800bpandpoly(A)structure.Anal
