濒危兰科药用植物dna条形码鉴定

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1、濒危兰科药用植物DNA条形码鉴定[摘要]兰科药用植物形态分类困难,此研究采用DNA条形码分子鉴定法从分子水平验证兰科药用植物的传统形态分类。以matK,psbA-trnH和ITS2序列作为DNA条形码对已进行了形态鉴定的49属135种163份兰科药用植物样品进行分子鉴定,经DNA提取,PCR扩增、双向测序及校对拼接后,将得到的序列在GenBank中进行BLAST比对,然后运用MEGA7.0软件中的Neighbor-joining(NJ)法构建物种系统进化树。结果表明,163份样品均能成功提取DNA;matK,psbA-trnH和IT

2、S2序列的PCR扩增效率分别为100%,100%,98.77%;共获得487条序列,其中345条序列在GenBank数据库中比对到了相应物种的序列,142条为新增序列;运用NJ法构建的兰科药用植物系统进化树中,基于matK序列所构建的物种系统进化树要优于基于psbA-trnH和ITS2序列所构建的系统进化树。matK,psbA-trnH和ITS2序列在鉴定兰科药用植物过程中互为补充,DNA条形码分子鉴定法可用于辅助兰科药用植物的分类鉴定。本文采集自网络,本站发布的论文均是优质论文,供学和研宄使用,文中立场与本网站无关,版权和著作权归

3、原作者所有,如有不愿意被转载的情况,请通知我们删除匕转载的信息,如果需要分享,请保留本段说明。[关键词]兰科;DNA条形码;药用植物;分子鉴定[Abstract]Inthisstudy,DNAbarcodingwasusedtovalidatethetraditionalmorphologicalclassificationofmedicinalplantsofOrchidaceae.The163samplesof135speciesbelongto49generawhichhavebeenconfirmedbymorphologi

4、calidentificationwerecollected.Candidatesequences,includingmatK,psbA-trnHandITS2sequences,wereamplified,bidirectionallysequenced,andassembled.AllthesequenceswereblastedtoGenBankdatabaseatNCBI,thenanalyzedusingNeighbor-joiningtreemethodbyMEGA7.0.TheresultsshowedthattheD

5、NAsof163samplesweresuccessfullyextracted.TheamplificationefficiencyofmatK,psbA-trnHandITS2sequenceswere100%,100%and98.77%,respectively.The487sequenceswereobtained,345sequencesofwhichhavematchedcorrespondingsequencesintheGenBankdatabaseand142sequenceswerenewsequences.Th

6、etopologyofNJtreewhichwereconstructedwiththematKsequenceswasbetterthanthetreesofpsbA—trnHandITS2sequences.Inconclusion,thematK,psbA-trnHandITS2sequenceswerecomplementaryandsuitableforidentificationofmedicinalplantsofOrchidaceae.DNAbarcodingcanbeusedasanauxiliarymeansfo

7、ridentificationofmedicinalplantsofOrchidaceae.[Keywords]Orchidaceae;DNAbarcoding;medicinalplants;molecularidentification兰科Orchidaccac是世界性大科之一,包括地生、附生、菌类寄生等生活方式[1],在全世界约有800属20000〜35000种[2-4],FloraofChina中记载中国境内的野生兰科植物共有194属(中国特有属11个)1388种(中国特右种491个)[4]。兰科植物中的许多物种因其形态高度

8、进化,物种之间仅有极细微的差异,从形态上对其进行鉴定较困难。自双名法确立以来的250多年里,人类共鉴定和描述了约170万种生物[5],但这仅仅占到分类学家预计物种数量的15%[6]。DNA条形码(DNAbarcoding)是一种基于D

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