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1、软件论文关于软件论文:ImageJ软件测量肝脏体积的方法［摘要］ImageJ软件是一种可免费下载的JAVA图像分析与处理软件。基于其对医学影像图像可直接进行分析和处理，提出了一种在个人电脑上利用ImageJ软件测量肝脏体积的方法。并展示了外科医生可利用个人电脑独立进行肝脏CT容积的分析。［关键词JImageJ软件；肝脏体积；图像处理肝脏体积(livervolume,LV)是间接反映肝脏储备功能的一项重要指标［1］，根据CT或MRI的扫描图像准确计算手术前、后的肝脏体积，对于肝脏切除、肝移植等手术的病人非常有必要，有助于减少因术后残肝体积过小而造成的各种并发症。术后测量残余肝脏体积，
2、有助于外科医生了解肝脏的再生情况。遗憾的是这种处理医学影像的软件通常是安装在医院影像设备上，非放射人员无法经常接触，而且这种软件需要影像设备的支持，不能安装在个人电脑中，市面上独立的CT体积测量软件又非常昂贵，这给肝脏外科医生进行临床和科学研究带来诸多不便。Image!是一个可免费下载的图像分析软件包，由美国国立卫生研究院(NationalInstitutesofHealth,NIH)研究开发，用于帮助分析临床和科研中的医学影像。□前国内尚未见有关ImageJ软件测量肝脏体积的报道，基于以上原因，本文提出了一种在个人电脑上利用ImageJ软件测量肝脏体积的方法。1安装ImageJ软
3、件ImageJ软件下载，(版本1.42)直接双击下载后的程序即可安装,软件运行最少需要64M内存，可以在Windows>Linux>MacOS等操作系统上运行。2LV测量的过程2」获取图片由我院附属医院PACS图像处理工作站，选取行腹部多层螺旋CT平扫获得的肝脏CT图像，扫描层厚5mm,蟻巨1.0,管电压120kV,管电流65mAso将CICOM格式的图像文件夹拷至个人电脑，对其进行LV测量。2.2半自动法测量LV2.2.1制作图像栈每例病人的DICOM格式CT图像文件夹中，每层CT图片都有一个唯一的编号，运行ImageJ软件，选择菜单File—open,找到待处理的文件夹，按文件
4、夹中CT图像的编号顺序,依次打开含有肝脏的DICOM格式的CT图像，共N层；点击菜单栏Imagefstacks—Imagestostack,软件自动将N幅图像转换成图像栈，即在一个窗口里以多线程的形式层叠N幅图像，并行处理。只要内存允许，ImageJ软件能够打开任意多的图像进行处理。2.2.2图像预处理DICOM格式的图像栈每像素16位存储，为得到最佳的图像分割效果，需要先对栈进行预处理。通过点击菜单栏Image-Adjust-Window/Level,调节图像栈的窗宽、窗位,本文中窗宽、窗位为300HU、40HU；点击Image-Typef8・bit将168位图像，灰度值范围为0
5、-255,并将此时的图像栈保存命名为“原始栈图像”以备用；点击菜单栏Process-*-EnhanceContrast,对栈作图像增强处理；Process—Smooth对栈进行平滑处理。2.2.3阈值分割和二值化阈值分割是利用灰度直方图分分布，选择合适的阈值Threshold,并把灰度图像分成目标与背景。ImageJ软件提供了阈值化的用户窗口，单击菜单栏Image—Adjust—Threshold,弹出Threshold窗口，拖动滑块调整阈值，对图像栈进行阈值分割。本文使用两个阈值同时调整的方法，阈值的大小选取根据实时的调整确定，一般最小值为100,最大值为230,单击Apply后
6、得到二值化图像；单击菜单栏Process-Binary-Outline,获得图像的边缘轮廓，得到“边缘图像”。224创建感兴趣区域打开已保存的"原始栈图像”，单击Process-5"ImageCalculator,弹出ImageCalculator窗口，在Image1栏选择“原始栈图像”，Image2栏选择“边缘图像”，Operation栏选择Subtract,对两算(原始栈图像减去边边缘轮廓的图像栈，本文称之为“减图像”；如果“减图像”中肝脏的边缘轮廓是闭合的，可利用软件的魔术棒工具直接点击肝脏边缘的任意一点，自动获得感兴趣区域，黄线即为肝脏感兴趣区域(Regionofinter
7、esting,ROI),工具栏灰暗区是魔术棒工具；但是如果“减图像”中肝脏的边缘轮廓存在不连续的地方，需要利用软件画笔工具连接断开的边缘，这样获得闭合的肝脏边缘后，再利用魔术棒工具得到感兴趣区域。2.2.5计算肝脏体积获取栈的第一幅CT图像的ROI后，点击菜单栏Analyze-ToolsfROIManager-,在弹出的ROIManager窗口中点击Add,软件自动添加第一幅图像的ROI数据；然后利用魔术棒工具创建第二幅图像的ROI,并在ROIManager窗口中点击
