不同血液保存方法对RNA提取的影响(简易版)

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时间:2019-08-23

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1、不同血液保存方法对RNA提取的影响一、引言1.1探索血液RNA保存方法的必要性全血作为较易获取的人体标本,特别适用于实验室和临床检测。高质量的RNA可以满足RT-PCR、qRT-PCR、Northernblot、基因表达谱、转录组测序、[1]核酸酶保护实验和阵列分析等生物学下游实验的研究需求。但由于RNA自身结构为单链状态,极不稳定,同时广泛分布的RNase时刻发挥着降解RNA的功能,其活性难以被抑制,因此使得从全血中提取RNA以及对RNA的保存相对困难。1.2常见的血液RNA保存方法[2]第一种为分离白膜层,加入RNAlater保护剂冻存-80℃。此种方法为目前样本库常用的血液R

2、NA保存方法,采血后需在常温保存4小时内完成白膜层分离,或在采血2小时内放入4℃冰箱保存,24小时内4℃低温分离,将分离获得的白膜层用RNAlater保护剂保存,RNAlater的主要作用为提供高盐环境使细胞脱水,抑制核酸酶活性。此种方法的优势在于可将全血中大部分对于提取RNA无用的成分去除,缩减了样本的体积,更加便于保存。但此种方法的弊端在于,首先分离白膜层的过程较为繁琐,需要多次离心,在临床医院或临时的采血点往往难以实施,其次高盐脱水后的细胞复性困难,提取RNA的难度增加,且高盐组分不易去除,提取的RNA纯度不高,最后血液在分离白膜层过程中,会有部分白细胞及RNA组分缺失。第二

3、种为专用的静脉真空采血管,其中添加了特殊的试剂,可以保护细胞内的RNA,防止降解,但此方法核酸得率偏低,需大量血液来支撑下游实验研究。本实验内容纵向地比较了两种血液保存方式下,RNA保存效果的对比;并探索了在不同保存温度及不同保存时间下,RNA的保存效果。希望本文可为广大的科研同胞们提供帮助。二、材料和方法2.1标本来源本组血液样品均采自同一志愿者,采用标准静脉穿刺技术,一次性使用真空采血管EDTA·Na25ml(购于江苏康捷医疗器械有限公司)采集静脉血,全部标33本白细胞计数范围为3.16×10~3.25×10。2.2方法2.2.1白膜层分离采集3管新鲜血液,每管5ml,采血后1

4、0min内3,000rpm离心10min,吸弃血浆,加入和血浆等体积的PBS缓冲液,颠倒混匀。取15ml离心管,加入7.5mlFicoll-paqueTMPLUSlymphocyteisolationsterilesolution(购于GE公司,Lot.10244745),吸取采血管中血细胞加入分离液中分层,2,000rpm离心20min。吸弃上层PBS,移液器吸取白膜层转移至5ml离心管中,加入PBS吹打混匀,2,000rpm离心10min,弃上清。加入400lPBS缓冲液重悬,然后分别缓慢加入不同RNA保护液。Q组:加入1.2mlRNAlaterRNAStabilizatio

5、nReagent(购于Qi***n公司,Lot.15****995);A组:加入1.2mlA***onRNAlaterSolution(购于英**基,Lot.00****70);B组:加入1.2mlRNAfixer保存液(购于Bioteke公司,Cat.RP1302)。将三管样品均冻存于-80℃保存。2.2.2白膜层RNA提取(沉淀法)取200l保存的白膜层,加2mlRL裂解液,涡旋混匀30s,室温裂解15min;加入300l氯仿,涡旋混匀10s,室温放置3min;12,000rpm离心10min,吸取水相,加入等体积异丙醇,-20℃沉淀至少2h,若出现浑浊,加入DEPC水配制

6、的50%异丙醇,直至混浊消失;4℃,12,000rpm离心15min,小心弃上清;加入1ml75%乙醇漂洗2次;30lRNase-freeH2O溶解。2.2.3白膜层RNA提取(离心柱法)严格按照试剂盒操作说明操作,所用试剂盒为:血液(液体样本)总RNA快速提取试剂盒(离心柱型)(购于BioTeke,Cat.RP4001);动物组织总RNA提取试剂盒(离心柱型)(购于Tiangen,Lot.P4920)。2.2.4血液RNA保存管提取RNA采集新鲜全血,30min内转移2.5ml至10ml血液RNA保存管(购于BioTeke,Cat.ST1001)中,涡旋混匀30s,室温放置10

7、min,而后转移至不同条件保存。提取时取1.6ml液体,恢复室温,放置10分钟,加入200l氯仿,涡旋混匀10s,室温放置3min;4℃12,000rpm离心10min,吸取水相,加入等体积70%乙醇,混匀,将混合液加入RA柱,12,000rpm离心1min,弃滤液;加入500l去蛋白液RE,4℃12,000rpm离心1min,弃滤液;加入700l漂洗液RW,4℃12,000rpm离心1min,弃滤液;加入500l漂洗液RW,4℃12,000rpm离心1mi

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