欢迎来到天天文库
浏览记录
ID:40734281
大小:37.50 KB
页数:4页
时间:2019-08-06
《高斯计算溶剂化能》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、关于用G09算溶剂化能的问题作者:布丁3835 收录日期:2009-10-15 发布日期:2009-10-15我用G09计算DMSO在DMSO中的溶剂化能,输入文件的一部分如下,optfreqhf/6-31+g** scrf(read,pcm,solvent=dimethylsulfoxide),这样计算出来的结果找不到DeltaG,也没看到相关能量,如G03中类似的能量形式VariationalC-PCMresults=========================2、 3、psi(0) 4、H > (a.u.)= -551.544999 (a.u.)= -551.551263 (a.u.)= -551.5519435、  H 6、psi(f)> (a.u.)= -551.544233 (a.u.)= -551.551944Totalfreeenergyinsolution: withallnonelectrostaticterms 7、(a.u.)= -551.547465--------------------------------------------------------------------(Unpolarizedsolute)-Solvent (kcal/mol)= -3.93(Polarizedsolute)-Solvent (kcal/mol)= -4.84Solutepolarization (kcal/mol)= 0.48Totalelectrost8、atic (kcal/mol)= -4.36--------------------------------------------------------------------Cavitationenergy (kcal/mol)= 12.89Dispersionenergy (kcal/mol)= -10.80Repulsionenergy (kcal/mol)= 0.72To9、talnonelectrostatic (kcal/mol)= 2.81DeltaG(solv) (kcal/mol)= -1.55看了下g09的帮助文献,将输入改成optfreqhf/6-31+g** scrf(read,SMD,solvent=dimethylsulfoxide),结果在输出文件中出现了KeepR1intsinmemoryincanonicalform,NReq=22711753.Errorontotalpolarizationch10、arges= 0.02051SCFDone: E(RHF)= -551.571142309 A.U.after 9cycles Convg = 0.8499D-08 -V/T= 2.0010SMD-CDS(non-electrostatic)energy (kcal/mol)= -0.02(includedintotalenergyabove)我想请问一下SMD.......=-0.02是不是g09算出来的溶剂化能,如果是的话,与G03的结果差得太大,如11、果不是的话,那该怎么写输入文件才能得到g09的溶剂化能?谢谢高手的指点作者:yytsnake那算水在以水为溶剂的体系中结果如何?作者:布丁3835算水的也差很多,我怀疑溶剂化能没找对,但是确实不知道该往哪里找了作者:yjcmwgk说实话我不喜欢scrf关键字我喜欢在溶质分子周围摆上一圈儿溶剂分子作者:yytsnake溶剂模型的算法肯定与不同量化算法有较大差别,以更加近似的方法计量溶剂与体系的作用。版主的设计才体现了溶剂分子或离子间的相对真实作用。虽然化学对量化计算有不良影响,但作为一个基础还是得先加加深。这样在使用量化讨12、论化学问题时,才能更加体会其奥秘之处。作者:布丁3835自己顶一下,期待大家的帮助作者:九层楼摘自G09keywordscrf:EXAMPLESPCMEnergy.Ingeneral,energyoutputfromthedefaultSCRFmethodappearsinthenormalwaywithintheo
2、 
3、psi(0)
4、H > (a.u.)= -551.544999 (a.u.)= -551.551263 (a.u.)= -551.5519435、  H 6、psi(f)> (a.u.)= -551.544233 (a.u.)= -551.551944Totalfreeenergyinsolution: withallnonelectrostaticterms 7、(a.u.)= -551.547465--------------------------------------------------------------------(Unpolarizedsolute)-Solvent (kcal/mol)= -3.93(Polarizedsolute)-Solvent (kcal/mol)= -4.84Solutepolarization (kcal/mol)= 0.48Totalelectrost8、atic (kcal/mol)= -4.36--------------------------------------------------------------------Cavitationenergy (kcal/mol)= 12.89Dispersionenergy (kcal/mol)= -10.80Repulsionenergy (kcal/mol)= 0.72To9、talnonelectrostatic (kcal/mol)= 2.81DeltaG(solv) (kcal/mol)= -1.55看了下g09的帮助文献,将输入改成optfreqhf/6-31+g** scrf(read,SMD,solvent=dimethylsulfoxide),结果在输出文件中出现了KeepR1intsinmemoryincanonicalform,NReq=22711753.Errorontotalpolarizationch10、arges= 0.02051SCFDone: E(RHF)= -551.571142309 A.U.after 9cycles Convg = 0.8499D-08 -V/T= 2.0010SMD-CDS(non-electrostatic)energy (kcal/mol)= -0.02(includedintotalenergyabove)我想请问一下SMD.......=-0.02是不是g09算出来的溶剂化能,如果是的话,与G03的结果差得太大,如11、果不是的话,那该怎么写输入文件才能得到g09的溶剂化能?谢谢高手的指点作者:yytsnake那算水在以水为溶剂的体系中结果如何?作者:布丁3835算水的也差很多,我怀疑溶剂化能没找对,但是确实不知道该往哪里找了作者:yjcmwgk说实话我不喜欢scrf关键字我喜欢在溶质分子周围摆上一圈儿溶剂分子作者:yytsnake溶剂模型的算法肯定与不同量化算法有较大差别,以更加近似的方法计量溶剂与体系的作用。版主的设计才体现了溶剂分子或离子间的相对真实作用。虽然化学对量化计算有不良影响,但作为一个基础还是得先加加深。这样在使用量化讨12、论化学问题时,才能更加体会其奥秘之处。作者:布丁3835自己顶一下,期待大家的帮助作者:九层楼摘自G09keywordscrf:EXAMPLESPCMEnergy.Ingeneral,energyoutputfromthedefaultSCRFmethodappearsinthenormalwaywithintheo
5、  H
6、psi(f)> (a.u.)= -551.544233 (a.u.)= -551.551944Totalfreeenergyinsolution: withallnonelectrostaticterms
7、(a.u.)= -551.547465--------------------------------------------------------------------(Unpolarizedsolute)-Solvent (kcal/mol)= -3.93(Polarizedsolute)-Solvent (kcal/mol)= -4.84Solutepolarization (kcal/mol)= 0.48Totalelectrost
8、atic (kcal/mol)= -4.36--------------------------------------------------------------------Cavitationenergy (kcal/mol)= 12.89Dispersionenergy (kcal/mol)= -10.80Repulsionenergy (kcal/mol)= 0.72To
9、talnonelectrostatic (kcal/mol)= 2.81DeltaG(solv) (kcal/mol)= -1.55看了下g09的帮助文献,将输入改成optfreqhf/6-31+g** scrf(read,SMD,solvent=dimethylsulfoxide),结果在输出文件中出现了KeepR1intsinmemoryincanonicalform,NReq=22711753.Errorontotalpolarizationch
10、arges= 0.02051SCFDone: E(RHF)= -551.571142309 A.U.after 9cycles Convg = 0.8499D-08 -V/T= 2.0010SMD-CDS(non-electrostatic)energy (kcal/mol)= -0.02(includedintotalenergyabove)我想请问一下SMD.......=-0.02是不是g09算出来的溶剂化能,如果是的话,与G03的结果差得太大,如
11、果不是的话,那该怎么写输入文件才能得到g09的溶剂化能?谢谢高手的指点作者:yytsnake那算水在以水为溶剂的体系中结果如何?作者:布丁3835算水的也差很多,我怀疑溶剂化能没找对,但是确实不知道该往哪里找了作者:yjcmwgk说实话我不喜欢scrf关键字我喜欢在溶质分子周围摆上一圈儿溶剂分子作者:yytsnake溶剂模型的算法肯定与不同量化算法有较大差别,以更加近似的方法计量溶剂与体系的作用。版主的设计才体现了溶剂分子或离子间的相对真实作用。虽然化学对量化计算有不良影响,但作为一个基础还是得先加加深。这样在使用量化讨
12、论化学问题时,才能更加体会其奥秘之处。作者:布丁3835自己顶一下,期待大家的帮助作者:九层楼摘自G09keywordscrf:EXAMPLESPCMEnergy.Ingeneral,energyoutputfromthedefaultSCRFmethodappearsinthenormalwaywithintheo
此文档下载收益归作者所有