(最新)单分子测序技术-单分子测序技术对于未来基因组学研究的影响

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1、单分子测序技术对于未来基因组学研究的影响范文竹108080662009年5月13日背景自从20世纪90年代中期基因组学研究开始，人们就热衷于对大量的真原核生物进行全基因组测序。大规模基因组重测序、特定区域测序、宏基因组和泛基因组测序，以及个体基因组学，这些基因组学研究的发展则需要更快速度和更低成本的测序技术。到目前为止，只有几个个体的基因组被完全测序完成，只有CraigVenter和JamesWatson的基因组序列已经发布。为了满足这种日益增长的需求，几种非Sanger的超高通量测序系统已于2007年面世。第二代测序方法1文库制备2产生DNA簇3测序4数据分析第

2、二代测序方法优点：可扩展的超高通量需要样品量少简单、快速、自动化新颖的测序化学技术高产量的有效数据单个或配对末端支持DNA分析支持缺点：仍旧依靠于聚合酶链式反应，有可能在扩增过程中产生错误DNA合成的非同时性造成DNA链的相移读取长度的限制，使其在对未知基因组进行从头测序的应用受到限制，这部分工作仍然需要传统测序(读取长度达到850碱基)的协助。第二代测序方法应用：DNA水平a.基因组测序及注释b.定向基因区域重复测序–判定和发现新的基因多态性（如SNP）c.大规模筛查基因突变和基因多态性d.利用SNP进行表型相关性的研究e.基因组甲基化分析RNA水平a.全基因组

3、广谱基因表达研究b.小RNA扫描，定量，和鉴定蛋白水平a.核酸和蛋白相互作用及定位研究（如ChIp-Seq研究）第三代测序方法单分子测序方法早在1989年Keller等人就已经提出，经过几种不同方法的实验室测试。单分子测序技术（SMS）不依赖于聚合酶链式反应，因此可以克服第二代测序的缺陷。如扫描探针显微法、外切酶测序法、合成测序法（SBS）以及其他几种方法第三代测序方法1核酸外切酶测序法2合成测序法3纳米孔测序法4透射电镜测序技术核酸外切酶测序法合成测序法真实单分子测序法（tSMS)能量共振转移测序法（FRET）SMRT测序法（SMRT）合成测序法-tSMS合成测

4、序法-FRET能量共振转移合成测序法-SMRT纳米孔测序技术杂交辅助的纳米孔测序法(HANS)寡聚物辅助的纳米孔测序法透射电镜测序技术以单链线性DNA为模板，以三种重元素标记，一种不标记的脱氧核苷酸为原料，合成其互补链，经透射电镜（TEM）检测，则可见重元素标记，其互补链则可由点的大小和强度被分辨出来第二三代测序技术比较技术瓶颈可读序列短高错误率产生相接末段大量数据的管理困难未来与展望SMS是一种新兴的有潜力的测序技术，其优缺点只有在被大量研究者使用时才会完全暴露。SMS技术的发展将带来新一场基因组学研究革命，宏基因组、泛基因组、个体基因组学的研究都会在其基础上取

5、得巨大的发展。ThankYou！