生物信息学SwissPDB-Viewer的使用

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1、SwissPdb-viewer的复习小组作业G23H8用感兴趣的锌指蛋白巩固SwissPdb-Viewer锌指蛋白是指含有通过结合Zn2+形成稳定的短的可以自我折叠“手指”结构的一类蛋白质。由于其自身的结构特点,可以选择性的结合特异的靶结构,使锌指蛋白在基因的表达调控、细胞分化、胚胎发育等生命过程中发挥重要作用。锌指通过与靶分子DNA、RNA、DNA-RNA的序列特异性结合,以及与自身或其他锌指蛋白的结合,在转录和翻译水平上调控基因的表达Uniprot搜索人锌指蛋白PDB中blast查找相似序列下载PDB文件换一个角度,更清晰的看到起结构将Zn凸显出来以电子云形式呈

2、现放大可清晰看到其结合方式人和猪的胰岛素的蛋白结构比对PDB中查找人的胰岛素猪的胰岛素结构人胰岛素的结构,发现一明显的特殊结构有资料显示其可能为六个酚分子与胰岛素形成的六聚体Magicfit的结果,结果显示结构极其相似人的胰岛素B链最后一个氨基酸是苏氨酸猪的胰岛素B链最后一个氨基酸为丙氨酸谢谢

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