微生物的分类鉴定2

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1、第十二章微生物的分类和鉴定形成于35亿年前的微生物化石主要是些类似简单杆状细菌的原始生物形成于8.5亿年前的微生物化石20亿年前以后的岩石中的微生物的化石形态多样性明显增多形成于10亿年前的微生物化石形态上非常类似于现代的蓝细菌，进行不产氧光合作用的光能自养菌，及化能无机营养的硫细菌。形态上类似于现代的绿藻（真核生物）今天仍生存在地球上的生物种类，彼此之间都有或远或近的历史渊源。最原始的生命漫长的进化历程千姿百态的生物种类生物分类的二种基本原则：a）根据表型(phenetic)特征的相似程度分群归类，这种表型分类重在应用，不涉及生物进化或不以反

2、映生物亲缘关系为目标；b）按照生物系统发育相关性水平来分群归类，其目标是探寻各种生物之间的进化关系，建立反映生物系统发育的分类系统。从进化论诞生以来，已经成为生物学家普遍接受的分类原则生物系统学(systematics)进化的测量指征rRNA作为进化指征⑴生物功能：rRNA参与蛋白质的合成。⑵分子结构：序列中既存在高度保守的区域，也存在高度变化区域。其中16SrRNA大小适合，操作方便。⑶数量与分布：数量大，普遍存在于原核和真核生物中。利用16SrDNA序列对微生物进行鉴定利用16SrRNA建立分子进化树的美国科学家CarlWoese微生物的1

3、6SrDNA序列具有进化上的保守性，因此可作为分类的良好依据。基于16SrDNA序列同源性的脱氮细菌系统发育树培养微生物提取基因组DNArRNA序列测定分析比较微生物之间的系统发育关系16SrDNA微生物鉴定流程PCR扩增16SrDNA片段第一节细菌分类分类是认识客观事物的一种基本方法。我们要认识、研究和利用各种微生物资源也必须对它们进行分类。分类(classification)：根据一定的原则(表型特征相似性或系统发育相关性)对微生物进行分群归类，根据相似性或相关性水平排列成系统，并对各个分类群的特征进行描述，以便查考和对未被分类的微生物进行

4、鉴定；(根据现有数据建立系统的过程)分类学涉及三个相互依存又有区别的组成部分：鉴定分类、命名、命名(nomenclature)：是根据命名法规，给每一个分类群一个专有的名称；(分类系统建立过程中的步骤之一)鉴定(identification或determination)：借助于现有的微生物分类系统，通过特征测定，确定未知的、或新发现的、或未明确分类地位的微生物所应归属分类群的过程。(根据现有系统确定未知微生物分类归属的过程)主要以细菌为例介绍微生物分类、命名和鉴定的有关知识常用的细菌分类学术语：1）培养物(culture)：一定时间一定空间内微

5、生物的细胞群或生长物。如微生物的斜面培养物、摇瓶培养物等。2）菌株(strain)：从自然界中分离得到的任何一种微生物的纯培养物都可以称为微生物的一个菌株；用实验方法(如通过诱变)所获得的某一菌株的变异型，也可以称为一个新的菌株，以便与原来的菌株相区别。菌株是微生物分类和研究工作中最基础的操作实体一、分类单元及其等级BacillussubtilisASI.398BacillussubtilisBF7658生产蛋白酶生产α淀粉酶3）型(form或type)：常指亚种以下的细分。当同种或同亚种不同菌株之间的性状差异，不足以分为新的亚种时，可以细

6、分为不同的型。例如抗原特征的差异分为不同的血清型；对噬菌体裂解反应的不同分为不同的噬菌型等。4）种（species）：物种，生物分类中基本的分类单元和分类等级。高等生物中，“生殖隔离”被看作是区分物种的标准。微生物的种：具有高度特征相似性的菌株群，这个菌株群与其他类群的菌株有很明显的区别。伯杰氏手册《伯杰氏鉴定细菌学手册》(Bergey’sManualofDeterminativeBacteriology)美国宾夕法尼亚大学的细菌学教授伯杰(D.Bergey)(1860-1937)1957年第七版后，由于越来越广泛地吸收了国际上细菌分类学家参加

7、编写(如1974年第八版，撰稿人多达130多位，涉及15个国家；现行版本撰稿人多达300多人，涉及近20个国家)，所以它的近代版本反映了出版年代细菌分类学的最新成果，因而逐渐确立了在国际上对细菌进行全面分类的权威地位。《伯杰氏系统细菌学手册》(Bergey’sManualofSystematicBacteriology)伯杰氏手册是目前进行细菌分类、鉴定的最重要依据，其特点是描述非常详细，包括对细菌各个属种的特征及进行鉴定所需做的实验的具体方法。（20世纪80年代末期）二、微生物的命名双名法，属名和种名加词组成，一般用斜体表示。属名在前，一般用

8、拉丁字名词表示，字首字母大写种名在后，常用拉丁文形容词表示，全部小写若所分离的菌株只鉴定到属，而未鉴定到种，可用sp来表示，例如BacillusspP