微生物的分类、鉴定及命名

《微生物的分类、鉴定及命名》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在教育资源-天天文库。

1、第二章微生物的分类、鉴定及命名1、生物界的分类地球上的物种估计大约有150万，其中微生物超过10万种，而且其数目还在不断增加。在生物进化历史过程中演化形成生物种类和种群的多样性。生物分类就是通过研究生物的系统发育及其进化历史，揭示各类生物的多样性及其系统关系，编制分类系统，还原生物的自然历史位置。高等动植分类化石资料、形态学、比较胚胎学较正确反映其系统发育微生物分类的难题：绝大部分微生物个体小、形态简单、易受环境影响而变异、缺少有性繁殖、缺乏化石资料。生物分类的二种基本原则：a）根据表型(phenetic)特征的相似程度分群归类，这种表型分类重在应用，不涉及生物进化或

2、不以反映生物亲缘关系为目标；b）按照生物系统发育相关性水平来分群归类，其目标是探寻各种生物之间的进化关系，建立反映生物系统发育的分类系统。★从两界系统经历过三界系统、四界系统、五界系统甚至六界系统，最后又有了三原界（或三总界）系统。★传统的、为多数学者所接受的是1969年魏塔克（R.H.Whittaker）在《Science》上提出的五界学说，它以纵向显示从原核生物到真核单细胞生物再到真核多细胞生物的三大进化过程。生物的界级分类学说利用16SrRNA建立分子进化树的美国科学家CarlWoese三域学说的建立（1）古细菌原界（Archaebacteria)，包括产甲烷细

3、菌、极端嗜盐菌和嗜热嗜酸菌；（2）真细菌原界（Eubacteria)，包括蓝细菌和各种除古细菌以外的其它原核生物；（3）真核生物原界（Eucaryotes），包括原生生物、真菌、动物和植物。2、微生物分类学经典分类学：按微生物表型分类微生物系统学：按亲缘关系和进化规律分类发展表型特征：形态学、生理生化学、生态学等，推断微生物的系统发育。表型特征结合分子水平上比较微生物的基因型特征（如16SrRNA)探讨微生物进化、系统发育和分类鉴定。★微生物分类学的三个任务：分类、鉴定及命名☆分类是根据微生物的相似性和亲缘关系，将微生物归入不同的分类类群。☆鉴定是确定一个新的分离物属

4、于已经确认的分类单元的过程。☆命名是根据国际命名法规给微生物分类单元以科学的名称。以啤酒酵母为例，它在分类学上的地位是：界(Kindom)：真菌界门(Phyllum)：真菌门纲(Class)：子囊菌纲目(Order)：内孢霉目科(Family)：内孢霉科属(Genus)：酵母属种(Species)：啤酒酵母3、微生物的分类单位界、门、纲、目、科、属、种种是最基本的分类单位每一分类单位之后可有亚门、亚纲、亚目、亚科...种（species）：是一个基本分类单位；是一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近，与同属内其他种有明显差别的菌株的总称。菌株（strain）:表示任

5、何由一个独立分离的单细胞繁殖而成的纯种群体及其一切后代（起源于共同祖先并保持祖先特性的一组纯种后代菌群）。因此，一种微生物的不同来源的纯培养物均可称为该菌种的一个菌株。菌株强调的是遗传型纯的谱系。例如：大肠埃希氏杆菌的两个菌株：EscherichiacoliB和EscherichiacoliK12★菌株的表示法：★种是分类学上的基本单位，菌株是实际上应用的基本单位，因为同一菌种的不同菌株在产酶上种类或代谢物产量上会有很大的不同和差别！亚种(subspecies）或变种(variety)：为种内的再分类。当某一个种内的不同菌株存在少数明显而稳定的变异特征或遗传形状，而又

6、不足以区分成新种时，可以将这些菌株细分成两个或更多的小的分类单元——亚种。变种是亚种的同义词，因“变种”一词易引起词义上的混淆，从1976年后，不在使用变种一词。通常把实验室中所获得的变异型菌株，称之为亚种。如：E.colik12（野生型）是不需要特殊aa的，而实验室变异后，可从k12获得某aa的缺陷型，此即称为E.colik12的亚种。型(form):常指亚种以下的细分。当同种或同亚种内不同菌株之间的性状差异不足以分为新的亚种时，可以细分为不同的型。例如：按抗原特征的差异分为不同的血清型；学名—是微生物的科学名称，它是按照有关微生物分类国际委员会拟定的法则命名的。

7、学名由拉丁词、或拉丁化的外来词组成。学名的命名有双名法和三名法两种。①双名法：学名=属名+种名+（首次定名人）+现定名人+定名年份属名：拉丁文的名词或用作名词的形容词，单数，首字母大写，表示微生物的主要特征，由微生物构造，形状或由科学家命名。种名：拉丁文形容词，字首小写，为微生物次要特征，如微生物色素、形状、来源或科学家姓名等。4、微生物的命名必要，用斜体表示可省略，用正体字微生物的名字有俗名和学名两种。如：红色面包霉———粗糙脉孢霉绿脓杆菌———铜绿假单胞菌例：大肠埃希氏杆菌Escherichiacoli（Migula）CastellanietC