类鼻疽伯克霍尔德菌基因分型技术研究进展

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1、万方数据176军事医学科学院院刊2009年4月第33卷第2期BullAcadMilMedSei，Apr2009；Vol33No2类鼻疽伯克霍尔德菌基因分型技术研究进展邱少富，端青’(军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室，北京100071)[摘要】类鼻疽伯克霍尔德茵(Burkholderiapseudomallei，Bp)是引起人及动物严重感染性疾病类鼻疽的病原体。近年来，分子生物学技术被用于Bp基因分型研究，在类鼻疽流行病学调查及病原鉴定与溯源中发挥了重要作用。本文综

2、述了不同基因分型技术在Bp鉴定、分型与溯源中的应用及各自的技术特点。【关键词】类鼻疽伯克霍尔德茵；类鼻疽；基因分型；溯源[中图分类号】R378．6[文献标识码】A[文章编号]1000-5501(2009)02旬176旬3ProgressinresearchongenotypingmethodsforBurkholderiapseudomalleiQlUShao—Fu，DUANQing‘‘(StateKeyLaboratoryofPathogenandBioseeurity，Instituteof

3、MicrobiologyandEpidemiology，AcademyofMilitaryMedi·calSciences，Beijing100071，China)[Abstract]BurkholderiapseudomaUeiisthec4ulsafiveagentofmelioidosis，asevel呛infectiousdiseaseofhumansand粕-imals．Recently．moleculartypingmethods肿increasinglyusedtosubtypet

4、he鼠pseudomalleiisolatesandhaveprovenusefulinepidemiologicalinvestigation。pathogen’sidentificationandfloui℃e-trackingofmelioidosis．Inthispaper，themo-leculartypingmethodsandtheirapplicationinidentification．genotypingandtrackingsome8ofB．pseudomal如iare他-

5、viewed．[Keywords]Burkho／der／apseudomallei；melioidosis；genotyping；seul'ce·tracking类鼻疽，被列为国家乙类传染病，是由类鼻疽伯克霍尔德菌(Burkho／der／apseudoma／／ei，Bp)感染所致的热带、亚热带地方性人兽共患病。Bp属革兰阴性菌，广泛分布于东南亚和澳大利亚北部的水及土壤中。我国Bp疫源地主要分布于海南、广东、广西、湖南、贵州、福建、香港、台湾等省区。人群对该菌普遍易感，临床症状表现复杂多样，分为急

6、性败血症型、亚急性型、慢性型和弧临床型，最严重的症状是合并肺炎和急性败血症¨“J。该病病死率高，泰国东北部高达50％，澳大利亚为19％，其中急性败血症型病死率高达90％以上MJ。另外，Bp对动物的感染谱较为广泛，动物类鼻疽的暴发或流行不仅给畜牧业带来严重的经济损失，而且是一个不容忽视的公共卫生问题口Jo。该病自1911年首次在缅甸被发现以来，越来越多的国家从环境中分离到了Bp并且感染人数随之增加，被认为是一种正在扩展的人兽共患病。由于Bp可通过气溶胶传播及对不良环境的抵抗力强和所致疾病的严重性，

7、被《禁止生物武器公约》和美国疾病控制预防中心列为生物剂¨。J。近年来，各种分子生物学技术被用于Bp基因分型研究，在Bp流行病学调查监控、鉴定、溯源、系统发生分析与传播机制等方面发挥了重要作用。这些分型方法主要有：核糖分型(ribotyping)、随机扩增多态性DNA(randomlyampli．fledpolymorphicDNA，RAPD)、多基因座序列分型(multilo-CUSsequencetyping，MLST)、脉冲场凝胶电泳(pulsed—fieldgelelectrophores

8、is，PFGE)、可变数目串联重复序列(variable·numbertandemrepeat，VNTB)、单核苷酸多态性(single．nil·cleotidepolymorphism，SNP)分析等。综合分型能力、分辨率、可重复性、易操作性及结果易解释性等各方面特点，本文着重对以上几种分型方法的性能进行比较评价，并综述其在Bp基因分型研究中的应用。1核糖分型核糖分型，即rRNA基因的限制性片段长度多态性分析，是一种基于rRNA基因为探针的Southern印迹分析法。由于其具有较高分辨力、广泛