细菌DNA的提取方法

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时间:2019-05-24

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1、细菌DNA的提取方法针对一些不易于提取的细菌的方法:试验试剂:抽提缓冲液:2%CTAB(W/V)2%PVPK25(w/v)(去色素)100mMTris-HCl(pH8.0)25mMEDTA(pH8.0)2.0MNaCl10MLiCl2MLiClDEPC-water(抑制RNA酶活性)3MNaAc(pH5.2)96%乙醇70%乙醇试验步骤:1、抽提缓冲液65℃预热。2、加菌体到已经预热的缓冲液(700ul)中混匀,65℃,10min。3、加酚/氯仿/异戊醇(25:24:1),振荡,以12,000rpm,离心10min。4、取

2、上清,加氯仿/异戊醇(24:1)振荡,以12,000rpm,离心10min。5、重复再作一次步骤4。6、加入1/10体积的3M醋酸钠和1.5倍体积的乙醇(或加入等体积的异丙醇),-20C下沉淀。7、以2,000rpm,离心10min。8、弃上清,以70%乙醇条洗沉淀,也可以再用100%乙醇洗,然后溶解于100ml水中。 较为常用的细菌DNA提取方法:实验步骤:1、将菌株接种于液体LB培养基,37℃震荡培养过夜。2、取1.5ml培养物12000rpm离心2min。3、沉淀中加入567ul的TE缓冲液,反复吹打使之重新悬浮,加

3、入30ul10%SDS和15ul的蛋白酶K,混匀,于37℃温育1h.4、加入100ul5mol/LNaCl,充分混匀,再加入80ulCTAB/NaCl溶液,混匀后再65℃温育10min。5、加入等体积的酚/氯仿/异戊醇混匀,离心4-5min,将上清转入一只新管中,加入0.6-0.8倍体积的异丙醇,轻轻混合直到DNA沉淀下来,沉淀可稍加离心。6、沉淀用1ml的70%乙醇洗涤后,离心弃乙醇. 真菌DNA提取总结的两种方法:第一种方法:试验步骤:1、取真菌菌丝0.5g,在液氮中迅速研磨成粉。2、加入4mL提取液,快速振荡混匀。3

4、、加入等体积的4mL的氯仿:异戊醇(24:1),涡旋3~5min(此处是粗提没有加酚)。4、以4℃,1000rpm,离心5min。5、上清再用等体积的氯仿:异戊醇(24:1)抽提一次。以4℃,10,000rpm,离心5min。6、取上清,加入2/3倍体积的-20℃预冷的异丙醇或2.5倍体积的无水乙醇沉淀,混匀,静置约30min。7、用毛细玻棒挑出絮状沉淀,用75%乙醇反复漂洗数次,再用无水乙醇漂洗1次,吹干,重悬于500ulTE中。8、加入1ulRNaseA(10mg/mL),37℃下处理1h。9、用酚(pH8.0):氯仿

5、:异戊醇(25:24:1)和氯仿:异戊醇(24:1)各抽提1次。以4℃,10,000rpm,离心5min。10、取上清,加入1/10倍体积的3MNaAc,2.5倍体积的无水乙醇,-70℃沉淀30min以上。11、沉淀用75%乙醇漂洗,风干,溶于200ulTE中,-20℃保存备用。DNA提取液:0.2MTris-HCl(pH7.5),0.5MNaCl,0.01MEDTA,1%SDS,3MNaAc。第二种方法:试验步骤:1、真菌菌丝0.5-1g,在液氮中迅速研磨成粉。2、加入3mL65℃预热的DNA提取缓冲液,快速振荡混匀65

6、℃水浴30min,期间混匀2-3次。3、加入1mL5MKAc,冰浴20min。4、等体积的氯仿:异戊醇(24:1)抽提1次(10,000rpm,4℃离心5min)。5、取上清,加入2/3倍体积的-20℃预冷异丙醇,混匀,静置约30min。6、用毛细玻棒挑出絮状沉淀,用75%乙醇反复漂洗数次,再用无水乙醇漂洗1次,吹干,重悬于500ulTE中。7、加入1ulRNaseA(10mg/mL),37℃处理1h。8、用酚(pH8.0):氯仿:异戊醇(25:24:1)和氯仿:异戊醇(24:1)各抽提1次。以4℃,10,000rpm,离

7、心5min。9、取上清,1/10V3MNaAc,2.5V体积的无水乙醇,-70℃沉淀30min以上。10、沉淀用75%乙醇漂洗,风干,溶于200ulTE中,-20℃保存备用。  细菌基因组DNA的提取方法综述,提供了5种方法。 1快速微量提取法A.取1.5ml菌体培养物于一灭菌Ep管中,12000rpm离心1min,丢去上清夜,收集菌体。B.加入400ul裂解液(40mMTris-醋酸,20mM醋酸钠,1mMEDTA,1%SDS,pH7.8)混匀,置于37oC水浴1hr。C.然后加入200ul5mol/L的氯化钠溶液,混匀

8、后于13000rpm离心15min。D.取上清液,用苯酚抽提2次,氯仿抽提1次。E.加两倍体积无水乙醇,1/10体积醋酸钾(3M,pH8.0),-20度保存1小时后,13000rpm离心15min,弃上清液,沉淀用70%乙醇洗2次;置于室温干燥后,溶于50ulTE溶液中,置4℃保存备用。2蛋白酶/SDS

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