一套适合于玉米品种鉴定和DNA指纹库构建的SSR核心引物的确定

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1、沈阳农业大学硕士学位论文一套适合于玉米品种鉴定和DNA指纹库构建的SSR核心引物的确定姓名：于新艳申请学位级别：硕士专业：作物遗传育种指导教师：王玺;赵久然20070601独创性声明，本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。尽我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得沈阳农业大学或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了谢意。研究生签名：导师签名：寸歇袍帆2。司年<月．I午Pz亏、7帆∽7年石月俨日关于论文知识产权和使用授权

2、的说明本论文的知识产权为沈阳农业大学所有。本人完全了解沈阳农业大学有关保留、使用学位论文的规定，即：学校有权保留送交论文的复印件和磁盘，允许论文被查阅和借阅，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同意沈阳农业大学可以用不同方式在不同媒体上发表、传播学位论文的内容。学位论文中的所有内容不经沈阳农业大学授权不得以任何方式擅自对外发表。(保密的学位论文在解密后应遵守此协议)研究生签名：亍；氟{也时问：2001年√月J午日导师签名：了／0时间：砂呷年‘月r≯日时间：驯年6月r仁日沈阳农业大学硕士学位论文摘要玉米品种DNA指纹数据库的构建在玉米品种纯度及真实性鉴定、品种权登记保护、区

3、试及审定品种质量监控等方面具有重要应用价值，对理清我国玉米种质的血缘关系、杂种优势群划分、种质创新及新品种选育具有重要指导意义。本论文研究目的是以SSR标记为技术手段，通过对玉米基因组SSR核心引物的筛选，软件评估和设计引物、探讨引物设计中的优化问题——改善C,-C含量过高引物的扩增效果等玉米DNA指纹库构建的关键技术环节进行了研究。本论文形成如下研究结果：(1)依据网上和文献上提供的信息，从玉米数据库公布的1900多对SSR引物中“初步筛选出800对引物，通过实验室用15个骨干自交系复筛，统计196对引物的多态性信息。(2)筛选出分布于玉米10条染色体的500对SSR引物，其中包含实验室

4、筛选和文献资料的高多态性引物，并构建分子遗传图谱。(3)利用15个杂交种对引物杂合带型表现是否正常进行筛选，剔除杂合率低的引物，确定一套在玉米染色体上均匀分布的多态性高、带型分布合理的建库用的100对核心引物。从每条染色体的长臂和短臂各取1对，20对作为建库的基本核心引物，20对作为扩展核心引物以作进一步遗传检测备用。(4)利用引物设计软件对核心引物进行重新优化设计，确定了引物设计的原则，尤其是确定了玉米SSR引物的设计原则，并详细说明了引物设计的全过程。(5)从引物设计角度分析原引物的问题及原因，共设计了123个引物位点，其中合成了56个引物位点，145对引物，对合成的引物反复进行研究，

5、实验筛选。(6)从体系优化方面改善了GC含量过高的引物的扩增效果，最终92对新设计的引物扩增效果较好，入选以便进行多重PCR组合。关键词：玉米，SSR，DNA指纹数据库，核心引物，引物设计摘要AbstractTheconstructionofmaizeDNAfingerprintingdatabaseisofimportantvalueinmaizepurity&identitytesting,varietyrightprotection，yarietyqualityinspectioninregionaltrial，andisofsignificanceinheteroticgroup，

6、germplasminnovationandvarietybreeding．TheobjectiveofthisstudyistoestablishthetechnicalplatformofmaizestandardDNAfingerprintdatabasethroughthekeytechnicofcoreprimerpairselection,evaluatingandredesignoftheprimerpairs,discussingoptimizingprimerpairsinweakeningthenon—differentialbentandimprovingexpand

7、ingresultsofhighGCcontentprimerpairs，thentoCOnstructstandardDNAfingerprintingdatabaseofChinesemaizenewvarieties,andexploretheprobableapplicationwayofSSRtechniqueinmaizevarietyidentification．Themainresultsweresumm