植物中氨酰tRNA合成酶及相应tRNA的统计分析

《植物中氨酰tRNA合成酶及相应tRNA的统计分析》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、硕士学位论文圈盈作者姓名：韭玉玉指导教师：昱佳娅簋±副巫宜垦生国越堂院j匕宝基因组班宜压学位类别：理坐亟±一．学科专业：生塑值皇堂研究所：生重整堂院j匕塞基因组班宜匮2013年4月Thistatisticalanalysisforaminoacyl-tRNAsynthetasesestatistical●■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■●■■●■■●■■■■■●●●●●■■■■■■__________一IIIIR1___-_________-·____________。一andtheircognatetRNAsinplants■■

2、■■■●■●●■■■■■■■■■■■■■●■■■■■■■■■---一Ri-—●ByZhangYuyuADissertationSubmittedtoUniversityofChineseAcademyofSciencesInpartialfulfillmentoftherequirementForthedegreeofMasterofBioinformaticsBeijingInstituteofGenomicsChineseAcademyofSciencesApril，2013关于学位论文使用授权的声明本人完全了解中国科学院北京基因组研究所有

3、关保留、使用学位论文的规定，同意中国科学院北京基因组研究所有权保留学位论文的副本，允许论文被查阅和借阅；中国科学院北京基因组研究所可以公布该论文的全部或部分内容，可以采用影印、缩印或其他复制手段保存论文。(涉密的学位论文在解密后应遵守此规定)学位论文作者(签名)：弥否云日期：幻侈．歹．19关于学位论文原创性申明本人郑重申明：所呈交的学位论文是本人在导师的指导下，独立进行研究所取得的成果。尽我所知，除文中已经注明引用的内容外，本学位论文的研究成果不包含任何其他入享有著作权的内容。对本文的研究做出重要贡献的个人和集体，均己在文中以明确方式标明。学位

4、论文作者(签名)：豫丕丢日期：加lj．F．Ir，致谢本论文是在中国科学院北京基因组研究所吴佳妍博士的指导下完成的。非常感谢吴老师这三年来对我生活学习各方面的鼓励、帮助和教导。吴老师的严谨细心、才思敏捷给我留下了深刻的印象。非常感谢肖老师在科研方面细心的指导和关怀。感谢现在实验室的每一位师兄和师姐在科研和生活上的关怀和帮助。感谢每一位同年级的同学，共同学习、共同进步，一起渡过了美好的研究生生活。感谢实验室的秘书、工作人员为实验室的正常运行做出了贡献。感谢各位学妹为实验室增加了更多力量和欢乐。实验室的所有人共同营造了和谐的实验室氛围，将让我永远难忘

5、。感谢研究生办公室的王彩平、陈婧、陈著三位老师对我们学生工作的帮助和支持。感谢我的家人和朋友，感谢我的父母含辛茹苦把我养大成人，永远是我背后的坚强后盾，感谢我的朋友在我成长过程的帮助和陪伴。张玉玉2013年3月植物中氨酰tRNA合成酶及相应tRNA的统计分析II摘要tRNA(TransferRNA；转移RNA)和aaRS(Aminoaeyl．tRNAsynthetases；氨酰tRNA合成酶)在蛋白质合成过程中起重要作用。aaRS催化tRNA连接相应的氨基酸，只有正确的氨基酸与正确的tRNA连接，才能保证遗传信息的一致性。tRNA和aaRS的起

6、源可以追溯到生命起源时密码子的建立和蛋白质合成系统的合成。tRNA的最初形式只包含受体臂和T、I，C臂的RNA小螺旋，aaRS最初为具有氨酰化作用的核酶。随着生命的进化，原始tRNA形成了完整结构，执行氨酰化作用的核酶逐渐被aaRS代替。根据内共生学说，植物的线粒体起源于好氧性细菌a变形杆菌，叶绿体起源于光合自养原核生物蓝细菌。0【变形杆菌和蓝细菌进化为细胞器的过程中，大部分细菌的基因丢失或者转移到核基因组，包括tRNA和aaRS。本论文中选取了涵盖单子叶植物、双子叶植物、藻类和苔藓的11个物种进行研究，讨论了植物线粒体、叶绿体和细胞核中的tR

7、NA、aaRS分布特点及规律。大部分可以进行光合作用植物的叶绿体拥有所有需要的全部tRNA，目前还没有发现叶绿体中存在来源于细胞核的tRNA。但是大部分现存真核生物的线粒体中都没有足够的tRNA基因，莱茵衣藻(Chlamydomonasreinhardtii)的线粒体只有3种tRNA。线粒体和叶绿体基因组的全部aaRS基因丢失或转移到核基因组。为了保证线粒体和叶绿体中蛋白质的合成，需要从细胞质中导入所需的tRNA和aaRS。细胞核中与tRNA相关的序列包括假基因、SINE、起源于细胞器的tRNA以及真tRNA。从物种的角度看，玉米和葡萄细胞核的

8、假基因比例和SINE的比例明显多于其他物种。从每种氨基酸对应的tRNA角度看，Lys．tRNA的SINE的个数和比例最大。根据同源性和系统发生分析发现