海岛棉染色体组特异重复序列的筛选及亚克隆分析

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1、分类号：华中农业大学硕士学位论文海岛棉染色体组特异重复序列的筛选及亚克隆分析一王8301．工3密级：ScreeningofgenomespecificrepetitivesequencerelatedwithGbarbadenseandsubcloninganalysis研究生：杨晓芳指导教师：王坤波研究员指导小组：王坤波研究员专业：作物遗传育种获得学位名称：农学硕士研究方向：棉花分子生物学获得学位时间：2010年6月华中农业大学植物科学技术学院二零一零年六月一苓一苓，牛／、月I

2、IIIIIIIIIIIIIIIIIY1799394华中农业大学学位论文独创性声明及使

3、用授权书学位论文是否保密系如需保密，解密时间年月日独创性声明本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。尽我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得华中农业大学或其他教育机构的_y-位或证书而使用过的材料，指导教师对此进行了审定。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中做了明确的说明，并表示了谢意。研究蚴：捣谚也嘭帆川年办／日学位论文使用授权书撇黼鲐船观荔删名：≥砷矽签名日期：2州‘)年／月f日签名日期：x，。年∥月弓日注：请将本表直接装订在学位论文的扉页和目录之

4、间目录摘要⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯IAbstract⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．Ⅲ缩略语表⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．V第一章：文献综述⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯11．1重复序列的种类⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．11．1．1串联重复序列⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯11．1．1．1端粒重复序列(TelomericRepeats)⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．11．1．1．2核糖体RNA基因⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯11．1．1．3着丝粒串联重复序列家族⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．21．1．1．4亚端粒或臂

5、间卫星DNA家族⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．31．1．2散布重复序列⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯31．1．2．1转座因子(transposableelements)⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．41．1．2．2反转录因子(retroelements)⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．41．1．2．3短散布核因子(SINEs)⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．51．1．2．4其它散布重复序列⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．51．2重复序列的功能与应用⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．⋯⋯61．3重复序列的分离和克隆方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯81．3．1超高速离心法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

6、⋯⋯⋯⋯81．3．2重复序列中单酶切位点的酶酶切基因组法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯81．3．3重复序列特异结合免疫蛋白法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．91．3．4BAC或其它文库筛选法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．91．4棉属中重复序列的研究概况⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．101．4．1棉属植物基因组简介⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．101．4．2棉花重复序列的同步进化⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．101．4．2．118S-26SrDNA的同步进化⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．111．4．2．25SrDNA的同步进化⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．111．4．2．3基因组的同步进化

7、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯111．5植物荧光原位杂交的原理及其发展⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．121．5．1荧光原位杂交技术的原理⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．121．5．2荧光原位杂交技术的发展⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．121．5．3荧光原位杂交技术的分类⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．131．5．4荧光原位杂交在植物研究中的应用⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．141．6菌落原位杂交⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯151．7本研究目的与意义⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．16第二章材料与方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．172．1实验材料⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

8、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．172．1．1BAC文库⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．172．1．2实验所用靶DNA⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．172．1．3试剂⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．182．2试验方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．182．2．1DNA提取⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．182．2．1．1Pima-90基因组DNA提取⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．182．2．1．2BACDNA提取⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．192．2．2菌落原位杂交⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．202．2．2．1高密度杂交膜的制备⋯⋯⋯⋯

9、⋯⋯⋯⋯⋯