棉花bZIP转录因子基因GhbZIP15的克隆与表达分析

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1、棉花学报CottonScience2015袁27渊6冤院515―523棉花bZIP转录因子基因15的克隆与表达分析**李月袁许朋斐袁陈全家袁代培红袁刘超袁曲延英袁刘晓东渊新疆农业大学农学院/农业生物技术重点实验室袁新疆乌鲁木齐830052冤摘要院bZIP转录因子在植物抵御各种逆境胁迫中有重要作用遥本研究依据生物信息学分析袁采用RT-PCR渊Reversetranscriptionpolymerasechainreaction冤方法从棉花中克隆了一个bZIP转录因子基因袁命名为15渊GenBank登录号为KP938

2、299冤遥该基因cDNA全长1980bp袁其开放阅读框为966bp袁编码321个氨基酸的蛋白袁预测分子量为37.1kD袁等电点为7.44遥SMART蛋白结构预测发现袁该蛋白含有bZIP家族典型的BRLZ碱性结构域和亮氨酸拉链袁属于B-zip1家族遥系统进化树分析表明GhbZIP15属于bZIP转录因子AREB亚家族袁和拟南芥A亚家族的AtbZIP12袁AtABF1和AtABF2亲缘关系最近遥洋葱表皮细胞中瞬时表达分析表明袁GhbZIP15主要定位于细胞核中遥RT-PCR分析表明15对干旱尧高盐尧低温等处理都有一定

3、程度的响应袁推测该基因对棉花非生物胁迫的调控起重要作用遥关键词院棉花曰bZIP转录因子曰非生物胁迫曰15曰克隆表达中图分类号院S562.035文献标志码院A文章编号院1002-7807渊2015冤06-0515-0910.11963/issn.1002-7807.201506003**LiYue,XuPengfei,ChenQuanjia,DaiPeihong,LiuChao,QuYanying,LiuXiaodong(830052,)bZIPtranscriptionfactorsareimportantpro

4、teinsinvolvedinresponsetoabioticstressesinplants.Inthisstudy,ageneencodingbZIPtranscriptionfactorwasisolatedincottonusingreversetranscriptionpolymerasechainreaction(RT-PCR)ac-cordingtobioinformaticanalysis.Thegenewasnamed15(GenBankaccessionNo.KP938299).Sequen

5、ceanalysisshowedthatthefull-lengthof15genewas1980bp,containinga966bpopenreadingframewhichencodedaproteinof321aminoacidswithpredictedmolecularweightof37.1kDandanisoelectricpointof7.44.SMARTanalysisshowedthatGh-bZIP15containsatypicalBRLZmotif(basicregiondomaina

6、ndleucinezipperdomain)oftheB-zip1family.Phylogeneticanal-ysisrevealedthatGhbZIP15belongedtotheAREBsubfamilyofthebZIPfamilyandwasrelatedcloselytoAtbZIP12,AtABF1andAtABF2.15waslocalizedinsidethenucleioftransformedonionepidermalcells.RT-PCRanalysisindicatedthat1

7、5geneexpressionchangedwithdifferentresponsetovariousabioticstresses(dehydration,highsalinity,andlowtem-perature),indicatingthatitmayplayimportantrolesintheadaptationtoabioticstressesincotton.cotton;bZIPtranscriptionfactor;abioticstress;15;cloningandexpression

8、植物在生长发育过程中会面临各种逆境胁制袁涉及生理尧生化和与胁迫信号感知尧信号传迫袁其中非生物胁迫渊低温尧干旱和高盐冤是影响导尧基因表达相关的分子调控过程袁最终通过代[1]植物生长发育尧导致作物减产的主要因素遥植物谢调控阻止细胞发生损伤遥转录因子是指能与作为固着生物袁不能趋利避害袁为了适应这些不顺式作用元件结合袁启动下游一系列调控基因表利的环境袁植物体内形成了一套复杂的调控