胃癌相关circRNA的筛选、验证及hsacirc0033634的功能、机制研究

胃癌相关circRNA的筛选、验证及hsacirc0033634的功能、机制研究

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1、分类号:R735.2密级:公开研究生学位论文胃癌相关circRNA的筛选、验证及论文题目(中文)hsa_circ_0033634的功能、机制研究ScreeningandverificationofcircularRNA论文题目(外文)andresearchontheroleandmechanismofhsa_circ_0033634ingastriccancer研究生姓名谢富佳学科、专业临床医学·外科学研究方向消化系统肿瘤学位级别博士导师姓名、职称曹农教授论文工作起止年月2016年01月至2018年09月论文提交日期2018年10月

2、论文答辩日期2018年11月学位授予日期2018年12月校址:甘肃省兰州市胃癌相关circRNA的筛选、验证及hsa_circ_0033634的功能、机制研究中文摘要第一部分:胃癌患者血浆中差异表达circRNA的筛选目的:构建胃癌血浆circRNA表达谱,筛选出差异表达的circRNA基因。方法:采用circRNA基因芯片技术,获取circRNA在胃癌患者和正常体检者血浆中的表达谱,筛选出表达上调或下调2倍以上的circRNA,并通过GO富集分析和KEGG信号通路富集分析,进一步筛选出胃癌标志物的候选circRNA。结果:通过分析

3、胃癌相关circRNA表达谱,共发现566种circRNA在胃癌患者和正常体检者间存在显著性差异(P<0.05),其中68种circRNA表达水平差异超过2倍(28种高表达,40种低表达)。进一步行生物信息学分析,最终筛选得到20个候选circRNA基因(8种高表达,12种低表达)。结论:成功构建了胃癌相关血浆circRNA表达谱,并初步筛选出在胃癌血浆中存在表达差异的20个circRNA基因。第二部分:初筛circRNA在胃癌血浆中的表达目的:验证初筛circRNA在胃癌血浆中的表达情况,并探讨其与胃癌临床病理特征的相关性。方法:

4、收集胃癌患者和健康体检者血浆各80例,利用qRT-PCR的方法对筛选结果进行验证,并结合患者年龄、性别、肿瘤大小、TNM分期、组织分级、淋巴结转移等临床资料和病理特征,初步阐明胃癌相关circRNA的临床病理意义。结果:从20个circRNA基因中验证到4个circRNA的表达,其中hsa_circ_0010697、hsa_circ_0025603和hsa_circ_0051494在血浆中的表达与胃癌无明显相关性(P>0.05);hsa_circ_0033634在胃癌患者血浆中显著性升高(P<0.05),ROC曲线下面积为0.739

5、(95%CI:0.661-0.818),灵敏度和特异度为78.8%和68.7%,且hsa_circ_0033634与胃癌的淋巴结转移相关(P<0.05)。结论:hsa_circ_0033634可能参与了胃癌的侵袭转移过程,对胃癌的诊断和预后评估具有一定的临床价值,可作为胃癌潜在的生物学标志物。第三部分:hsa_circ_0033634对胃癌生物学行为的调控作用目的:探讨hsa_circ_0033634对胃癌细胞生物学行为的影响,深入了解Ihsa_circ_0033634与胃癌的关系。方法:采用慢病毒感染技术建立hsa_circ_00

6、33634过表达胃癌细胞SGC-7901模型,并通过qRT-PCR、CCK-8、流式细胞试验、Transwell细胞迁移和侵袭试验等分析过表达hsa_circ_0033634对胃癌细胞增殖、凋亡、迁移、侵袭等生物学行为的影响。结果:hsa_circ_0033634在过表达胃癌细胞中的表达水平为3.47±0.13,显著高于阴性对照组的0.91±0.05(P<0.05)。转染hsa_circ_0033634mimics后,胃癌细胞SGC-7901的增殖能力逐渐增强,迁移能力和侵袭能力显著增高(P<0.05),但细胞凋亡率无显著变化(P>

7、0.05)。结论:hsa_circ_0033634能促进胃癌细胞增殖,并增强胃癌细胞的迁移和侵袭能力,在肿瘤发生、发展过程中发挥正性调控作用。第四部分:hsa_circ_0033634参与胃癌发生发展的机制研究目的:探讨hsa_circ_0033634对下游miRNA生物学功能的影响,并探索hsa_circ_0033634在胃癌发生发展中的分子机制。方法:利用生物信息学方法预测hsa_circ_0033634的下游miRNA及其靶基因,并采用qRT-PCR技术验证筛选的miRNA,然后利用流式细胞试验、tranwell试验等细胞功能

8、学实验方法探索hsa_circ_0033634对miRNA生物学功能的影响,最后采用Westernblot技术验证hsa_circ_0033634和筛选的miRNA对靶基因表达的影响。结果:生物信息学和文献检索联合分析筛选出hsa-m

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