鲍曼不动杆菌裂解性噬菌体XW-59的分离鉴定和全基因组序列分析

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1、分类号：R372单位代码：10183研究生学号：2015712042密级：公开研究生学位论文题目吉林大学硕士学位论文（学术学位）鲍曼不动杆菌裂解性噬菌体XW-59的分离鉴定和全基因组序列分析作CharacterizationandGenomesequenceanalysisofalytic者姓BacteriophageXW-59infectingAcinetobacterbaumannii名作者姓名：吴浠闻专业：病原生物学研究方向：细菌分子耐药遗传学和噬菌体疗法指导教师：李菁华教授培养单位：基础医学院2018年5

2、月鲍曼不动杆菌裂解性噬菌体XW-59的分离鉴定和全基因组序列分析CharacterizationandGenomesequenceanalysisofalyticBacteriophageXW-59infectingAcinetobacterbaumannii作者姓名：吴浠闻专业名称：病原生物学指导教师：李菁华学位类别：医学硕士答辩日期：年月日未经本论文作者的书面授权，依法收存和保管本论文书面版本、电子版本的任何单位和个人，均不得对本论文的全部或部分内容进行任何形式的复制、修改、发行、出租、改编等有碍作者著作权的

3、商业性使用（但纯学术性使用不在此限）。否则，应承担侵权的法律责任。吉林大学硕士学位论文原创性声明本人郑重声明：所呈交学位论文，是本人在指导教师的指导下，独立进行研究工作所取得的成果。除文中已经注明引用的内容外，本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的作品成果。对本文的研究做出重要贡献的个人和集体，均已在文中以明确方式标明。本人完全意识到本声明的法律结果由本人承担。学位论文作者签名：日期：年月日《中国优秀博硕士学位论文全文数据库》投稿声明研究生院：本人同意《中国优秀博硕士学位论文全文数据库》出版章程的内容，

4、愿意将本人的学位论文委托研究生院向中国学术期刊（光盘版）电子杂志社的《中国优秀博硕士学位论文全文数据库》投稿，希望《中国优秀博硕士学位论文全文数据库》给予出版，并同意在《中国博硕士学位论文评价数据库》和CNKI系列数据库中使用，同意按章程规定享受相关权益。论文级别：■硕士□博士学科专业：病原生物学论文题目：鲍曼不动杆菌裂解性噬菌体XW-59的分离鉴定和全基因组序列分析作者签名：指导教师签名：年月日作者联系地址（邮编）：作者联系电话：中文摘要鲍曼不动杆菌（Acinetobacterbaumannii）是专性需氧的、

5、非发酵的革兰阴性杆菌，广泛分布于自然界中，属于条件致病菌。临床资料显示，在感染标本中鲍曼不动杆菌的检出率不断上升，现普遍认为鲍曼不动杆菌是引起医院内感染的重要病原菌之一。另一方面，鲍曼不动杆菌多重耐药菌株和泛耐药菌株的出现造成抗生素疗效的下降。因此，鲍曼不动杆菌严重威胁着免疫功能缺陷的住院病人（如接受放疗和化疗的肿瘤患者、接受器官移植的病人、大面积烧伤患者和患有各种慢性疾病的老年人）。鲍曼不动杆菌引起的感染和日趋严重的耐药性已成为人们关注的公共卫生问题。近十几年来有关利用噬菌体用于耐药性细菌感染又引起人们的兴趣。

6、本研究目的是通过研究鲍曼不动杆菌裂解性噬菌体的生物学特性，为噬菌体疗法应用于细菌性感染提供依据。采用双层琼脂法以鲍曼不动杆菌为宿主菌从环境污水中分离到一株裂解性噬菌体，命名为XW-59。通过电镜观察，噬菌体XW-59的形态学特征符合有尾噬菌体目(CaudoviralesOrder)、短尾病毒科(PodoviridaeFamily)噬菌体。噬菌体XW-59的最佳感染复数为10。一步生长曲线显示，噬菌体XW-59的潜伏期为10min，爆发期为30min。稳定性试验表明，噬菌体XW-59在60℃1h的条件下和在pH4～

7、10的范围仍保持其裂解活性。将提取并纯化的噬菌体XW-59的基因组提交至联川生物技术有限公司（杭州，中国）进行基因测序，测序平台为IlluminaHiSeqPE150。结果表明，噬菌体XW-59基因组为双链DNA、由40，958bp组成，G＋C含量为39.42%，未发现tRNA。利用GeneMarks软件并结合RAST软件对基因组进行注释。结果发现，噬菌体XW-59基因组含有50个编码序列(Codingsequences,CDSs),其中13个编码序列可预测其功能，37个编码序列为未知基因。通过BLASTn在线软

8、件比对，噬菌体XW-59基因序列与鲍曼不动杆菌噬菌体vB_baM_IME200具有很高的同源性。综上所述，噬菌体XW-59对鲍曼不动杆菌具有较好的裂解活性，而基因组序列分析将有助于今后深入研究噬菌体在鲍曼不动杆菌感染中的应用。关键词：噬菌体、鲍曼不动杆菌、生物学特性、基因组分析IABSTRACTCharacterizationandGenomesequenceanalys