水稻无侧根基因精细定位及其候选基因分析

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1、＜ｉ－０３６４：５ｒ１：１分类号ｌ单位代码＝学号：１１００＞Ｔ密级＿＿＿＿＿＿＿＿＿＼＾｝在微恭！ｙ：大擘学位论文水稻无侧根基因精细定位及其候选基因分析Ｆ－－ｉｎｅＭａｐｐｉｎａｎｄＣａｎｄｉｄａｔｅｅｎｅａｎａｌｓｉｓｏｆｌａｃｋｌａｔｅｒａｌｒｏｏｔｇｇｙｉｎｒｉｃｅ研宄生：指导教师：石英尧副教授合作指导教师：朴钟泽研究员申请学位门类级别：农学硕士专业名称：作物遗传育种研究方向：水稻分子遗传育种—所在学院：农学院

2、答辩委员会主席：２０１６年＆月DisserationfortheMasterDegreeinAgronomyFineMappingandCandidategeneanalysisoflack-lateral-rootmutantriceRM109Candidate:ZengWeiSupervisor:DrPiaoZhongzeandDrShiYingyaoAcedemicDegreeAppliedfor:MasterofAgronomySpeciality:CropGeneticsandBreedingAnhu

3、iAgriculturalUniversityJune,2016X独创性声明本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研宂成果。尽我所知，论文，除了文屮特別加以标注和致谢的地方外中不包含其他人己经发表或撰写过的研究成果，也不毡含为获得安黴农业大学或其它教育机构的学位或证书一而使用过的材料。￣我同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表不了谢意。１６研究生签名：％氣时间：２０年士月口关于论文使用授权的说明，即本人完全了解安徽农业大学有关保留：学校有权保

4、留、使用学位论文的规定送交论文的复印件和磁盘，允许论文被查阅和借阅，可以采用影印、缩印或扫描等复、制手段保存、汇编学位论文。同意安徽农业大学可以用不同方式在不同媒体上发表传播学位论文的全部或部分内容。（保密的学位论文在解密后应遵守此协议）、研究生签名：窄義时间：２０１６年＆月１丨」…６第导师签名：时间：２０１年ｇ月曰ＩＩ摘要水稻根系有着吸收水分、矿物质及固持植物体的重要功能，另外根系还有繁殖、合成生长调节剂和贮存合成有机物质的作用。本研究以RM109/密阳23的F4代含有2840个家系的重

5、组自交系群体为材料，根据侧根密度分为9类，对水稻的冠根根粗、胚根根粗、根长、株高、单株有效分蘖等性状进行了多重比较分析。从F4群体选取710株显性单株（完全无侧根）用于精细定位，通过候选基因预测对目的基因LRT1进行了分析。主要研究结果如下：1.水稻不同侧根密度类型之间，冠根的根粗没有显著差异，胚根的根粗仅LR1与LR7存在显著差异，说明水稻侧根的缺失不影响根粗。不同侧根密度类型之间，根长有一定差异，LR4与LR3、LR8、LR9存在显著差异，与LR8存在极显著差异。说明冠根无侧根而胚根有侧根会影响根的长度，完全无侧根在幼苗期

6、不影响根长生长。9类侧根密度之间，株高与分蘖数存在显著差异，说明水稻侧根的存在对株高和分蘖的生长发育起着重要的作用。2.不同侧根密度与农艺性状的相关性分析表明，侧根密度与株高、单株有效分蘖数、单株生物产量之间存在极显著正相关关系，与稻米的外观品质、粘度值相关不显著。3.利用710株极性显性单株（完全无侧根）用于精细定位，利用侧根突变体基因LRT1两侧紧密连锁的SSR标记（RM15826和RM1038）对710株无侧根单株叶片基因组DNA进行PCR分析，筛选出57个重组单株。进一步利用在RM15826与RM1038两标记之间新发

7、掘出的11对SSR多态性标记和9对多态性InDel标记对57个重组单株进行基因型分析，最终将目的基因精确定位在InDel1与R15909之间的183Kb片段上，位于水稻第3号染色体上。4.根据InDel1与R15909标记的物理位置，利用水稻基因组数据库网站(http://rice.plantbiology.msu.edu/cgi-bin/gbrowse/rice#search)对该区段DNA序列进行在线分析，预测到26个候选基因，测序结果表明，LOC_Os03g53150.1基因为无侧根基因的候选基因。关键词：水稻，无侧根，

8、精细定位，候选基因XIAbstractRicerootscanabsorbmoistureandmineralsandfixplant.Inaddition,rootscanbeself-reproduction,producingsyntheticgrowthregulat