家蚕浓核病毒(镇江株)部分核苷酸序列分析及主要结构蛋白基因(vp)的表达

家蚕浓核病毒(镇江株)部分核苷酸序列分析及主要结构蛋白基因(vp)的表达

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时间:2019-05-16

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1、家蚕浓核病毒(镇江株)部分核苷酸序列分析及主要结构蛋白基因(叩)的表达中文摘要本文对家蚕浓核病毒(BombyxmoriDensovims,BmDNV)(镇江株)的部分核苷酸序列进行了研究,克隆并用火肠杆菌表达了主要结构蛋白基因,试图从分子水平、基因水平对它与山梨株的亲缘关系进行探讨。.根据己发表的日本山梨株的序列片段1(VDl)设计了一对引物,克隆了1.5Kb的土要结构蛋白基因(印),测序并用Dna-Star软件分析了两者的同源性。该片段与山梨株VD】一ORF2的同源性为98.1%,有29处核苷酸发生了突变:推测的氨基酸序列与山

2、梨株的同源性为98.6%,有7个氨基酸发生了替换。该序列已经在GeneBank登录,登录号为AY236978二.根据已发表的日本山梨株的序列片段2(VD2)在两个开放阅读框(ORFs)之间设训了一对引物,扩增得到了992bp位于两个开放阅读框(ORFs)之间的一个片段,测序并用Dna一所口r软件分析了两者的同源性。该片段与BmDNV山梨株相戍部分的同源性为98.5%.位于两个开放阅读框(oRFs)之间的序列有缺失或插入突变。三.在NCBI数据库中用Blast软件在线检索,除家蚕浓核病毒山梨株DNA外.未发现其他同源序列。四.将病

3、毒的主要结构蛋白基因(甲)插入到表达质粒pET.28a多克隆位点BamHI与&oRI之间,使其位于诱导型启动子LaeZ之后,转化到BL21(DE3)菌株,进行了诱导表达。表达产物在SDS.聚丙烯酰胺凝胶电泳中呈现特异的条带,大小约为53KD,与预计的大小大致相近。用Western-blowing检测表达产物,可以与病毒的抗体产生特异的反应,表明其为病毒的结构蛋白基冈。五.上述结果表明,BmDNV镇江株和山梨株一样,病毒的基因组是由两个片段组成,并且两者的核菅酸序列有很高的同源性(商达98%以上),而与其他浓核病毒的核营酸序列没有

4、同源性,可以认为两者是同种病毒的不同分离株。关键词家蚕浓核病毒(镇江株)主要结构蛋白基因克隆表达WesternblowingAnalysisofPartialDNASequencesofBombyxmoriDensovirus(Zhenjiangstain)andExpressionofItsMajorStructuralProtein(vp)GeneinEscherichiacoliAbstractAnattempttoidentifytherelationshipbetweenBombyxmarlDensovirus(BmD

5、NV)ZhenjiangstrainandBmDNVYamanashistrain,partialDNAsequencesofBmDNV(Zhenjiangstrain)weredeterminedandcomparedwiththecorrespondingregionofBmDNV(Yamanashistrain).Themajorviralstructuralprotein(vp)gonewasexpressedbyEscheriehiacoli(EcoldexpressionsystemandexaminedbyWest

6、ern—blottingassay.1.BasedonnucleotidesequencesofBmDNV(Yamanashistrain)VD]segment,oligonuclotideprimerswasdesigned.Employingthedesigned·primers,afragmentofnucleotidesequencesabout1-5Kb,whichisspeculatedtobethemajorstructuralprotein(vp)gene,wasamplifiedfromthegenomicDN

7、AofBmDNV(Zhenjiangstrain)bypolymerasechainreaction(PCR).SequencedandanalyzedwithDna-starsoftware,thenucleotidesequenceoftheclonedstructuralprotein(vp)goneanditsdeducedaminoacidsequencearehighlyhomologouswithitshomoiogueinBmDNVYamanashistrain.withtheidentityof98.1%and

8、98.6%respectively.ComparedwithYamanashistrain,29basesand7aminoacidsofthevpgoneweresubstitutedinZhenjiangstrain,respectively.Noreadi

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