集胞藻PCC6803的RBP1和EFTs在诱导获得寒冷光照耐受性中的作用

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1、ChineseAcademyofSciencesDoctoralDissertationTheroleofRBPlandEF—Tsintheacquiredchill-fighttoleranceofSynechocystissp．PCC6803TanXiaomingDirectedbyProf．XuXudongInstituteofHydrobiology，ChineseAcademyofSciencesWuhan，Hubei，430072May，2009目录目录JIlllUMJllllIIIJJnlUJUlJJY2430853缩略语表⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

2、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯Ⅳ摘要⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯VIAbstract．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．⋯．．．．．．．．．．．．．．．⋯．⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．⋯．．．．VIII第一章文献综述⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．11集胞藻PCC6803的研究背景⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯11．1集胞藻PCC6803概述⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯11．2集胞藻PCC6803的基因

3、组⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯11．3集胞藻PCC6803的遗传操作系统⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯21．3．1转化和接合转移⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯21．3．2基因突变及突变株的筛选⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯31．3．3报告基因⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯41．4集胞藻PCC6803功能基因学的研究⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯51．4．1基因的系统敲除⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯51．4．2集胞藻PCC6803的转录组学研究⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．61．4．3集胞藻PCC6803的蛋白质组学研究⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

4、⋯⋯．91．4．3．1蛋白组学研究方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯91．4．3．2集胞藻PCC6803的蛋白组学研究⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯112蓝藻适应低温的机理⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯132．1脂酰脱饱和酶在低温适应中的作用⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯142．1．1蓝藻的生物膜的组成和脱饱和酶⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．142．1．2低温对膜脂脂肪酸组成的影响⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．152．1．3des基因低温条件下的转录和调控⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一152．1．4膜脂组成与蓝藻低温适应能力⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．172．2低温诱导表达的蛋白⋯⋯

5、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯192．2．1RNA结合蛋白(RNA-bindingprotein，P03P)⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯192．2．1．1蓝藻的RNA结合蛋白的结构⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯192．2．1．2蓝藻的，．印基因的转录⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一202．2．1．3蓝藻的柏p基因对于蓝藻适应低温的影响⋯⋯⋯⋯一202．2．1．4蓝藻的rbp基因的调控⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．212．2．2其它低温诱导表达蛋白⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．222．2．2．1RNA解旋酶⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯222．2．2．2Clp蛋白家族⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

6、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯222．2．2．3核糖体蛋白⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一232．3低温信号的感受及信号传导⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯232．3．1生物膜⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．232．3．2双元信号传导系统⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．242．4本实验室的ACLT研究⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯243本研究的目的和总体设计⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯25第二章寒冷光照胁迫对集胞藻PCC6803蛋白表达谱的影响⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．271材料和方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯27目

7、录1．1藻株、培养条件和样品的收集⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯271．2双向电泳蛋白样品的制备⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯281．3蛋白样品的定量⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯281．4双向电泳操作步骤⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯291．4．1IEF胶条的灌制及IEF电泳装置的组装⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一291．4．2第一向等电聚焦(IEF)电泳⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．291．4．3IEF胶条的挤出及胶条的平衡⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．291．4．4第二向电泳即SDS．PAGE⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．301．4．5PAG

8、E胶的染色和脱色⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯