利用微卫星DNA分析栽培种花生多态性及遗传关系

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1、广西大学硕士学位论文利用微卫星DNA分析栽培种花生多态性及遗传关系姓名:韩柱强申请学位级别:硕士专业:作物遗传育种指导教师:韦鹏霄2003.5.1广西大学硕士毕业论文利用微卫星Di"4A分析栽培种花生多态性及遗传关系利用徽卫星D№分析栽培种花生多态性及遗传关系摘要/花生是一种重要的经济作物和油料作物,尽管其在形态、生理和农艺性状等方面存在着广泛的差异,但早期利用RFLP、RAPD等分子标记技术研究发现,花生栽培种DNA多态性极其贫乏。厂微卫星DNA(SSR)是近年来发展的一种新的分子标记,由于这种标记在基因组内含量丰富,变异水平高,结果可靠而被广泛应用。本研究利用11对微卫星DNA

2、(SSR)引物对栽培种花生进行多态性分析,其中4个表现出明显的多态性。4对弓l物在24个品种上共检测到33个等位基因变异,每一对引物检测到的等位基因变异数为5-13个,平均为8.25个。利用4对SSR引物,可以将24个品种中的21个相互区分。/根据SSR标记数据计算24个供试品种阔的遗传相似系数,其变化范围在0.2-1.0之间,平均为0.4788。经聚类分析,在阀值0.463水平上,所有品种聚为I、

3、l两大类;I、II两类分别在阀值0。044、0.060水平上又各分为两个亚类。将SSR标记聚类与传统花生分类结果比较发现:在两个亚种与两个大类的水平上比较时,SSR标记聚类与传统花生分

4、类结果的重合率为79.绷;在四个变种与四个亚类水平上比较时,结果重合率为62.5%。,i夕—一本研究结果说明,微卫星DNA可以用来作为分析栽培种花生基因组DNA多态性和遗传关系的优良标记。关键词:微卫星DNA,花生>多态性}遗传关系>广西大学硕士毕业论文利用微卫星DNA分析栽培种花生多态性及遗传关系ANAIⅣSIS0NDNAPOLYMORPHISMAND(逦NETICRELATIONSHIPSINCULTIVATEDPEANUT(ARACHISHYPOGAEAL)USINGMICROSATELLITEMARKERSABSTRACTCultivatedpeanut(Arachishy

5、pogaeaL.)isanimportantcropforoilandcashworldwide.Despitetheexistenceofsubstantialdiversityamongcultivatedpeanutgenotypesforvariousmorphological,playsiologicalandagronomictraits,verylittleDNAvariationshadbeendetectedbyusingRFLPsandRAPDs.Microsatellitesorsinglesequencerepeats(SSR)havenowbeenreco

6、mmendedasstandardmarkersbecausemeyarehighlypolymorphic,highlyabudantandreliable.Inthepresentstudy,11SSRprimerpairswereusedtoamplifythegenomicDNAisolatedfrom24peanutgenogypesand4primersdetectedpolymorphismamongthegenotypesstudied.Atotalof33allelesweredetectedby4SSRloci.Theaveragenumberofalleles

7、perlocuswas8.25,andupto13alleleswerefoundatonelocus.Thegeneticsimilarity(GS)indexesamong24cultivatedpeanutaccessionsareculculatedbasedontheSSRmarkers.ThevalueofGSvariesfrom0.2to1.0,withanaverageof0.4788.TheresultsofUPGMAindicatedthatthe24accessionscouldbedividedintotwotypesat0.463,andeachtypec

8、ouldbedevidedintotwogroupsat0.044and0.060respectively.PeanutgenotypessortedbySSRmarkersaresimilar广西大学硕士毕业论文利用微卫星DNA分析栽培种花生多态性及遗传关系totheresultsobservedbyagronomictraits.with79.2%similari哆rateattwotypesand62.5%at4groupsrespectively.Theres

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