中国对虾微卫星!#多态性分析!

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1、第!"卷第#期$%%"年#月&&&!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!研究简讯!中国对虾微卫星!"#多态性分析!刘萍孟宪红孔杰庄志猛马春艳王清印中国水产科学研究院黄海水产研究所,青岛!""#$%摘要根据建立的中国对虾部分基因组文库,对筛选的含微卫星序列的克隆设计了引物,并选择了*对多态性引物对中国对虾进行了分析:实验材料为中国对虾黄渤海群体(<=)、朝鲜半岛西海岸群体(>?)和朝鲜半岛南海岸群体(>@)&个野生群共计"#个个体:结果表明:经*对引物对"#尾中国对虾进

2、行ABC扩增后,共获得了"%个等位基因:对&个野生群体的*个基因位点共计!(个群体位点进行了杂合度观测值(!")和杂和度期望值(!#)计算,通过<.9D6’EF/3GF94平衡偏离指数($)检验,发现有H个群体位点处于杂合子缺失状态,其中<=群体有&个群体位点杂合子缺失,>B和>@群体各有%个群体位点杂合子缺失:其次,对中国对虾&个野生群体遗传分化指数%&’值进行了计算,两两群体之间的%&’值均小于#:#H,说明中国对虾&个野生群体的遗传分化较弱:(检验也说明了这个结果,即&个群体的中国对虾遗传分化不显著,有)):!$I的遗传变异是来自个体之间,只有#:$&

3、I的遗传变异是来自群体之间:最后,经过聚类分析,发现<=群体和>?群体的亲缘关系较近,而>@群体与前两者亲缘关系较远:实验还对*对微卫星引物的多态性信息含量(()*)进行了评估,()*值介于#:H)*(J#:)%$*之间,揭示了这*个微卫星位点在中国对虾中具有较高的信息含量:关键词中国对虾地理群体微卫星!"#多态性分析自从微卫星被发现以后,已被广泛应用于各种多样性分析检测,从而检测中国对虾每个个体在此微生物的研究中[%J(],并已成为大规模遗传作图时所使卫星区的遗传变异,获得中国对虾遗传结构的多态性用的基本分子标记:这项技术也不断地被引用到水生图谱,并通过图

4、谱可直观地检测出每个个体的基因生物的研究中:尽管在对虾种类中已开发了微卫星标型:这对中国对虾遗传图谱的构建、品种选育、种系记,如斑节对虾((#+,#-&."+"/"+)[H]、凡纳对虾评估等都具有重要意义:(01’"2#+,#-&3,++,.#1)["]、白滨对虾(01’"2#+,#-&对虾作为重要的海产经济虾类,也是世界上养殖[$]和日本对虾(6,5&-2#+,#-&7,2"+18-&)[*]等,规模最大的海产生物种类之一:近年来,许多海洋生&#’14#5-&)并且在种群遗传结构分析等方面进行了应用,但由于物工作者开始对虾微卫星标记的开发和应用等进行研究[

5、)],取得了一定进展,但是由于微卫星K@+序列微卫星遗传标记具有种类的特异性,不同种类之间的通用性较差,所以我们实验室进行了中国对虾部分基在甲壳动物不同种之间的可通用性较差,因此就每种因组文库的构建,开发出了部分含微卫星核心序列的对虾来说,目前可用的微卫星标记还不是非常丰富:克隆,对可产生多态性的微卫星引物进行了群体遗传尤其是中国对虾(%#++#5"2#+,#-&891+#+&1&)微卫星标记!##&’#$’%(收稿,!##&’#)’#)收修改稿"国家自然科学基金(批准号:&#!$%#&*)、国家重点基础研究发展规划(%)))#%!##$)和国家“八六三”计

6、划(!##&++"#&#!%)资助项目,’-./0:0/12/3456789/:.;:;3第!"卷第#期$%%"年#月##:的研究工作还鲜见报道!就此我们实验室开展了中国的引物对上述#个地理群体共计;%个个体进行遗传对虾部分基因组文库的构建工作,开发了中国对虾微标记分析!每个&’(反应总体积为/4#A,包括卫星标记引物!在筛选了具有多态性的微卫星核心序$%%BC中国对虾基因组,-.,$%9&’(缓冲液,DC/E列引物的基础上,选择"对引物对中国对虾#个野生(/!%FFGHIA),$?JKC酶,L-J&各%!$FFGHIA,引物各群体进行遗传学研究,并对这"对

7、引物的多态性信息%!/#FGHIA!&’(条件为:@:1变性/FMB;@:1:%N,含量进行了评估,以期为中国对虾良种选育群体的经退火$FMB,

8、为无白斑综合症病毒()**+)感染后作算为构建中国对

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