拟南芥RINGH2基因簇表达特征初步分析

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时间:2019-05-12

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1、目录南京大学研究生毕业论文中文摘要首页用纸⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯2南京大学研究生毕业论文英文摘要首页用纸⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯。4综述茉莉酸介导的植物防御反应⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯。61.JA的生理功能⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.62.JA对胁迫和防御应答的协调机制⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.73.JA介导防御应答的调控机制⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯10第一章引言⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯。13第二章材料方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯

2、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯152.1植物材料及实验试剂⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯152.2构建双元载体和转化拟南芥⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯152.3植物材料的处理⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯172.4DNA和RNA的提取⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯172.5Q—PCR⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.182.6突变体纯杂合的鉴定⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯182.7GUS染色⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

3、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..192.8生物信息学分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯19第三章实验结果⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯203.1ATTED.II网站分析4丌G彳92DD的共表达情况⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯203.24丌G49200和4丌G492J0在不同刺激条件下的表达差异⋯⋯⋯⋯.213.3ATlG49200启动子的组织特异性⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯223.4ATlG49200及其相邻RING.H2基因的序列比对⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.243.5ATlG49200及其相邻基因

4、在植物生长阶段的表达情况⋯⋯⋯⋯⋯⋯253.6不同刺激条件下ATIG49200及其相邻基因的表达情况⋯⋯⋯⋯⋯..263.7突变体中ATlG49200及其相邻基因表达的变化⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..283.8突变体中ATlG49200及其相邻基因对不同处理的表达模式⋯⋯⋯..31第四章结论与讨论⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯35参考文献⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯37附一:实验所用引物序列⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯42致谢⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

5、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯43南京大学硕士学位论文:拟南芥RING.H2基因簇表达特征初步分析中文摘要

6、IUIIIllUIIIIllIIIIlY2372933南京大学研究生毕业论文中文摘要首页用纸丝生塑生生』竖药堂专业Q墨级硕士生姓名:昱基指导教师(姓名、职称):生出麴援摘要RING结构域是舍有半胱氨酸(Cys)和组氨酸(His)残基(Cys.x2.Cys.X9-39"Cys.XI.3-His-X2.3-Cys/His—X2-Cys.X4.48-Cys-X2.Cys,X可以是任何氨基酸

7、)的一个基序。典型的RING.锌指蛋白家族可以分为RING.H2、RING.HC和其它修饰过的RING。RING结构域能作为蛋白相互作用的部位参与到多种生物过程。此外。也有报道显示RING-结构域在通过泛素化降解蛋白的途径中发挥功能。许多包舍RING结构域的蛋白对植物生长发育以及对环境的适应性等方面发挥重要作用。ATIG49200是一个编码226个氨基酸的RING.H2锌指蛋白,C端有一个典型的RING结构域。我们发现其相邻的ATIG49210,ATIG49220,ATIG49230都编码RING.H2锌指蛋白。这四

8、个RING.H2锌指蛋白成簇存在,而ATIG49200和ATIG49210序列的相似度为89.9%,ATIG49220和ATIG49200的相似度也较高。用Genevestigator数据库分析ATIG49200及其相邻RING-H2基因在不同发育阶段的表达情况发现,ATIG49200和ATIG49230在植物整个生长阶段的表达水平要此ATIG49210和ATIG49220高,并且ATIG49230在花中的表达水平要此2南京大学硕士学位论文:拟南芥RING.H2基因簇表达特征初步分析中文摘要ATIG49200高。构建

9、的ATIG49200启动子驱动的GUS表达分析表明ATIG49200能在根、幼叶和花苞中表达,尤其是在幼嫩的组织中表达较高,在果荚的表达水平很低。当用MeJA处理后GUS的表达水平下降,这与数据库的芯片结果是一致的。ATTED.II网站分析得知ATIG49200和ATIG49210共表达,Genevestigator数据库记录的芯片结果也显示一

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