str基因座复合扩增体系建立及其在造血干细胞移植嵌合体检测中的应用

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1、分类号:R446学校代码:10392学科专业代码:100208学号:2120503729硕士学位论文STR基因座复合扩增体系建立及其在造血干细胞移植嵌合体检测中的应用EstablishmentofSTRmultiplexsystemanditsapplicationindetectionofchimerismfollowinghematopoieticstemcelltransplantation学位类型:科研型硕士所在学院:医学技术与工程学院申请人姓名:赵云丹学科、专业:临床检验诊断学导师:卓孝福教授研究起止日期:2013年7月至2015年3月答辩委员会主席:胡建达教授答辩时间:2

2、015年05月二○一五年五月福建医科大学硕士研究生学位论文目录中英缩略词表……………………………………………………………………………………….1中文摘要……………………………………………………………………………………………….2英文摘要………………………………….……………………..……………………………………4前言………………………………….………………..…………………………………………………6材料和方法……………………………………..……...……………………………………………81.材料..............................................

3、...................................................82.实验方法.........................................................................................93.统计方法.......................................................................................16结果………………………….…….………..………………………………………………………….17讨论…………

4、……………….………….……………………..……………………………………….27结论…………………………………………..…………………..…………………………………….36参考文献…………………………………………………………..…………………………………37综述…………………………………….…….………….………….………………………………….41致谢…………………………………….…….………….………….………………………………….50福建医科大学硕士研究生学位论文中英缩略词表缩写英文全称中文全称bpbasepair碱基对STRShorttandemrepeat短串联重复序列PCR

5、Polymerasechainreaction聚合酶链式反应FDCFulldonorchimerism完全供体细胞嵌合状态MCMixedchimerism混合嵌合状态HLAHumanleukocyteantigen人类白细胞抗原FISHFluorescenceinsituhybridization荧光原位杂交RFLPRestrictionfragmentlengthpolymorphisms限制性片断长度多态性VNTRVariablenumberoftandemrepeat可变数目串联重复序列HHeterozygosity杂合度PICPolymorphisminformationco

6、ntent多态信息含量DCDonorchimerism供体细胞嵌合率1福建医科大学硕士研究生学位论文STR基因座复合扩增体系建立及其在造血干细胞移植嵌合体检测中的应用摘要目的:建立包括D3S1358、D13S317、D7S820、CSF1PO、D16S539、D12S391、D18S51、Amelogenin、D5S818和FGA10个STR基因座的荧光标记复合扩增体系,探讨该体系用于检测造血干细胞移植嵌合体的可行性。方法:选取D3S1358、D13S317、D7S820、CSF1PO、D16S539、D12S391、D18S51、Amelogenin、D5S818和FGA10个ST

7、R基因座。D3S1358、D13S317、D7S820、CSFIPO上游引物的5'端用6-FAM标记,D16S539、D12S391、D18S51上游引物的5'端用HEX标记,Amelogenin、D5S818、FGA上游引物的5'端用TAMRA标记。优化STR基因座复合扩增体系中的引物浓度、DNA模板浓度、退火温度、循环次数等参数,建立最佳复合扩增体系。运用传统的制备方法,制备10个STR基因座常见基因型的等位基因分型标准物。分析本方法与Sinofile

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