微卫星标记对鲤的两个育成品种遗传背景分析和遗传评价体系建立

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1、学校代码:10264研究生学号:M120101011上海海洋大学硕士学位论文微卫星标记对鲤的两个育成品种遗传背景分析和遗传题目:评价体系建立Microsatellitemarkersforgeneticbackground英文题目:analysisandgeneticevaluationsystemestablishmentoftwoconservationcarp(Cypriunscarpio)varieties专业:水产养殖研究方向:鱼类遗传育种姓名:赵新春指导教师:石连玉研究员二0一五年六月二日上海海洋大学学位论文原创性声明本人郑重声明:我恪守学

2、术道德,崇尚严谨学风。所呈交的学位论文,是本人在导师的指导下,独立进行研究工作所取得的成果。除文中已经明确注明和引用的内容外,本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的作品及成果的内容。论文为本人亲自撰写,我对所写的内容负责,并完全意识到本声明的法律结果由本人承担。学位论文作者签名:日期:年月日上海海洋大学学位论文版权使用授权书学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定,同意学校保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版,允许论文被查阅或借阅。本人授权上海海洋大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索,可以采用影

3、印、缩印或扫描等复制手段保存和汇编本学位论文。保密□,在年解密后适用本版权书。本学位论文属于不保密□学位论文作者签名:指导教师签名:日期:年月日日期:年月日上海海洋大学硕士学位论文答辩委员会成员名单姓名工作单位职称备注答辩地点答辩日期上海海洋大学硕士学位论文微卫星标记对鲤的两个育成品种遗传背景分析和遗传评价体系建立摘要在我国淡水养殖水产生物的品种中,鲤鱼是养殖量最多、最集中的品种(品系),其中有些品种还可以作为我国独特拥有的养殖品种。鲤鱼经历了长期的人工选择和严酷的自然选择,这使得其在表型上表现出较高的多态性,且在生化遗传上表现出较高的杂合性,同时在群

4、体结构上也具有较高的多态性。增加鲤鱼杂交优势的利用,可以为鲤鱼品种选育提供丰富的原始材料,降低对品种进行稳定选育时所带来的难度。通过对鲤鱼群体遗传多样性和遗传结构的研究,在生产上进行分子标记辅助育种,可以有效地保护鲤鱼的种质资源。同时开发、完善种质评价的各种遗传指标,揭示种质资源的特性、遗传发育与进化规律,最终达到对重要种质资源的深度发掘和对育种成果的准确客观评价。以便促进我国水产种业的能够稳定保持并且沿着健康可持续的路线进行发展。利用微卫星标记对鲤新的育成品种---易捕鲤的遗传背景进行分析。研究表明:利用30对微卫星标记以96尾易捕鲤个体的基因组DN

5、A为模板进行PCR扩增,根据扩增结果将所得的基因型差异利用生物软件对各种遗传参数进行分析。结果显示:在96尾易捕鲤个体中含有的等位基因总数达到了154个,其中每个位点所检测到的等位基因数范围在3~9,有效等位基因数的平均值为4.0607;期望杂合度主要分布在0.5969~0.8710,平均值为0.7400;多态信息含量计算平均值为0.7022,主要分布在0.6280~0.8550,由此说明此品种具有较丰富的遗传多样性;对此群体进行哈迪-温伯格平衡检验,结果显示现阶段群体处于不平衡状态;平均固定系数为-0.0410,说明该群体因受选择压力的影响存在杂合子

6、过剩现象;并且检测到群体在目前阶段经历过了瓶颈效应;有效群体大小依连锁不平衡方法进行计算,结果为64.2。该研究表明此品种具有较高的遗传异质性和较大的选育空间,但由于人工选择的作用,群体处于不平衡状态,对于品种长期有效地发展将产生不利的影响,因而下一步选育工作的重点是:如何有效地对其保种策略进行研究,以便维持其丰富的遗传多样性和优良的经济性状。选用50个微卫星标记检测松浦镜鲤F8的遗传背景。结果表明:本研究从育I上海海洋大学硕士学位论文成品种松浦镜鲤F8代中随机选取200尾个体,并且对所选取的所有个体进行PIT标记。在50对微卫星标记下对所选取个体的遗

7、传结构进行检测。群体平均等位基因数(A)和有效等位基因数(Ae)分别为4.9600和2.4708,平均期望杂合度(He)值和多态信息含量(PIC)分别为0.5141和0.4576,由此说明该选育群体的遗传多样性的水平较高;通过对50个位点进行哈迪-温伯格平衡检验的结果显示:其中显著或极显著偏离平衡的位点有32个,这可能是人工选择压力的结果;计算有效群体大小为22.5,瓶颈效应检查的结果是:近期内群体可能经历了遗传瓶颈。通过对松浦镜鲤F8的遗传变异进行系统的研究,对该种群的遗传结构有了较深刻的了解,为松浦镜鲤选育群体F8的进一步繁育提供理论支持。利用微卫

8、星标记研究3个鲤鱼育成品种的遗传结构和遗传多样性,在样本容量和标记数上设置不同的梯度,分析各种

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