利用优选的微卫星标记建立常用大小鼠品系的遗传监测体系-论文.pdf

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1、第31卷第3期实验动物科学V01.31NO.32014年6月LABORATORYANIMALSCIENCEJune2014驴告报究研护驴舻利用优选的微卫星标记建立常用大小鼠品系的遗传监测体系王越甲杨炜峰车路平王小珂卢胜明(1.北京维通利华实验动物技术有限公司,北京100107)(2.河北师范大学生命科学学院,石家庄050024)摘要:目的利用微卫星位点在不同近交系小鼠、大鼠中可能具有的多态性,分别筛选出可以一次性区别5种常用近交系小鼠和3种常用近交系大鼠的微卫星引物组合,为近交系小鼠和大鼠的遗传监测分析提供高效的微卫星位点与

2、简易可靠的鉴定条件。方法通过查询相关数据库以及文献报道,按照已有明确的微卫星实验数据记录为原则,进行比对和筛选,组成了小鼠37个和大鼠24个微卫星位点库。通过PCR扩增和5%琼脂糖电泳鉴定,优化筛选出町以区分单一品系和所有品系的微卫星位点组合。结果小鼠优选出11个位点可用于5种常用近交系的鉴定,并建立r1个包含6个微卫星位点的库可用于5种小鼠品系的遗传监测;大鼠优选出6个微卫星位点,可用于3种常用近交系的监测。结论成功建立了一套可以区分常用5种小鼠和3种大鼠品系的微卫星监测方法。关键词:微卫星DNA;近交系小鼠;近交系大鼠;

3、多态性;遗传监测中图分类号:R332文献标识码:A文章编号:1006—6179(2014)03.0005—05随着生物医学研究的发展,越来越多的实验要态性,目前已经广泛应用于小鼠品系的遗传检求使用具有遗传同一性(geneticintegrity)的动物模测’。SNP检测的优点是简单、可靠、重复性强型,以确保结果的可靠性和重复性。遗传监测是确和可以高通量自动化检测,并且在国外已经实现保大鼠和小鼠品系纯度和同一性的重要手段,其方了商品化,如美国的TheJacksonLaboratory和法也越来越标准化和自动化。最早曾利用大鼠C

4、harlesRiverLaboratories,均可以提供该类服务。和小鼠的生理特性(如毛色,大小,外貌和行为特征但SNP检测的缺点是依赖贵重的仪器和引物探等)、免疫学特征(主要组织相容性复合体)和生化针,较大批量的检测才能降低成本。微卫星利用(同工酶)等方法进行遗传质量的控制’。20世PCR法即可开展检测,手段简便,结果可靠⋯。对纪90年代以后,随着PCR技术和基因测序技术的于大鼠品系,还没有建立系统的SNP检测位点库广泛应用,微卫星(Microsatellitemarkers,MIT)和单(Pane1),目前采用微卫星的

5、方法进行检测。核苷酸多态性(Single—nucleotidepolymorphisms,因此,利用微卫星进行遗传检测仍有其理论和实SNP)检测技术也得以不断的完善和发展,目前已成用价值。为遗传检测最常用的方法¨。在国内,利用微卫星进行遗传检测,近年来也有微卫星标记是一些长度不等的重复序列、有多较多的报道。但这些报道各有侧重,对常见大个等位基因位点,它们多为1—6个核苷酸序列重复鼠和小鼠品系的微卫星检测不够系统。另外一些新(也叫简单序列长度多态性,Simplesequencelength的微卫星位点被加入到国际互联网的公用数

6、据库polymorphism,SSLP)。由于单个微卫星位点重复中,有必要重新优选微卫星标记对国内常用的大鼠单元在数量上的变异,不同动植物品系中其重复次和小鼠品系进行检测。本研究选取了小鼠37个和数不同,扩增产物在长度上的变化就产生长度的多大鼠24个微卫星位点,对常用的5个小鼠品系态性,这一多态性称为SSLP(每一扩增位点就代表(C57BL/6,129,BALB/c,C3H,DBA/2)和3个大鼠了这一位点的一对等位基因)。SNP是指在基因组品系(Lewis,F344和BN)进行验证,并优选出适合水平上由单个核苷酸的变异所引

7、起的DNA序列多这些品系遗传监测的微卫星位点。收稿13期:2014—05—20基金项目:北京市科技计划课题《实验动物微生物及遗传检测体系的建立》课题资助(No.111100067311001)作者简介:王越甲(1985一),男,在读博士。研究方向:消化及生殖生理;实验动物科学。·6·实验动物科学31卷THY1、D8Mitl4、D9Mit2、D10Woxl2、SMST、1材料和方法D11Mgh3、D12Mit2、PKC、UCP、TRY1、RATIL6G、1.1实验动物PA2S和AFP。C57BL/6,129,BALB/e,C3

8、H和DBA/2共5个1.3PCR扩增和鉴定小鼠品系;和3种(Lewis,F344和BN)大鼠品系均1.3.1鼠尾DNA提取:每个样品剪取尾尖约1—购买于北京维通利华实验动物技术有限公司,每种2mm至PCR管中,加入100L的鼠尾裂解液(购品系各2只。自北京维通达生物技术有限公司),放到恒温

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