青海湖裸鲤aflp指纹图谱的构建以及与生长相关snp位点的筛选

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1、分类号：S8密级：公开UDC：编号：2015120905020772012级攻读硕士学位研究生毕业论文青海湖裸鲤AFLP指纹图谱的构建以及与生长相关SNP位点的筛选TheestablishmentofAFLPfingerprintingandSNPmarkersscreeningassociatedwithgrowthtraitsofGymnocyprisPrzwalskii指导教师：李长忠教授史建全研究员学生姓名：王朝溪学科专业名称：动物营养与饲料科学研究方向：鱼类分子生物学学院(系、部)：农牧学院论文起止时间：2015.03—2015.05QinghaiU

2、niversityMasterDissertationTheestablishmentofAFLPfingerprintingandSNPmarkersscreeningassociatedwithgrowthtraitsofGymnocyprisPrzwalskiiSupervisor:Prof.LiChangzhongCo-supervisor:Prof.ShiJianquanAcademicMajorApplidedfor:FishMolecularBiologySpecificMajor:AnimalNutritionandFeedScienceCol

3、lege(Department):QinghaiAgricultureandAnimalHusbandrycollegeMay，2015摘要摘要青海湖裸鲤是我国的濒危物种之一，在保护和恢复野生青海湖裸鲤资源的工作中亲本选育是重中之重。本研究中，通过多元回归分析、通径分析及相关分析的方法对青海湖裸鲤的体质量和相关形态性状进行了分析；其次，采用AFLP标记的方法对不同支流中的青海湖裸鲤群体的遗传多样性进行研究；最后，采用序列比对的方法对青海湖裸鲤的GH基因进行SNP位点的确定，并与青海湖裸鲤的体重与形态性状进行关联分析，筛选与生长相关的SNP位点。具体研究内容及结

4、果如下：1、为确定体质量与形态性状之间的关系，本研究通过对人工养殖的200尾+2龄青海湖裸鲤为研究对象，测量了全长、体长、头高、眼间距、体高、体宽、尾柄长、肛前距和臀鳍基长等9项形态学指标和体质量，利用通径分析、多元回归分析和相关分析的统计分析方法对青海湖裸鲤的形态学指标和体质量之间的关系，结果表明：青海湖裸鲤测量形态性状与体质量间的相关系数均达到极显著水平（p＜0.01）；通径分析结果显示体长对体质量的直接影响最大，其次为体高、臀鳍基长；建立青海湖裸鲤的各形态性状与体质量的最优多元回归方程为：Y=3.502X2+11.01X5+4.188X9-48.088，

5、回归常数检验表明青海湖裸鲤体长、体高、臀鳍基长对体质量的回归系数均达到显著水平（P＜0.05），复相关分析表明体长、体高、臀鳍基长对体质量的相关指数均≥0.85，拟合优度较高。育种目标性状的选择策略应选体长、体高、臀鳍基长。2、为揭示青海湖不同支流中青海湖裸鲤（Gymnocyprisprzewalskii）群体间的遗传种质差异及遗传多样性，采用AFLP标记的方法对采自于不同支流中的群体进行了扩增片段长度多态性分析。应用10对多态性引物在6个青海湖裸鲤群体中共扩增位点348个，其中多态性位点184个，多态性条带占总扩增条带的比例为52.9%；筛选得到79个特异位

6、点，构建了AFLP指纹图谱，根据谱带特征可以将不同支流中的青海湖裸鲤准确区分。遗传聚类分析对比结果表明：当遗传相似系数为0.87时，将六条河流的裸鲤归为为四支，沙柳河、甘子河、黑马河各归一支，哈尔盖河、泉吉河、布哈河为同一支。3、硬骨鱼类的生长是由GH/IGF-I生长轴控制的，鱼类生长激素（Growthhormone,GH）处于核心地位，为筛选青海湖裸鲤与生长相关的SNP位点，本研摘要究通过对200尾青海湖裸鲤个体的GH基因部分片段进行直接测序，进而分析比较，并与青海湖裸鲤生长性状之间进行关联分析，初步筛查得到了3个与生长性状相关的SNP位点。对于位点SNP6

7、8，基因型CC的个体在体高和体重上比基因型CT具有优势；对于位点SNP80，基因型AA的个体在体长、体重、体高、臀鳍基长比基因型AT的个体均具有生长优势；对于位点SNP148，基因型AG个体在体长、体重、体高、臀鳍基长比基因型GG的个体具有生长优势。该研究结果为开展分子标记辅助育种奠定基础。关键词：青海湖裸鲤AFLP形态性状体质量SNP摘要AbstractGymnocyprisprzewalskii,thenakedcarpisoneoftheendangeredspeciesinChina.Theselectivebreedingoftheparentnak

8、edcarpisthemostimpo