铁皮石斛甘露糖结合凝集素的分子建模与对接研究,及nac基因组序列的克隆

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1、難顏顏作誦.塌蒙^硕:t学位论文.誦'〇.:>豪M乂STERDISSERTATIONi?攀養论文题目:铁皮石解甘露糖结合凝集素的分子建模与对接研究,及基因组序列的克隆議胃%位翻:一^些一纖年级:竺—云兰兰—研究生;生芝聲指导納巾:_M£^_:;^,严国内图书分类号:78密级Q:公开国际图书分类号:西南交通大学研究生学位论文铁皮石解甘露糖结合凝集素的分子建模与对接研究,及基因组序列的克隆年级2012级姓名失觀丽申请学位级别理学硕±

2、专业生物化学与分子生物学指导老师王万军教授二零一五年五月ClassifiedIndex:78QU.D.C:SouthwestJiaotonUniversitgyMasterDegreeThesisMolecularModelinandDockinStudiesofggMBL,GenomicClo凸higofiV/lCGenesfromDendrobiumcandidumWall,exLindl.Grade。。12Candidate:MengliZhuAca

3、demicDegreeAppliedfor:MasterofScienceSpeciality:BiochemistryandMolecularSupervisor:WanJunWang,Pro色ssorMa2015y,西南交通大学学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定,同意学校保留并向国家有关部口或机构送交论文的复印件和电子版,允许论文被查阅和借阅。本人授权西南交通大学可W将本论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索,可W采用影印、缩印或扫描等复印

4、手段保存和汇编本学位论文。本学位论文属于1.保密□,在年解密后适用本授权书;2。.不保密囚,使用本授权书""(请在W上方框内打V)学位论文作者签名::^指导老师签名对''00..日期:化.[乂日期:>/2b(r.f抑西南交通大学硕±学位论文主要工作(贡献)声明本人在学位论文中所做的主要工作或贡献如下:1査阅了大量植物凝集素及全基因组测序相关的国内外文献,较为全面地综述了()植物转录因子家族的研究进展和概况;2*()通过序列分析获得了铁皮石解甘露糖结合凝集素(Dew油061心/?墙?cZwfl/e

5、mannose-b---in出nI说tinDOI^成熟化和甘露糖结合位点058AA8189AA116124AA.g,)。,,)通过同源建模建立了DOL三维结构模型;(3)通过分子克隆获得了21个铁皮石斜基因序列,并对这21个基因做了系统、发育序列特征及密码子偏好分析;并对于全长克隆的方法进行了探索及改进;:。本人郑重声明所呈交的学位论文,是在导师指导下独立进行研究工作所得的成果除文中扫经注明引用的内容外,本论文不包含任何其它个人或集体己经发表或撰写过的研究成果。本人完全。对本文的研究做出贡献的个人和集体,均已在文中

6、作了明确说明了解违反上述声明所引起的一巧法律责任将由本人承担。学位论文作者签名:曰期:心於西南交通大学硕±研究生学位论文第I页摘要monocoo-ecnMBL单子叶植物甘露糖结合凝集素(tmannsebindinglti在植物抵御,)。害虫,病原微生物和植食性动物中起重要作用基于植物MBL的重要作用,本文在推导其编码的氨基酸基础之上对铁皮石解甘露糖结合凝集素Den办oWww?C切如eC妨一mno-banseindinlectinDOL进行同源建模、分子对接和动力学模拟,进步研究DOLg,)的结构特征

7、及其与甘露糖的具体作用机制,为研究铁皮石餅的药效及新品种的选育提供有用的信息。C是一J知植物特有的类转录因子家族,功能涉及植物多种生理过程。作为重要的观赏药用植物铁皮石解因为全基因组测序数据缺乏1,而为了弄清对下游韩基因的一调控作用机制,其中个重要的方面就是要先对其进行分子结构及序列特征分析。本文还对目前常用的染色体步移技术进行了比较选择,对现有的方法进行了改进2 ̄+1M4C基因片段1173859bC和完善,主要获得了条,长度在p之间,G含量均在’? ̄3553%之间,推导的编码氨基酸残基数介于39821个之间,大多数成

8、员在5端均有一段保守基序,根据系统发育分析可将其划分为A、B、C、D四个分支,其中M4C1

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