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时间:2019-03-15
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1、单位代码10635学号112012331002120硕士学位论文野桑香转录组测序与正向选择基因分析论文作者:付博华指导教师:夏庆友教授程廷才副教授学科专业:生物化学与分子生物学研究方向:基因组与生物信息学提交论文日期:2015年5月30日论文答辩日期:2015年6月S日学位授予单位:西南大学中国?重庆2015年5月西南大学二零一五届硕士学位论文野桑蚕转录组测序与正向选择基因分析学科专业生物化学与分子生物学研究方向基因组与生物信息学指导教师夏庆友教授程廷才副教授研究生付博华中国?重庆2
2、015年5月TranscriptomeSeuencinandPositiveSelectedGenesqgAnalsisofBombxmandarinayyMaorBiochemistrandmolecularbiolojygyFieldGenomeandbioinformationProf.QinouXiagyAdvisorA.P.TingcaiChengCandidateBohuaFuChoninChinagqg,Ma2015y,独创性声明学位论文题目:野桑蚕转录组测序与iH向选择
3、基因分析本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。据我所知,除了文中特别加以标注和致谢的地方夕卜,论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果,也不包含为一获得西南大学或其他教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示谢意。学位论文作者签字日期:;年月6丨日学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解西南大学有关保留、使用学位论文的规定,有权保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和磁盘,允许论文被查阅和借阅。本人授权西南大学研究生院可以将
4、学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索,可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。(保密的学位论文在解密后适用本授权书,本论文:‘密,□保密期限至年月止)。:学位论文作者签名:^4^导师签名签字日期:年t月日签字日期:年6月日学位论文作者毕业后去向::工作单位:电话通讯地址::邮编^目录—^IAbstractIll一第章文献综述11.1野桑香特点概述11..11野桑蚕形态特征11.2.1野桑蚕生物学特征3.412物种驯化概述.11.2驯化的定义4
5、1.2.25驯化的结果1.2.36驯化基因的分子机制.13家蚕驯化的研究进展71.3.1野桑香与家香的起源713.28.家香驯化机制研究进展第二章引言112.1研究背景及目的意义112.211主要研究内容2312.研究技术路线13第三章野桑蚕转录组测序3.1实验材料与方法133.1113.实验材料.23.1主要实验仪器1331.314.主要实验试剂3.1.4RNA提取与质量检测143..15转录组测序文库构建15311..6转录组测序文库质量控制83.17.转录组测序文库测
6、序193.2实验结果2132.1转录组RNA提取与质量检测21.3.2.2转录组文库质量控制22.2233讨论第四章denovo组装与基因注释及SNP鉴定25i西南大学硕士学位论文4.1实验材料与方法254.1.1测序原始数据处理及denovo组装25426.1.2基因注释4.1.3SNP鉴定274.2实验结果274.2.1测序原始数据统计与质量评估274.2.2denovo组装统计294.2.3基因注释结果294.2.4SNP鉴定结果334.3讨论33
7、第五章野桑香转录组表达谱分析355.1实验材料与方法355.1.1转录组imigene表达量计算355.1.2基因差异表达分析365.2实验结果……365.2.1基因差异表达分析结果36522丝蛋白相关基36..因分析5.3舰43第六章野桑蚕正向选择基因鉴定与功能分析456.1实验材料与方法456.1.1野桑香直系同源基因鉴定456.1.2野桑蚕Ka/Ks分析与正向选择基因的鉴定456.1.3野桑香正向选择基因KEGG
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