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《全转录组LncRNA与CircRNA测序分析策略.pdf》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在教育资源-天天文库。
1、全转录组测序引爆点——LncRNA/CircRNA创新研究策略及解决方案©2010-2016NovelBioCo.,LtdCONTENTS1生命体中的暗物质目2RNA-seq之“暗物质”解决方案录3lncRNA与circRNA的分析方案©2010-2016NovelBioCo.,LtdCONTENTS1生命体中的暗物质2目RNA-seq之“暗物质”解决方案3录lncRNA与circRNA的分析方案©2010-2016NovelBioCo.,Ltd非编码RNA的分类1.HousekeepingncRNA•tRNA,rRNA,sno
2、RNA,snRNAuncategorizedprocessedother,932•Translation,ribosomemature,RNAsplicing…etctranscript,933miscRNA,11872.SmallregulatoryRNAlincRNA,5089•miRNA(21-24nt),piRNA(26-31nt),siRNA(20-25ntDS)snoRNA,1521•developmentanddiseasemicroRNA,17563.LongnoncodingRNA(lncRNA)Antisen
3、seRNA,•≥200ntsnRNA,19443230•MostprevalentclassofncRNA•XIST,HOTAIR…•developmentanddisease16,592个已注释的ncRNA的主要分类(1)DeSaccoet.al.Int.JournalofMol.Sci.(2012),13.(2)Taftetal.,JPathol2010;220:126–139,Non-codingRNAs:regulatorsofdisease©2010-2016NovelBioCo.,Ltd(3)BakerM.Longn
4、oncodingRNAs:thesearchforfunction.Nat.Meth.2011;8:379–383.非编码RNA的分类1.HousekeepingncRNA•tRNA,rRNA,snoRNA,snRNA•Translation,ribosomemature,RNAsplicing…etc2.SmallregulatoryRNA•miRNA(21-24nt),piRNA(26-31nt),siRNA(20-25ntDS)•developmentanddisease3.LongnoncodingRNA(lncRNA)
5、•≥200nt•MostprevalentclassofncRNA•XIST,HOTAIR…•developmentanddisease4.circRNA•IntroniccircRNA，ExoniccircRNA•miRNASponges/RBPSponges•Cancer+Neuroscience(1)DeSaccoet.al.Int.JournalofMol.Sci.(2012),13.(2)Taftetal.,JPathol2010;220:126–139,Non-codingRNAs:regulatorsofdisea
6、se©2010-2016NovelBioCo.,Ltd(3)BakerM.LongnoncodingRNAs:thesearchforfunction.Nat.Meth.2011;8:379–383.lncRNA的表达特征MoranN.Cabili,GENES&DEVELOPMENT，2011与mRNA相比，lncRNA一般表达量较低，而组织特异性更强Derrienetal,2012,GenomeResearch©2010-2016NovelBioCo.,Ltd核内长链非编码RNA的功能uA.充当增强子enhancer(eRNA
7、)招募RNA聚合酶IInaturecommunications2013uB.招募染色质修饰复合物molecularcell2016uC.影响转录因子的招募cellstemcell2014uD.影响染色体的空间构象Science2012uE.影响RNA的剪接NatStructMolBiol.2016©2010-2016NovelBioCo.,Ltd胞质中的lncRNAs功能uF.影响mRNA的稳定性NATUREREVIEWSGENETICS2014uG.影响mRNA的翻译速率uH.作为ceRNA竞争性结合microRNACell2
8、011;CancerCell2014uI.部分lncRNA具有的短ORF，可以翻译成小肽Elife.2014©2010-2016NovelBioCo.,LtdcircRNA相对于lncRNA的特征circRNA的特征lncRNA的特征多miRNA结合位点——mi
