蔷薇属小叶组的分子系统发育学及物种形成

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1、单位代码＿学＾１１２０１２３２５００１８４８，破義Ｊ乂聲硕±学位论文菩薇属小叶组的分子系统发育学及物种形成论文作者：邓亨宁指导教师；李先源副教授高信芬研究员学科专业：园艺学（花巧学）研究方向：种质资源与系统进化提交论文日期；２０１５年５月２０日论文答辩日期：２０１５年５月２８日学位授予单位：西南大学中国？重庆２０１５年０５月独创性声明学位论文题目：慕薇属小叶组的分子系统发育举巧物种形成本人提交的学位论文是在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。论文中引用他人已经发表或出版过的研

2、究成果，文中已加了特别标注。对本研究及学位论文撰写曾做出贡献的老师＾、朋友、同和在文中作了明确说明并表示衷感谢。‘学位论文巧者：签字曰期：少５年月曰学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解西南大学有关保留、使用学位论文的规定，有权保留并向国家有关部口或机构送交论文的复印件和磁盘，允许论文被查阅和借阅。本人授权西南大学研究生院（筹）可Ｗ将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可Ｗ采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。（保密的学位论文在解密后适用本授权书，本论文：不保密，□保密期限至年月止）。

3、学位论文作者签《：导师签名：相侈為橡參签字曰期：知＞年ｋ月曰签字曰期：之６月ＸＨ目录目录摘要ＩＡＢＳＴＲＡＣＴＩｌｌ第１章文献综述１１．１系统发育学概述１１．１．１系统发育学概念及原理１１．１．２分子系统发育介绍１１．１．３物种的形成４１．２６醫薇属植物及其分类简介１．３小叶组研究概述８１．３．１樂丝花形态描述及研究状况８１．３．２中甸刺玫的形态描述及研究状况９１．３．３贵州缕丝花的形态描述及研究状况１０１．３．４小叶组新分类群介绍１０

4、第２章引言１３２．１存在的问题；１３２．２研究内容、目的和意义１３第３章材料与方法巧３．１欄１５３．２方法１７３．２．１总ＤＮＡ提取１７３．２．２基因片段及其引物筛选化３．２．３ＰＣＲ扩増及测序１９３２．．４目的基因的克隆１９３．３数据分析２２么３．１序列拼接及比对２２２．３．２核基因单倍型分析２２３．３．３序列文件格式转化及最佳替代模型检测２２西南大学硕王学位论文２．３．４系统发育分析２２３．３．５分化时间计算２２

5、第４章结果与分析２５４．１核基因单倍型统计巧４．２最佳替代模型计算２９．３４ｃｐＤＮＡ系统发育分析３４４．４ＩＴＳ系统发育分析扣４．５ＧＡＤＰＨ系统发育分析％４．６小叶组分化时间４０第５￥讨论４１５．１小叶组的系统位置４１５．２小叶组的物种界限４１．５３小叶组的物种形成４２５．３．１无巧刺梨的成种历史４２５．３．２中甸刺玫的成种历史４３５．３．３贵州缴丝花的成种历史４４第６章总结４７６．１主要结论４７６．２主要创新点及不足４

6、７６一．３下步研究计划４７参考；＾献４９致谢５７在校期间发表的文章和参与的科研项目５９附＃１６１摘要菩薇属小叶组的分子系统发育学及物种形成花弁学专业硕壬研究生：邓亨宁指导老师：李先源副教授高信芬研究冥摘要蓄薇科蓄薇属小叶组（ｓｅｃｔ．ＭｉｃｒｏｐｈｙｌｌａｅＣｒｅｐ．）包括四个种：樂丝花、中甸刺玫、贵州缕丝花和无好刺梨；ｙｘ及两个变型：白花刺梨和无刺刺梨。除了缴丝花在日本有见。分布外，小叶组其他物种均分布于我国，尤Ｗ西南地区为其分布中也小叶组的前期研。、物种的系究多集中于生物

7、特性、天然产物及生理生化等方面然而，关于物种的界限。统位置、物种起源及分化时间的研究，在小叶组中鲜有全方位的探讨为了解决Ｗ上问题，本研究Ｗ我国西南地区为采样中也，广泛搜集蓄薇属内植物；Ｗ系统发育学的分析手段对小叶组展开研究。我们选取两个核基因片段（打Ｓ和ＧＡＰＤＨ）及五个叶绿体基－〇Ｃ７因片段（饼６心化Ｗ巧托加化地护化护６／中和ｗ）进行分析。利用贝叶斯分析（ＢＩ）和最大似然法分析（ＭＬ）对供试材料进行系统发育关系重建；利用ＢＥＡＳＴ软件包进行Ｂ巧ｅｓｉａｎ分析来计算物种的分化时间。我们的主要研究结果如下；小叶组并非是一个单系类群。中

8、甸刺玫与来自桂味组的大叶馨薇及华西蓄薇构成姐妹关