acc1基因在仲彬草属p染色体组中的系统发育及分子进化

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1、分类号Ｓ５１２，Ｓ３２６学号Ｓ２０２７１２２０四川巧业大学硕壬学位论文基因在仲橄草属Ｐ染色体组中的系统发育及分子进化吴丹丹指导教师周永红教授凡屋研究员学科专业作物遗传育种研究方向小麦族密源评价与利用２０１５年５月Ｔｈｅｈｌｏｇｅｎｙａｎｄｍｏｌｅｃｕｌａｒｅｖｏｌｕ村ｏｎｏｆ如ｃｌｐｙｅｎｅｉｎＰｅｎｏｍｅｗｉｔｈｉｎＫｅｎｉｌｉａＹｅｎｅｔＪ．Ｌ．ｇｇｇｙＹａｎＰｏａｃｅａｅ：Ｔｒｉ村ｃｅａｅｇ（）ＢｙＤａｎ－ＤａｎＷ

2、ｕＤｉｒｅｃ化ｄｂｙ－Ｐｒｏｆ．ＹｏｎｇＨｏｎｇＺｈｏｕＰｒｏｆ．沿ｎＦａｎｇＭａ２０１５ｙ，论文独创性声明本人郑重声明：所呈交的学位论文是我个人在导师指导下进行研究工作所取得的成果。尽我所知，除了文中特别加Ｗ标注和致谢的地方外，学位论文中不包含其他个人或集体己经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得四川农业大学或其它教育机构的学位或证书所使用过的材料一。与我同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了谢意。研究生签名；年＾月少日关于论文使用授权的声明

3、目本人完全了解四Ｗ农业大学有关保留，Ｐ；学、使用学位论文的规定校有权保留并向国家有关部口或机构送交论文的复印件和电子版，允许论文被查阅和借闷，可Ｗ采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同意四川农业大学可Ｗ用不同方式在不同媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容。包４论文不保密，在。□本论文保密年解密后适用本授权。＿＂＂（请在＾式上□内划Ｖ）研究生签名：Ｃ叫ｌＴ年／月日矣导师签名：少〇／女年月日／摘要ｃｅａｅ一个有重要经济价值小麦族（Ｔｒｉｔｉ）是禾本科早熟禾亚科中、多年生植物占优

4、势的族，包括有３０个属４６５个物种，有二倍体，更多为多倍体物种，有着复杂且多样的染色体组组成，如Ａ、Ｓ、Ｄ、Ｎｓ、Ｐ、Ｓｔ等基本染色体组的二倍体及演化形成的同源ＰＰ多倍体和异源多倍体。其中，含ａｅｒｔｎ．）、染色体沮的物种包括在冰草属Ｇ，仲彬草属（俗＂ｇｙ視幻ＹｅｎｅｔＪ．Ｌ．Ｙａｎｇ，ＳｔＹＰ）、杜威草属（公〇１／如？５麻ｗｅｙ幻Ｙｅｎ，ＪＬＬ．ＹａｎｇｅｔＢ．Ｒ卫ａｕｍ，ＳｔＰ）Ｕ及沙滩麦属（尸ｓ口／ｗｗｏｐｙｒＭｗＬＯｖｅ，ＥＳｔＰ）等属中。必一仲彬草属（ｅｎ；リｉａＹｅｎｅｔＪ．ＬＹａｎ）为小

5、麦族个重要的多年生属巧ｇ，由颜济和杨俊良教授在１９９０年Ｗ祝ａｇｏＷｃｏ／ａＹｅｎｅｔＪ．ＬＹａｎｇ为模式种建立的，约有３０个种或变种。仲彬草属染色体组组成为ＳｔＹＰ，其Ｐ染色体组源于二倍体的冰草巧Ｔｏｎｃｒｋｔｏ化ｗ（Ｌ．）Ｇａｅｒｔｎ．）。目前，己有研究表明仲彬草属物种分布受Ｐ染色体组的影响，但Ｐ染色体组如何参与到仲彬草属物种的形成？如何分化？地理分布格局如何？等问题都还不清楚。本研究通过对１３个仲彬草属物种（１３份）、２个冰草属物种（６０份）及３３个二倍体物种的２２９条＾ｃｃｌ基因序列分析

6、，构建系统发育树，探讨仲彬草属中Ｐ染色体组的系统发育与分子进化，主要结果如下：１Ｐ、系统发育及多态性分析表明仲彬草属染色体组存在中亚和青藏高原的地理分化式样，Ｐ染色体组的来源与冰草地理起源有关，中亚地区仲彬草和青藏高原地区仲彬草属物种成为两个独立起源的谱系。２、全世界的冰草大体分为中亚、东亚、青藏高原和欧洲４个居群，聚类分析表明这４个居群分散形成３个亚支．，Ｆｓｔ变化范围从００１９４３到０．１７５８８，推测冰草居群间存在地理隔离或者多重杂交。中亚冰草居群核昔酸多态性丰富，与其他３个地区存在较高的遗传分化

7、程度，可能是地理隔离或地理距离过远的结果，因此推测中亚居群的冰草可能为冰草的分化中也。青藏高原地区的冰草居群和东亚的冰草居群遗传分化指数最小＝（Ｆｓｔ０．０１９４），遗传关系较近，可能与这两个居群分化时间相对较晚有关。中亚和欧洲这两个冰草居群分化程度低，中亚居群的冰草可能直接参与到欧洲冰草的形成，或者欧洲居群保留了更多的祖先遗传信息。３、青藏高原地区仲彬草属和四倍体冰草位点多态性比较发现，仲彬草属物种存在着相当多的古老变异，这些古老变异可能随着群体历史扩张事件被固定下来。而中Ｉ亚地区仲彬草属、二倍体冰草

8、与四倍体冰草的＾ｃｃｌ位点处多态性比较发现，仲彬草属物种在多倍化过程中存在遗传瓶颈，二倍体的冰草经历了选择消除事件，四倍体冰草经历了种群扩张。４、仲彬草属的Ｙ染色体组虽然与簇毛麦属（Ｖ染色体组）形成姐妹支，但