葡萄霜霉病菌全基因组测序及候选效应蛋白r7的功能研究

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1、密级：论文编号:中囯农业科学院学位论文葡萄霜霉病菌全基因组测序及候选效应蛋白R7的功能研究WholeGenomeSequencingofPlasmoparaviticolaandFunctionalAnalysisofRXLREffectorProteinR7硕士研宄生：孔祥久指导教师：王忠跃研宄员申请学位类别：农学硕士专业：学研究方向：流砩個0培养单位：植物保护研宄所研宄生院2015年6月密级:论文编号:中国农业科学院学位论文葡萄霜霉病菌全基因组测序及候选效应蛋白R7的功能研究WholeGenomeSequencingofPlasmoparavitic

2、olaandFunctionalAnalysisofRXLREffectorProteinR7硕士研究生：孔祥久指导教师：王忠跃研究员申请学位类别：农学硕士专业：植物病理学研究方向：植物病害流行和监测培养单位：植物保护研究所研究生院2015年6月Secrecy:No.ChineseAcademyofAgriculturalSciencesDissertationWholeGenomeSequencingofPlasmoparaviticolaandFunctionalAnalysisofRXLREffectorProteinR7M.S.Candidate

3、：KongXiangjiuSupervisor：ProfessorWangZhongyueMajor：PlantPathologySpecialty:EpidemicandMonitoringofPlantDiseaseJune2015独创性声明本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研宄工作及取得的研宄成果。尽我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其它人已经发表或撰写过的研宄成果，也不包含为获得中国农业科学院或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均己在论文中作了明确的说明并表示了谢意。

4、研宄生签名：&4久^时间：勿/5年6月2日关于论文使用授权的声明本人完全了解中国农业科学院有关保留、使用学位论文的规定，即：中国农业科学院有权保留送交论文的复印件和磁盘，允许论文被查阅和借阅，可以釆用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同意中国农业科学院可以用不同方式在不同媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容。时间：年6月^'日研究生签名:乳>年夂中国农业科学院硕士学位论文评阅人、答辩委员会签名表论文题目葡萄霜霉菌全基因组测序及候选效应蛋白R7的功能研究植物病害流行论文作者孔祥久专业植物病理学研究方向和监测指导教师王忠跃研究员培养单位（研究

5、所）植物保护研究所硕（博）姓名职称单位专业签名导师评硕导口王琦教授中国农业大学植物病理学博导0阅副研究硕导0中国农业科学院刘太国植物病理学人员博导口植物保护研究所答辩主席硕导口张力群教授中国农业大学植物病理学博导0硕导口王琦教授中国农业大学植物病理学博导0硕导口刘伟成研究员北京市农林科学院植物病理学博导0答硕导口中国农业科学院植物徐世昌研究员植物病理学博导0保护研究所辩硕导口中国农业科学院植物李世访研究员植物病理学博导0保护研究所委硕导口中国农业科学院植物冯洁研究员植物病理学博导0保护研究所员硕导口中国农业科学院植物赵廷昌研究员植物病理学博导0保护研究所

6、会议记录（秘书）张昊助理研究员论文答辩时间地点植保所第二会议室，2015年5月18日8时摘要葡萄霜霉病（GrapeDownyMildew）是全球范围内危害葡萄生产的重大病害，病害流行年份可造成20%~80%的损失，严重时几乎颗粒无收。成功和高效防控葡萄霜霉病是葡萄产业健康发展的重要条件。探索葡萄霜霉病菌（Plasmoparaviticola）与葡萄的互作关系，可以为葡萄霜霉病的防控提供更为有效的途径或方法。本研究完成了葡萄霜霉病菌的全基因组测序，对得到的数据进行了生物信息学分析，预测了含有RXLR保守结构域的候选效应蛋白，并对候选蛋白R7（本实验室命名）

7、进行了功能鉴定，为揭示葡萄霜霉病菌的致病机制，研发新的防控技术提供了分子基础和依据。主要研究结果如下：1.葡萄霜霉病菌的全基因组测序及数据分析采用454和illumina方法对葡萄霜霉病菌进行全基因组测序，共建立了4个库，最终获得10.37G数据。根据现组装结果确定基因组大小约为240M，远大于原先估计的120M，与致病疫霉大小相似，大于其它已测序的卵菌。对基因组进行nt库同源注释，发现同源性较高的多为细菌，在卵菌中，与致病疫霉（Hytophthorainfestans）同源性最高，而与库中葡萄霜霉病菌同源序列为1.28%，这也说明nt库中所含的葡萄霜霉

8、病菌基因序列信息非常少。2.葡萄霜霉病菌RXLR候选效应蛋白的预测对基因组序列进