番茄重要农艺性状的全基因组关联分析及野生种质在栽培种的渐渗分析

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1、密级:论文编号:中囯农业科学院学位论文番茄重要农艺性状的全基因组关联分析及野生种质在栽培种的渐渗分析Genome-wideAssociationStudiesofImportantAgronomicTraitsinTomatoandAnalysisofWildGermplasmIntrogressioninCultivars博士研究生：祝光涛指导教师：杜永臣研究员申请学位类别：农学博士专业：蔬菜学研究方向：蔬菜遗传育种培养单位：中国农业科学院研究生院蔬菜花丼研究所提交日期2015年5月密级:论文编号:中国农业科学院学位论文番茄重要农艺性状的全基因组关联

2、分析及野生种质在栽培种的渐渗分析Genome-wideAssociationStudiesofImportantAgronomicTraitsinTomatoandAnalysisofWildGermplasmIntrogressioninCultivars博士研究生：祝光涛指导教师：杜永臣申请学位类别：农学博士专业：蔬菜学研究方向：蔬菜遗传育种培养单位：中国农业科学院研究生院蔬菜花卉研究所提交日期2015年5月Secrecy:No.ChineseAcademyofAgriculturalSciencesDissertationGenome-wideA

3、ssociationStudiesofImportantAgronomicTraitsinTomatoandAnalysisofWildGermplasmIntrogressioninCultivarsPhD.Candidate：GuangtaoZhuSupervisor：YongchenDuMajor：VegetableSciencesSpecialty:GeneticsandBreedingofVegetablesMay2015独创性声明本人声明所7交的论文是我个人在汙师指汙卜'迸行的研宄r作及収得的研究成舉尽我所知，除r文屮特别加以际辻和致谢的地

4、方弊，论文中不包含其他人己经发灰或撰写过的研宄成采，岜不包含々获得中II农收科学院成艽它教存机构的学位或证朽而使用过的材料=u我一M」:作的M志对本研宂所做的彳r何贡献均ci/h论文屮作/明确的说明并农不r谢总s研允生签名:关于论文使用授权的声明本人了解中_农业科学丨窗賓关保街、使用学像论文的规定，即：屮掇农:&fl学院#权保留送交论文的M印件和磁盘，允许论文被荀阅和倍阌，吋以采用影印、缩卬m:i描等fi丨!<打段保仏汇编‘7:位论文，，卜，说中闺农、:Km以⑴料彷式迮+M媒休丨:发犮、传播于位论文的金部或部分内東研究生签名...:时_:导师签名:中国

5、农业科学院博士学位论文评阅人、答辩委员会签名表论文题0番茄重要农艺性状的全基因组关联分析及野生种质在栽培种的渐渗分析论文作者祝光涛专业:蔬菜学研究方向蔬菜遗传育种指导教师杜永臣培养单位（研宄所、中心）蔬菜所硕（博）姓名职称单位专业签名导师硕导口评博导口硕导口阅博导口人硕导口博导口答辩硕导口郭仰东教授中国农业火学蔬菜学博导口柄硕导口中H农业科学院蔬菜蔬菜采后加胡鸿研宄员博导口花卉研究所硕导口北京农林科学院蔬菜李常保研究员dikl*dBs*^疏果午博导口研究中心答硕导口张小兰教授中国农业大学蔬菜学博异口Ulr'V辩7；XS门倾寺口中国农业科学院蔬菜连勇研究

6、员蔬菜学博导口花卉研宂所委謂硕导口中国农业科学院蔬菜崔霞研究员生物技术狼博导口花卉研宂所员nr'*-rfaf.Kh?硕导口中国农业科学院蔬菜研究员疏米予.博导口花卉研'究所----f------------------------------硕导口博导口会议记录（秘书）论文答辩时问地点2015.05.27上午8:00,屮国农业科学院蔬菜花卉研宄所综合楼204.................摘要番茄（Solanumlycopersicum）是一种世界范围内广泛种植的蔬菜作物，也是研究果实发育的典型模式植物，具有重要的经济和科研价值。近年来，番茄基因组序

7、列的解读和群体遗传学的发展让我们能够能从基因组的角度加深对番茄的了解。本研究利用高密度的基因组数据对整个番茄群体的进化关系和群体结构进行了分析，在此基础上利用全基因组关联分析的方法对栽培种群体内的自然变异进行检测，并以抗病基因为标记对野生资源在栽培种的渐渗片段进行分析。本研究加深了对人类驯化和现代育种对栽培种番茄基因组影响的了解，相关结果和方法将为基因组指导的番茄育种提供了借鉴和思考，全文主要结果如下。1.利用全基因组20,111个SNPs对包括166份普通栽培种番茄、112份樱桃番茄、53份醋栗番茄、3份契斯曼尼番茄、3份秘鲁番茄、1份多毛番茄、1份

8、多腺番茄、1份小花番茄和1份智利番茄的341份番茄材料构建了系统发生树，结果表明樱桃番茄（CE