江淮大豆育种种质群体snp标记遗传多样性及农艺、品质性状全基因组关联分析

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1、＇．分类号巡２？学号＂？＾為请泉違义聲学术型硕±学位论文江淮大豆育种种质群体ＳＮＰ标记遗传多样性及农芝、品质性状全基因组关联分析王白力指导教师赵团结教授学科口类农学专业名称作物遗传育种■Ｉ－，硏究方向植物遗传资源研究与利用’—答辩日期二０五年六月：．皆，－、－■Ｔ．．：ｆ，？■－＊？＊＇．－＊：＇．＇．．．亩．．Ｖ－＊．ＧＥＮＥＴＩＣ－ＷＩＤＥＤＩＶＥＲＳＩＴＹＡＮＤＧＥＮＯＭＥ乂ＳＳＯＣＩＡＴＩＯＮＳＴＵＤＩＥＳｆＯＲＡＧＲＯＮＯＭＩＣ

2、ＡＮＤＱＵＡＬＩＴＹＴＲＡＩＴＳＵＳＩＮＧＳＮＰＭＡＲＫＥＲＳＩＮＡＹＡＮＧＴＺＥ－ＨＵＡＩＳＯＹＢＥＡＮＢＲＥＥＤＩＮＧＬＩＮＥＰＯＰＵＬＡＴＩＯＮＢｙＷａｎＺｍｇＴｈｅＴｈ的ｉｓＳｕｂｍｉｔｔｅｄ化ＮａｎｉｎＡｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｊｇｇｙＮａｎｉｎＰ．Ｒ．Ｃｈｉｎａｊｇ，ＩｎＰａｒｔｉａｌＦｕｌｆｉｌｌｍｅｎｔｏｆ化ｅＲｅｕｉｒｅｍｅｎｔｓｆｏｒｑＴｈｅＭａｓ化ｒＤ巧ｒｅｅＳｕｐｅｒｖｉｓｅｄｂｙＰｒｏｆ－．ＺｈａｏＴｕａｎＪｉｅＣｏｍｌｅｔｅｄｉｎＪ

3、ｕｎｅ２０１５ｐ，原创性声明：所呈交的学位论文本人郑重声明，是本人在导师的指导下，独立进行研究工作所取得的成果。除文中已经注明引用的內容外，本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的作品成果。对本文的研究做出重要贡献的个人和集体，均已在文中Ｗ明确方式标明。本人完全意识到本声明的法律结果由本人承担。学位论文作者（需亲笔）签名：主如仙年ｔＭ曰学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定，同意学校保留并向国家有关部口或机构送交论文的复印件和电子版，允许论文被査阅和借阅。本人授权南京农业大学可Ｗ将本学位论文的全

4、部或部分内容编入有关数据库进行检索，可Ｗ采用影印、缩印或扫描等复制手段保存和汇编学位论文。保密□，在年解密后适用本授权书。本学位论文属于不保密口。＂（请在Ｗ上方框内巧Ｗ）。学位论文作者（需亲笔）签名１曰：立主年Ｉ月ｆ１导师（需亲笔）签名！滅古么〇支年月日畫）或矣Ｉ目录目录巧要１ＡＢＳＴＲＡＣＴ曲一第章文献综巧１１．１大豆优异种质资源发掘、创新与利用研究概况１１丄１大豆种质资源保存与研究意义１１丄２国外大豆优异种质资源发掘、创新与利用概况２１．１．３国内大豆优异种质资源发掘、创新与利用概况３１．１．４我国

5、江淮地区优异种质资源发掘、创新与利用概况６１．２作物数量性状ＱＴＬ定位主要方法与策略８１．２．１作物连锁定位方法８１．２．２作物关联分析方法１０１．２．２．１关联分析研究的群体１０１．２．２．２关联分析方法的分类１１１．２．２．３连锁不平衡１１１１３．２．２．４关联分析中处理群体结构的方法１．２．２．５关联分析的其他模型—１４１２．６．２．多重测验问题的矫正１５１．２．２．７关联分析使用的软件１５１．２．２．８关联分析在近交作物应用存在的问题１６１ＳＮＰ１７．３标记开发及其在大豆遗传育种研究中的应用１．３

6、．１ＳＮＰ标记的简介１７１．３．２ＳＮＰ标记的开发１７１．３．３Ｗ分子标记为基础的大豆分子育种研究进展１９１．３．４ＳＮＰ标记在大豆中的应用巧１．４大豆重要农艺、品质性状ＱＴＬ关联分析研究进展２０１．５本研究的目的与意义２３第二章材料和方法２５２１．试验材料２５ｉ江淮大豆育种种质群体ＳＮＰ标记遗传多样性及农艺、品质性状全基因组关联分析２．２田间试验设计及表型调查２９２．３ＳＮＰ分子标记开发与基因型分析２９２．４统计分析方法２９２巧．４．１群体ＳＮＰ标记遗传多样性分析２．４．２群体结构分析３０

7、２．４．２．１ＡＤＭＩＸＴＵＲＥ体结构分析３０群２Ａ．２．２群体主成分分析３０２．４（Ｋｉｎｓｈｉ）计算３０．２３材料间基于标记的亲缘系数ｐ２Ａ２．４遗传关系对表型贡献的估计３０２．４．３群体连锁不平衡分析３１２．４．４农艺、品质性状表型数据统计分析３１２乂５全基因组关联分析３１２．４．６育种性状ＱＴＬ优异等位变异筛选与种质鉴定３２第兰章ＹＨ涨ＬＰ群体ＳＮＰ統ａ遗传多样性和群