绒山羊骨骼肌高肉碱相关基因的筛选

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1、分类号Ｓ８．１３；；学校代码１０１２９ｔｏｅ６３６学号２０１２２０１０１１嗦乂肇硕±学位论文绒山羊骨骼肌高肉碱相关基因的歸选Ｓｃｒｅｅ口ｉｎｇＧｅｎｅｓ民ｅｌａｔｅｄｔｏＨｉｇｈＣｏｎｔｅｎｔｏｆＣａｍ沾ｎｅｉｎＳｋｅｌｅｔａｌＭｕｓｃｌｅｉｎＣａｓｈｍｅｒｅＧｏａｔ申请人：王静学科口类：农学学科专业：动物遗传育种与繁遺研究方向：数量基因组学暨性状遗传原理指导教师：李金泉教授张文广教授—论文提交日期：二〇五年六月；内蒙古农业大学研

2、究生学位论文独创声明，本人申明所呈交的学位论文是我本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。据我所知，除了文中特别加标注和致谢的地方外，论文中不包括其他人己经发表或撰写过的研究成果，也不包一括为获得我校或其他教育机构的学位或证书而使用过的材料，与我同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示谢意。一申请学位论文与资料若有不实之处，本人承担切相关责任。论文作者签名：ｊ－日期：乂乂．挣Ｙ义内蒙古农业大学研究生学位论文版权使用授权书本人完全了解内蒙古农业

3、大学有关保护知识产权的规定，即；研究生在攻读学位期间论文工作的知识产权单位属内蒙古农业大学。本人保证毕业离校后，发表论文或使用论文工作成果时署名单位为巧蒙古农业大学，且导师为通讯作者，通讯作者单位亦署名为内蒙古农业大学。学校有权保留并向国家有关部口或机构送交论文的复印件和电子文档，允许论文被査阔和借阅。学校可Ｗ公布学位论文的全部或部分内容（保密内容除外），采用影印、缩印或其他手段保存论文。论文作者签名：么命指导教师签名：Ｊ日期：如摘要以肉碱是人体必需营养素，且可用作减肥的

4、保健品。内蒙古绒山羊肌肉中肉碱含量较其他动物髙，而且目前没有关于不同部位肌肉中肉减含量情况的研究，也不清楚调控肉碱含量的相关基因。因此，找出调控肉碱含量的基因，对于今后有关肉碱的研巧及羊肉精细分割出售具有重要意义。本研巧Ｗ内蒙古绒山羊为研究对象，利用髙效－液相色谱法（ＨＰＬＣ）测定了绒山羊不同部位肌肉组织中总肉碱含量，通进ＲＮＡＳｅｑ技术对肉碱含量较髙的股四头肌，＾及肉碱含量较低的股二头肌［＾；及也脏转录组文库进行高通量测序，对差异基因进行功能注释和富集性分析，将肉碱相关基因与差异基一因中结合筛

5、选出绒山羊骨骼肌髙肉碱含量的候选基因，从而为进步研巧绒山羊骨骼肌肉碱含量提供研究依据与思路，为实现绒山羊肉类精细分割，为给企业创造更大的利润提供可能。本研巧主要研巧结果如下：１、利用ＨＰＬＣ测定了绒山羊１２个不同部位肌肉总肉碱含量。其中骨骼肌肉碱含、￣－ｍ屯肌（４量（１２０３．５３１２３１．５３ｇ／ｋｇ）整体高于１３．４５４７９．４５ｍｇ／ｋｇ）；骨骼肌中半膜肌含量最高，股四头肌次之，股二头肌最低；总体上肉碱含量为：后腿肌肉＞肩背部肌肉＞前腿肌肉。２、成功构建了內蒙古绒山羊股二头肌、股四头肌和

6、也脏转录姐文库，利用ＲＮＡ－Ｓ进行髙通量测序Ｈａｔ软件比对巧技术，得到７．２ＧＢ原始测序数据。通过Ｔｏｐ分二二、，１８６４析得出股头肌与股四头肌差昇表达基因共个；股头肌与屯脏差异表达基因共９９３个；股四头肌与也脏差异表达基因共２７７０个。３、差异表达基因ＧＯ功能注释结果表明：羞异基因主要与肌肉发育、葡萄糖代谢、ＡＴＰ代谢、氧化磯酸化、泛素化、襄泡介导的转运和线粒体相关ＫＥＧＧ通路富；集分析表明：差异基因主要参与ＰＰＡＲ信号通路、膜岛素信号通路和ＭＡＰＫ信号通路。４、结合Ｇｅｎｅｏｎｔｏｌｏｇ

7、ｙ网站上的肉碱相关基因，筛选出绒山羊骨骼肌髙肉碱含量、的９个候选基因，分别为；ＰＤＺＫ１ＣＤＶ３、ＡＣＡＤＬ、ＰＲＫＡＡ２、ＰＲＫＡＢ２、ＭＯＢＡＴ１、ＮＡＴ６、ＰＬＡ２Ｇ１５和ＨＲＡＳＬＳ。５、进化树分析可知：ＰＤＺＫ１、ＣＤＶ３、ＡＣＡＤＬ、ＰＲＫＡＡ２、ＭＯＢＡＴ１、ＰＬＡ２Ｇ１５和ＨＲＡＳＬＳ在山羊、绵羊和牛，大鼠和小鼠中同源性高，且保守性强；山羊ＰＲＫＡＢ２与其他物种同源性低且变异大；鸡的ＰＤＺＫ１、ＣＤＶ３、ＰＲＫＡＡ２、ＰＲＫＡＢ２、ＭＯＢＡＴ１、ＰＬＡ２Ｇ１５和ＨＲＡＳＬＳ基

8、因与其他物种的同源性均较低。－：绒山羊ＲＮＡＳｅ二头肌关键词；肉碱；股四头肌也脏；ｑ；股；ＳｃｒｅｅｎｉｎｇＧｅｎｅｓ民ｅｌａｔｅｄｔ：ｏＨｉｈＣｏｎｔｅｎｔｏｆＣａｒｎｉｔｉｎｅｉｎＳｋｅｌｅｔａｌｇＭｕｓｃｌｅｉｎＣａｓｈｍｅｒｅＧｏａｔＡｂｓｔｒａｃｔＬ