沙子岭猪和大白猪背最长肌转录组与蛋白组研究

《沙子岭猪和大白猪背最长肌转录组与蛋白组研究》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、博：ｉｒ学位论文沙子龄猪和大白猪背最长肌转录组与蛋白组硏究研究生姓名杨祗指导教师马海明教授学科专业动物遗传育种与繁殖硏究方向猪的分子遗传学二〇—五年六月分类号密级ＵＤＣ单位代码顯斋《皮丈＃博±学位论文沙子岭猪和大白猪背最长肌转录组与蛋白组研究ＴｍｎｓｃｒｉｔｏｍｅａｎｄＰｒｏｂｏｍｅＳｔｕｄｏｎｐｙＬｏｎｇｉｓｓｉｍｕｓＤｏｒｓｉＭｕｓｃｌｅＢｅｔｗｅｅｎＳｈａｚｉｌｉｎｇａｎｄＹｏｒｋｓｈｉｒｅＰ

2、ｉｓｇ研究生姓名杨虎指导教师马海明教授学科专业动物遗传育种与繁殖研究方向猪的分子遗传学论义答辩日期２０１５年６月１１日答辩委员会主席王晓清论文评阅人姜运良杨官品陈平王贤纯李加琪二〇—五年六月独创性声明本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的硏究工作及取得的研究成果。尽我所知，除了文中特别加Ｗ标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得湖南农业大学或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料一同工作的同志

3、对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明。与我确的说明并表示了谢意。＇？／：时间研究生签名气枉瓜：＞１＾年少月｜７曰关于论文使用授权的说明本人完全了解源南农业大学有关保留、使用学位论文的规定，目Ｐ：学校有权保留送交论文的复印件和磁盈，允许论文被查阅和借阔，可采用影印、缩印或扫描等复＾制手段保存、汇编学位论文。同意湖南农业大学可以用不同方式在不同媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容，并同意田此产生的收益捐赠给学校教育基金会用于发展爾究生教育。（保密的学位论文在解密后应

4、遵守此协议）一：研究生签名＾时间：年／月／？日：指导师签名时间：年＾月曰心？／Ｘ後摘要摘要，其突出特点是肌肉大理石纹明显沙子吟猪是湖南省优良地方品种，肌内脂肪含－４５３，ＤＦＤ肉ＰＳＥ量可达．５．％，且氨基酸含量高且种类丰富无和肉。本研究Ｗ沙子岭猪和大白猪为研究对象，利用转录组及蛋白组的方法探索不同品种间背最长肌发育的差异表达基因，并分析可能影响肉质形成的分子机制：，主要研究工作如下（１）利用转录组测序技术对２５日龄沙子吟猪和大白猪的背最长肌进行转录姐分析，获

5、得沙子岭猪Ｃｅａｎｒｅａｄｓ２９５２２８４，ｅａｎｒｅａｄｓ３４７１０ｌ条大白猪Ｃｌ９３７条，将这，声，，些Ｃｌｅａｎｒｅａｄｓ进行化ｎｏｎｖｅ拼接后获得７９，３２０条ｕｎｉｇｅｎｅｓ，其中可Ｗ比对到ＮＲ数据２３０５５条．库的有，０７％根据基因表法量发现４８９个显著差异表达基因Ｆｏｌｄ，占巧；（＝２９７Ｃｈａｎｇｅ＞２，其中有个基因在沙子吟猪背最长肌表达显著上调，有１９２个基因表）达显著下调。２－（２）利用ＤＥ电泳技术对沙子岭猪与大白猪背最长肌组织中差异蛋白进行分析，共发现

6、３８个显著差异蛋白点，其中在沙子岭猪表达上调的蛋白点有２７个，大白猪表达－ＴＯＦ－ＴＯＦ上调的蛋白点有１１个；将这些差异蛋白点利用质谱技术ＭＡＬＤＩ／ＭＳ进行鉴定，共得到２３种蛋白对应３６个差异蛋白点，ＧＯ分析显示这些差异蛋白参与猪的生长发育调控、能量代谢、细胞骨架组成等重要过程。（３）Ｔ－ＰＣＲ验证了８个差异表达基ｑＲ因在背最长肌的表达情况，实验结果与转录一２－ＤＥ组及结果基本致，说明研究结果可Ｗ反映沙子岭猪与大白猪背最长肌组织基因的表达情况。（４）根据测序获得的序列，实验利

7、用ＲＡＣＥ技术分别克隆了与代谢相关的基因－及仍的ｃＤＮＡ全长，ＲＴＰＣＲ技术比较并作了生物信息学分析，利用ｑ了这２个基因在沙子岭猪及大白猪的背最长肌、也脏、肝脏、肺脏、脾脏、小肠、盲肠、腿肌、释脏及肤脏共１０种组织的表达谱；同时检测了沙子岭猪基因及巧７＇一ＮＰ－Ａ基因是否存在Ｓ位点，发现在基因的３ＵＴＲ区存在个Ｇ／突变位点。：沙子岭猪转录组关键词；蛋白组；背最长肌差异表达基因；；Ｉ湖南农业大学博－上学位论文ＡｂｓｔｒａｃｔＣｈｉｎａｉｓａｂｕｎｄａｎｔｉｎｂ

8、ｒｅｅｄｒｅｓｏｕｒｃｅｓｏｆａｎｉｍａｌ．Ｓｈａｚｉｌｉｎｇｐｉｇｉｓａｎｅｘｃｅｌｌｅｎｔｎａｔｉｖｅｂｒｅｅｄｉ打ｔｈｅＸｉａｎｇｔａｎｒｅｇｉｏｎｏｆＨｕｎａｎｐｒｏｖｉｎｃｅ．Ｉｔｈａｓｓｏｍｅｐｏｓｉｔｉｖｅｆｅａｔｕｒｅｓ，ｓｕｃｈａｓ〇ｏｂｖ－４５／ｔｒｔｔｉｏｕｓｍａｒｂｌｉ打３．５．〇ｉ打ａｍｕｓｃｕｌａｒｆａｒｉｃｈａｍｉ打０