大熊猫和林麝粪便中细菌和古菌结构组成研究

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2、师彭忠利讲师西南民族大学生命科学与技术学院ｙ＼学位类别农业推广硕壬领域名称ｙ莖遭研究方向反当方向．‘？、、＇、．ｒ、Ｊｆ２０１５６年月＇Ｖ‘‘＇；■■＞‘．？‘一ｒ．？－－－＇，；－．．Ｃｌ过巧Ｎｕｍｂｅｒ．Ｎｕｍｂ：Ｓ８１１６ｅｒ：Ｓ２０１３５８２５ＳｉｃｕａｎＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙＴｈｅｓｉｓｆｏｒＰｒｏｆｅｓｓｉｏｎａｌＭａｓｔｅｒＤｅｒｅｅｇＴｈｅｓｔｕｄｙｏｎｔ

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4、’ＹａａｎＳｉｃｈｕａｎＰｒｏｖｉｎｃｅ，Ｐ．民．Ｃｈｉｎａ６２５０１４，，Ｊｕｎｅ２０１５本研究由四川省科技厅国际合作项目畜禽温室气体排放量检测及减排技术研究（２０１３ＨＨ００４３）资助特致感谢！论文独创性声明本人郑重声明：所呈交的学位论文是我个人在导师指导下进行研巧工作所取得的成果。尽我所知，除了文中特别加Ｗ标注和致谢的地方外，学位论文中木包含其他个人或集体已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得四川农业大学或其它教育机构的学位或证书所使用过的巧料。与我同工作的同志对本研巧所做

5、的巧何贡献均己’在论文中作了明确的说明并表示了谢意。研巧生签名：徐減與｜（年＾月Ｋ日关于论文使用授权的声明、本人完全了解四川农业大学有关保留使用学位论文的规定，即：学校有权保留并向国家有关部口或机构送交论文的复印件和电子版，允许论文被查阅和借阅，可Ｗ采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同意四川农化大学可Ｗ用不同方式在不同媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容。包乐论文不巧密。口本论文保密，在。＿＿年解密后适用本授权＿＂＂（请在Ｗ上□内划Ｖ）？研究生签名２Ｗ年Ａ月／：曰：條

6、値矣ｉ导师签名兴／ｉＴ年Ａ月／（曰四川农並大学２０１５专业硕±学位论文摘要本研究选取５只圈养的健康成年大熊猫和５只健康林齋作为试验动物，收集它们在晨饲前排出的新鲜粪便，利用高通量测序技术对比研究了大熊猫和林虜肠道细菌和古菌的组成。提取大熊猫和林虑粪便中微生物总ＤＮＡ，，Ｗ粪便中微生物总ＤＮＡ为模板选用’’’－－细菌特异性引物对５。Ｆ５ＧＴＧＣＣＡＧＣＭＧＣＣＧＣＧＧＴＡＡ３和８０６Ｒ５－ＧＧＡＣＴＡＧ（）（’’’－ＶＳＧＧＧＴＡＴＣＴＡＡＴ－３－）、古茜特异性引物对Ａ３４９Ｆ（５ＧＹＧＣＡＳＣＡＧＫＣ

7、ＧＭＧＡＡＷ３）’’－－和８０６５ＧＧＡＣＴＡＣＶＳＧＧＧＴＡＴＣＴＡＡＴ３－ＡＲ（３），针对细菌的１６ＳｒＲＮＡ可变区ＶＶ４－区域１６ＳｒＲＮＡＶ４Ｖ５区域分别扩增３００ｂ、５００，、古菌ｐｂｐ左右的片段所得产物用２％琼脂糖凝胶电泳检测后，用ＡｘｙＰｒｅｐＤＮＡ凝胶回收试剂盒切胶回收。将ＰＣＲ产物送上海美吉生物医药科技有限公司和深却巧年盛世基因科技有限公司，用Ｉｌｈｉｍｉｎａ公司的ＭｉＳ巧２５０ＰＥ测序平台和Ｍ设巧３００ＰＥ测序平台进行测序。通过对测序所得的序列进行质控和过滤，再进行ＯＴＵ聚类分析和物种分

8、类学分析。最终得出的结果如下所示；（１）大熊猫和林薦粪便中分别检测出６２１，１口、口细菌其中两种动物粪便中＇共享的细菌有１３猫粪便中优势菌口是变形菌口（Ｐｒｏｔ