半滑舌鳎经济性状的遗传评估及基因组选择初步研究

半滑舌鳎经济性状的遗传评估及基因组选择初步研究

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1、学校代码:10264研究生学号:D120101010上海海洋大学博士学位论文半滑舌鳎经济性状的遗传评估及基题目:因组选择初步研究Geneticevaluationandapreliminary英文题目:genomicselectionresearchofeconomictraitsinCynoglossussemilaevis专业:水产养殖研究方向:海水鱼类遗传育种姓名:刘峰指导教师:陈松林研究员二O一五年六月八日上海海洋大学博士学位论文半滑舌鳎经济性状的遗传分析及基因组选择初步研究摘要半滑舌鳎(Cynoglossussemilaevis)是我国重要的海水养殖鱼类之一

2、,为广大养殖户带来了巨大的经济效益,但是由于近年来市场价格、养殖成活率及产量的下降,养殖户的高成本低产出现状日益严重,使得半滑舌鳎养殖产业受到很大冲击。为了提高养殖产量,培育生长迅速抗病力强的半滑舌鳎新品种具有重大经济意义,将有助于促进半滑舌鳎养殖业的健康稳定发展。本文对半滑舌鳎重要经济性状,包括生长性状和抗病性状,进行遗传分析,并且对基因组选择(GenomicSelection,GS)育种技术在半滑舌鳎良种选育中的应用进行了初步探索,并取得了如下结果:1.为了对半滑舌鳎主要生长性状之间的联系进行研究,分析了12月龄左右半滑舌鳎个体的形态性状,包括全长(totalle

3、ngth,TL)、体高(bodyhigh,BH)、体厚(bodydepth,BD),对体质量(bodyweight,BW)的影响,通过模型拟合筛选获得能够反映雌、雄性个体各形态性状与体质量关系的最佳模型。并对形态性状对体质量的影响进行通径分析。模型拟合结果显示,雌、雄个体全长、体高和体厚与体质量的最优拟合模型均为幂函数曲线模型,雌性个体三个形态性状与体质3.0902.9832.461量的最优模型分别为:y0.004x、y0.382x、y61.912x;雄性个体3.0033.1472.156的三个最优模型公式依次为:y0.005x、y0.300x、

4、y57.681x。通径分析结果显示,雌性个体中体高对体质量的直接影响最大,通径系数为0.535,而雄性个体全长对体质量的直接作用最大,通径系数为0.407。雌、雄个体的三个形态性状对体质量都有极显著的直接作用,其最优多元回归方程:雌性为BW=-88.530+1.297*TL+15.862*BH+39.021*BD;雄性为BW=-71.579+2.587*TL+7.351*BH+35.595*BD。2.为了实现对成鱼期半滑舌鳎重要经济性状的遗传评估,以2010年建立的22个半滑舌鳎全同胞家系(其中正常雄鱼后代家系15个,伪雄鱼后代家系7个)为研究对象,比较分析了570

5、日龄时期正常雄鱼后代与伪雄鱼后代在生长及雌性比例上的差异,并采用REML和BLUP法研究生长相关性状,包括全长(totallength,TL)、体质量(bodyweight,BW)以及体质量平方根(squarerootofbodyweight,SQ_BW),估计目标性状的遗传参数(遗传力和遗传相关),对正常雄鱼和伪雄鱼I上海海洋大学博士学位论文后代家系的育种性能进行评估和比较。结果显示,570日龄时期正常雄鱼后代的3个生长性状均值均显著大于(P<0.05)伪雄后代,并且正常雄鱼后代的雌性比例也显著高于(P<0.05)伪雄鱼后代。三个生长性状均表现为低水平遗传力,依次为

6、:0.128±0.0662、0.128±0.0655、0.132±0.0629。各性状表型值与其育种值之间的相关系数分别为0.516(TL)、0.524(BW)和0.506(SQ_BW)。3个性状之间的遗传相关系数(0.921–0.969)大于其表型相关系数(0.711–0.748),两种相关系数的标准误都较低(遗传:0.063–0.123,表型0.010–0.018)。比较各性状的育种值均值发现,伪雄鱼后代的育种性能低于正常雄鱼后代。由此可以判定,在育种过程中,伪雄鱼及其后代不应该用作亲鱼繁殖后代。3.为了对生长性状进行更加准确的遗传评估,以2014年建立的大规模的

7、半滑舌鳎家系(80个)为研究对象,采用多性状动物模型对半滑舌鳎早期(133日龄)生长性状(包括个体全长、体宽和体质量)进行分析。结果表明三个生长性状都属于中等遗传力(全长为0.210、体宽为0.259、体质量为0.268)。三个性状之间具有很高的遗传相关性,其中体宽和体质量遗传相关性最高,相关系数为0.959,而全长和体宽遗传相关系数最低,为0.913。与遗传相关系数相比,表型相关系数略低,处于0.866–0.899之间,其中,同样是体宽和体质量相关性最高,全长和体宽的最低。各性状的表型值与其育种值都具有较高的极显著相关关系(0.614–0.672)

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