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1、第14卷第2期中国水产科学Vol.14No.22007年3月JournalofFisherySciencesofChinaMarch2007半滑舌鳎DNA的群体遗传变异1,2122231韩志强,庄志猛,高天翔,刘进贤,李玉晖,王志勇,唐启升(11农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室,中国水产科学研究院黄海水产研究所,山东青岛266071;21中国海洋大学教育部海水养殖重点实验室,山东青岛266003;31集美大学水产学院,福建厦门361021)摘要:采用AFLP、RAPD和线粒体细胞色素b基因(Cytb)片段序列分析技术对半滑舌鳎(Cynoglossussemilaevis)群体遗传变
2、异进行研究。分别采用5对选择性引物和18条随机引物对半滑舌鳎3个群体(黄海野生群体、渤海野生群体、养殖群体)进行分析。AFLP和RAPD分析结果表明,黄海群体的遗传多样性高于渤海群体,养殖群体的遗传多样性最低。利用Shannon多样性指数和基因分化系数进行遗传变异来源估算,结果表明,遗传变异主要来自于群体内。同其他鱼类相比,半滑舌鳎群体遗传多样性水平较低。对黄海、渤海野生群体共37个个体的线粒体Cytb基因片段序列进行分析,共检测出5种单倍型,渤海群体内个体序列完全相同,共享单倍型H1;在黄海群体中除检测到单倍型H1外,还检测到其余4种单倍型。Cytb序列分析结果表明,黄海群体遗传多样性较渤
3、海群体丰富,个体间序列变异很小,个体间核苷酸差异数在0～1之间,两群体间无显著遗传差异。通过比较3种分子标记对半滑舌鳎群体间遗传差异的检测和群体间遗传距离的计算,显示AFLP标记对群体间遗传差异的检测最为灵敏,是一种理想的分子标记。[中国水产科学,2007,14(2):192-200]关键词:半滑舌鳎;遗传多样性;AFLP;RAPD;细胞色素b中图分类号:Q9591486文献标识码:A文章编号:1005-8737-(2007)02-0192-09半滑舌鳎(CynoglossussemilaevisGüntuer)属鲽形morphism,AFLP)作为一种新的分子标记技术,兼目(Pleuron
4、ectiformes)、舌鳎科(Cynoglossidae)、舌鳎属有RFLP的可重复性和RAPD的简便性,现已被广(Cynoglossus),俗称鳎目、鳎米、牛舌头。半滑舌鳎泛应用到遗传图谱构建、分子育种、指纹分析及遗传[17]是一种暖水性底层鱼类,在中国沿海均有分布;在黄多样性分析等研究领域。中国应用AFLP技术[1]海和渤海较习见。半滑舌鳎活动范围小、营养等在贝类、对虾等主要无脊椎经济物种上进行了大量[18-22]级低、食性温和,具有个体大、生长快和市场价值高的研究,但在鱼类方面的研究较少,迄今,国[2]等优良性状,是一种理想的增养殖对象。迄今,内仅见关于真鲷、大黄鱼、褐牙鲆、紫红笛鲷
5、等几种[23-27]有关半滑舌鳎的研究主要集中在生长、耗氧量、食海水鱼类遗传多样性的研究报道。线粒体[4-14]性、胚胎发育与繁殖等方面,涉及半滑舌鳎群DNA已成为研究动物起源进化及群体遗传分析理体遗传学方面的研究至今未见报道。随着半滑舌鳎想的研究对象。Cytb为线粒体DNA上的蛋白质人工养殖规模的扩大,有必要对野生半滑舌鳎群体编码基因,其进化速度较快,适合种群水平差异的检[28]和养殖群体的遗传多样性和种质资源状况进行研测,目前对其研究最为广泛。究,从而促进半滑舌鳎的资源保护和人工养殖的可本项目利用AFLP技术、RAPD技术和Cytb持续发展。基因部分序列分析这3种分子标记技术分析了黄随机
6、扩增多态性DNA(Randomamplifiedpoly2海、渤海野生半滑舌鳎群体和人工养殖半滑舌鳎群morphicofDNA,RAPD)具有快速、灵敏、简单等特体内的遗传多样性和群体间的遗传变异,旨在从分点,已被广泛应用于动植物的系统进化研究、种质鉴子水平上探讨黄海与渤海半滑舌鳎群体的遗传多样[15-16]定、遗传多样性检测以及品系鉴定等方面。性及野生群体和养殖群体的遗传差异,为半滑舌鳎扩增片段多态性(AmplifiedFragmentLengthPoly2种质资源的保护和可持续利用、有效地开展半滑舌收稿日期:2006-08-29;修订日期:2006-11-24.基金项目:国家自然科学基金
7、资助项目(30271027);国家“863”计划资助项目(2005AA603110).作者简介:韩志强(1981-),男,博士研究生,研究方向为群体遗传学.通讯作者:庄志猛.E2mail:zhuangzm@ysfri.ac.cn第2期韩志强等:半滑舌鳎DNA的群体遗传变异193鳎遗传育种研究提供理论依据。Doc1000自动成象仪上观察并打印电泳图谱。1材料与方法表1AFLP分析所用的接头、预扩增、选择性扩增引
