一株cobetia sp.引起的坛紫菜绿烂病病原菌的鉴定及全基因组测序

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1、寸觀各？作々鑛－ＳｏａａｎＵＮＩＴＹＦＣＩＶＥＲＯＨＩＮＡ硕±学位论文ＴＡＴＩＯＮＭＡＳＴＥ民ＤＩＳＳＥＲ一株ｓｐ．引起的坛紫菜绿搭病病原菌的论文题目：备定及全基因组测序ＩｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎａｎｄＣｏｍｐｌｅｔｅＧｅｎｏｍｅｕｅｎｃｏｆａｏｂｅｔｉａｓ．ｃａｕｓｉｎｒｅｅｎｒｏｔＳｅｉｎｇＣｐｇｇｑ英文题目：ｄｉ巧３化ｉｎ作者：韩晓娟指导教师：茅远翔教授学位类别：全日制学术学位专业名称：海洋生物学：海洋生物

2、逸传学研究方向＇－株０瓜＂ｓ（／ｐ．引起的紫菜绿片柄祸扳曲的撫也及全巧Ｗ组测谨レ：Ｕｔ论女献给我的导师、家人及所有关心和帮助过我的老师和朋友韩晓娟Ｉ－株仿ｓｐ．引起的坛紫菜绿烂病病原菌的鉴定及全基因组测定￣６；学位论文完成日期：］方指导教师签字答辩委员会成员签字：＾＾６Ｊ７７Ｖ＼ｙ＊—独创声明本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。据我所知，除了文中特别加Ｗ标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人己经发表或撰写过的研究成

3、果，也不包含未获得（注，本栏可空）或其他教育机构的学位或证书使＝如没有其他需要特别声明的用过的材料一。与我同工作的同志对本研究所做的任何贡献均己在论文中作了明确的说明并表示谢意。■：為１学位论文作者签名签字日期？５年６月日Ｉ！学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解学校有关保留，、使用学位论文的规定并同意Ｗ下事项：１，、学校有权保留并向国家有关部口或机构送交论文的复印件和磁盘允许论文被查阅和借阅。２、学校可将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可Ｗ采用＂影印－

4、、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同时授权清华大学中国学＂术期刊（光盘版）电子杂志社用于出版和编入ＣＮＫＩ《中国知识资源总库》，授权中国科学技术信息研究所将本学位论文收录到《中国学位论文全文数据库》。（保密的学位论文在解密后适用本授权书）学位论文作者签名：导师签￣签字日期＞巧：巧丰６月日签字日期日１：＞年＜月Ｉ一株口ｓｐ．引起的紫莱绿烂病病原菌的鉴定及全基凶组测阵－株ＣｏＡｅｔ／ａＳＰ．引起的垃紫菜绿烂病病原菌的鉴定及全基因组测序摘要坛紫菜（／ｙｒｏｐＺａ／？〇化ｗｅ

5、ｎｓｋ）是中国独有的紫菜品种，在沿海的潮间带区，具有独有的适应环境胁迫体系，域生活。近年来紫菜养殖业的栽培规模持续增长，紫菜己成为重要的经济藻类，同时也遭受着各种各样的病害威胁。本文＇一对引起坛紫菜绿烂病的株贝特氏菌（ＣｏＡＷｆｌｓｐ．）ＸＩ进行了分离鉴定和致病’一，性研巧，ＸＣ）６／．Ｘ将］鉴定为新种紫菜贝特氏菌ｃｅ／ａ巧ｒａｐ／口ｅｓｐｎｏｖ．，并进行了Ｉ的全基因组测序，为紫菜病害流行病学及疾病防治提供了基础数据。１．紫菜绿烂病病原分离鉴定和致病性研巧：从福建省蒂田养殖海区患绿烂病坛一ＸＩ

6、紫菜叶状体分离得到株优势细菌，人工回接感染实验和组织病理检测？，引起绿控病Ｉ，０．９显示该菌株能感染坛紫菜。Ｘ为革兰氏阴性菌大小为１ｍＸ〇．ｍ．５ｎ４ｎ，根据１６ＳｒＲＮＡ基因序列分析结果将ＸＩ鉴定为贝特氏菌４８？（ＣｏＡｗｗｓｐ．）。Ｗ浓度为１〇ｌ〇ｄＷｍｌ的ＸＩ菌悬液感染坛紫菜，在７天内？３．８％１００％的病斑面，，病程的发展越快引起紫菜出现１积感染浓度越高。’°？？？２．紫菜贝特氏菌ＸＩ的鉴定：ＸＩ能在温度４Ｃ３７Ｃ、盐度５２０％、押６１０范‘？围内生长，３２Ｃ、１０％Ｈ７．５８５最适生长温度为最

7、适生长盐度为、最适ｐ为．；ＸＩ在明胶酶、淀粉酶、酪蛋白酶、Ｔｗｅｅｎ４０、Ｔｗｅｅｎ８０反应为阴性，Ｔｗｅｅｎ２０－－－阳性１８；对种常见抗生素敏感ａ。在脂酶、葡萄糖昔酶、ａ半乳糖昔酶、Ｐ／半乳糖昔酶的反应呈阳性；主耍脂肪酸含量为：Ｃ１６：ｌｗ７ｃ１６：ｌ－ｗ６ｃ３２－．９２％，Ｃ１６．０（１９１８％），Ｃ１２０３ＯＨ（１６．０４％），Ｃ１８ｌｗ７／１８ｌ（）．：：ｃ：．８３％Ｃ１２０８．１８％Ｃ１７０ｃｌ７８６％ｗ６ｃ巧），：，：ｃｏ．。上（）ｙ（）述特征与贝特氏菌属的其他细菌有较明思

8、的不同。在１６ＳｒＲＮＡ上ＸＩ与Ｃ口较接近，生理生化特征上有较多的差异，且两者ＤＮＡ杂交结巧为３３．７８％，因此ＸＩ可鉴定为新种，定名为紫菜贝特氏菌ｎｏｖ．．３．紫菜贝特氏菌Ｘ１的全基因组测序：本研究利用＾代测序平台进行了ＸＩ菌株的全基因姐序列测定一。得到个