一株寄生于金凤蝶的微孢子虫的鉴定及其基因组研究

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1、单位代码………壓学号０１丽權誦０２０處旅大聲博±学位论文－株寄生于金凤蝶的微抱子虫的鉴定及其基因组硏究论文作者：刘铁指导教师：周泽扬教授学科专业：特种经济动物饲养研究方向：基因组提交论文日期；２０１５年４月１０日论文答辩日期：２０１５年６月７日学位授予单位：西南大学中国？重庆２０１５年４月西南大学二零一五届博±学位论文一株寄生于金凤蝶的微拖子虫的鉴定及其基因组研巧学科专业：特种经济动物饲养研究方向：基因组指导教师：周泽扬教授博±研究生：刘铁中国？重庆２０１５年

2、４月，ＤｉｓｓｅｒｔａｔｉｏｎｆｏｒＤｏｃｔｏｒｓＤｅｇｒｅｅｏｆＳｏｕｔｈｗｅｓｔＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙＩｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎａｎｄｅｎｏｍｉｃａｎａｌｓｅｓｏｆａｇｙｍｉｃｒｏｓｏｒｉｄｉａｉｓｏｌａｔｅｆｒｏｍ戶幻如ｍａｃＡ。。巧ｐＬｉｎｎａｅｕｓＭａｏｒ：ＲａｉｓｉｎｏｆＳｅｃｉａｌｅｃｏｎｏｍｉｃａｎｉｍａｌｊｇｐＦｉｅｌｄ：ＧｅｎｏｍｅｓＳｕｅｒｖｉｓｏｒ：ＺｅａｎＺｈｏｕｐｙｇＰｈ．Ｄ．Ｃａｎｄｉｄａｔｅ：ＴｒｉｅＬｉｕＣｈｏ打？ｉｎＰ．民．Ｃｈｉｎａ

3、ｇｑｇＡｒｉｌ２０１５ｐ，独创性声明学位论文题目－；媒寄生于念凤蝶的微拖子虫的雜定及其基因组研究本人提交的学位论文是在导师指导下进行的研究工作及取得的研。论文中引用他人已经发表或出版过的研究成果究成果，文中己加了特别标注。对本研究及学位论文撰写曾做出贡献的老师、朋友、同仁在文中作了明确说明并表示衷也感谢。■学短论文作者Ｗｉ５／Ｕ曰：刮緣．签字日期；年月学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解西南大学有关保留、使用学位论文的规定，有权保留并向国家有关部口或机构送交论文的复印件和磁盘，允许论文被查阅和借阅。

4、本人授权西南大学研究生院（筹）可将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。（保密的学位论文在解密后适用本授权书，本论文：□不保密，□保密期限至年月止）。学位论文作者签名；叫終导师签名：＂之＾ｉ签字日期：巧皮年月／日签字日期；年月Ａ曰Ｉ目录目录摘要ＩＡＢＳＴＲＡＣＴＶ一第章文献综述１１．１微抱子虫的生物学特征１１２微２．袍子虫的分类１．３微抱子虫的多样性４１．３．１微抱子虫的物种多样性４１２．３．微跑子

5、虫的遗传多样性７１．４微抱子虫基因组结构１０１．５基因重复的研究．．．．１２１．６转座子研究班展１４第二章引言１９２．１１９研究目的及意义２．２主要研究内容２０２．３研究技术路线２１第Ｈ章寄生金凤蝶的微抱子虫的分离及鉴定２３３．１材料与方法２３３丄１实验材料２３３丄２主要试剂与仪器２３３丄３实验方法２５３．２结果与分析２８３．２．１金凤蝶感染微抱子虫的病理学特征２８３．２．２病原微抱子虫的分子鉴定及系统分类学分析３０３．２．３病原微拖子虫的形态结构３

6、２３．２．４金凤蝶病原微抱子虫对家蚕的感染性分析３５３．３结论与讨论３５第四章Ｗｏｓｅｗａ－巧．ＰＭ１基因组测序及注释分析３７４．１材料与方法巧４丄１材料３７４丄２方法３７４．２结果与分析糾４扣．２．１基因组测序与组装西南大学博±学位论文４．２．２基因预测３８４．２．３基因注释分析４０４．３结论与讨论４７ｏｓ－■５１第五章ｉＶｅｗｆｌｗ．ＰＭ１基因家族与基因组结构分析５．１材料与方法５１５丄１材料５１５丄２同源基因预测５１５丄３基因组重复预测５１５

7、丄４共线性预测５２５．２结果与分析５２５－．２．１ＴＶｏｓｅ脂取ＰＭ１基因家族分析５２－５．２．２ｉＶａｓｅｍｆｌ［ＰＭ１与家蚕微抱子虫的部分重要基因分析５７－ＰＭ１与家蚕微抱子虫的差异基因分析巧－５．６０．２４ＪＶｏｓｅｍａＰＭ１基因组重复分析＇４ＰＭ－１５．２．Ｗｏｓｅｗｉ幻共线性分析６３５．３结论与讨论１１第六章ＰＭ－１基因组转座元件分析７７６．１材料与方法７７６丄１材料７７－６丄ＰＭ１转座子预测７７６．２结果与分析７８６ｗｅ说口ＰＭ－．２．１Ｍ１转座元件

8、的分类７８－６２．２ｉＶｏ旅ｍａ