骨骼肌相关mirna的鉴定及功能分析

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1、分类号密级UDC编号中国农业科学院博±后研究工作报告骨骼肌相关miRNA的鉴定及功能分析侯欣华工作完成日期2015年9月报告提交日期2015年9月中国农业科学院北京畜牧兽医研究所一';乂二二0,V五年九月—y4:.-.骨骼肌相关miRNA的鉴定及功能分析IdentificationandFunctionAnalsisofSkeletalMuscle民elatedymiRNA博±后姓名侯欣华合作导师李

2、奎教授流动站一(级学科)名称畜牧学专业(二级学科)名称动物遗传育种与繁殖研究工作起始时间2013年4月研究工作期满时间2015年9月中国农业科学院(北京)二0—五年九月独创性声明本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。尽我所知,除了文中特别加W禄注和致谢的地方外,论文中不包含其他人己经发表或撰写过的研究成果,也不包含为获得中国农业科学院或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料一同工作的同志对本研究所做的任。与我何贡献均已在论

3、文中作了明确的说明并表示了谢意。博±后签名:时间;5_DS年0月>曰欢||橡华^关于论文使用授权的声明本人完全了解中国农业科学院有关保留、使用学位论文的规定,即:中国农业科学院有权保留送交论文的复印件和磁盘,允许论文被査阅和借阅,可W采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同意中国农业科学院可W用不同方式在不同媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容。博±后签名:、i时间:八年月曰砍於IS呼^f合作导师签名:时间;月曰^摘要microRNA(m

4、iRNA)对于哺孰动物骨骼肌的发育及表型差异具有重要的调控作化它。可&在转录后水平,通过阻止捆译或降解mRNA来挪制基因的表达为了了解决定猪骨骼(脂肪型肌不同表型的分子机制,利用高通量测序技术,针对长白猪(瘦肉型)、通城猪)W及五指山猪(小型猪)H个不同猪种解析其miRNA的表达特征。在长白与通城猪的比较組中,共得到106个差异表达miRNA;在通城及五指山猪的比较組中,共得到151个差异iRNA,表法m;在长白与五指山猪的比较组中共得到个差异表达miRNA。通过视标预RNAmR

5、NA测,并结合已有差异表达mRNA数据,将差异mi与差异进行整合分析,W阐mRNA。述差异i及相关基因决定肉质性状多样性的分子化制此外,为了研究骨骼肌发育的分子调控机制,利用高通量测序技术,鉴定并比较分析了出生后0天及成年小鼠骨骼肌miRNA。共得到422个(出生后0天)及336个(成年)已知miRNA1〇>1、^0.05miRNAiRNA。针对差异表。选取狂p的作为两时期差异表达m达miRNA,结合已有两时期小鼠骨骼肌转录组数据及祀标预测结果,得到648及892个祀标基因可被差

6、异上调及下调的高丰度miRNA所调控。GO分析的结果表明,候选祀标基因参与细胞周期、觀着、增殖、肌肉发育、血管发育、细胞外基质、Wnt信号通路、p53信号通路、mTOR信号通路W及VEGF信号通路等生物学过程和信号通路。将与骨骼肌发育及功能相关的生物学过程,结合差异表达miRNA及候选祀标基因绘制网络互作图,解析miRNA调控骨骼肌发育的分子机制。本研究为m,iRNA对于猪肉质性状与骨骼肌发育的分子调控"发相关肉质及生长发育的分子标记鉴定提供了重要参考。关键词:iRNASol

7、exam:测序;骨骼肌;肉质性化发育ABSTRACTmicroRNAsmiRNAscontributetothedevelopmentandhenoticvarianceofskeletal()pypmuscleinmammalsandregulategeneexpressionbyinhibitingtranslationordegradingmRNA.Tounderstand化emolecularmechanismsoforci

8、neskeletalmusclephenotes,wecarriedoutpypmiRNAprofilingofskeletalmusclebySolexasequencingofthree出ferentbreeds,Landrace---eantypeToe打gobesetandWuzhihanminiteis.Atotl106diferential"),ngch(ype)

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